<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:verdana, helvetica, sans-serif;font-size:13px"><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4547" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4549" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4551" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4553" class="">Dear Users,</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4555" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4557" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4559" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4561" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4563" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4565" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4567" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4569" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4571" class="">Good day!</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4573" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4575" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4577" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4579" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4581" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4583" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4585" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4587" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#212121" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4589" class="">I am trying to&nbsp;use WRF (Weather Research and Forecasting) model for my PhD research project. Already I compiled WRF (3.6.1) model on a High Performance Computer (HPC). Actually, I am facing the problem related to submit a job using PBS script.&nbsp;</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4591" class="">Alternate way</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#212121" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4593" class="">, I also tried to run the job from TERMINAL window.&nbsp;</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#212121" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4595" class="">&nbsp;I am giving you the details as follows:</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4597" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4599" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4601" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4603" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4605" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4607" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4609" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4611" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#212121" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4613" class="">(1). In the TERMINAl window&nbsp;</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="red" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4615" class="">(from WRF run directory)</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#212121" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4617" class="">, first I load the module and run the command as follows:</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4619" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4621" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4623" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4625" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4627" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4629" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4631" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4633" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4635" class="">module load intel/2013.1</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4637" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4639" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4641" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4643" class="">module load openmpi-intel/1.5.5</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4645" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4647" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4649" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4651" class="">mpiexec -n 24 &nbsp;real.exe</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4653" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4655" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4657" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4659" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4661" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4663" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4665" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4667" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4669" class="">Using the command in the TERMINAl, my model successfully ran and I got the output files. Two times I got success using above command.</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4671" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4673" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4675" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4677" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4679" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4681" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4683" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4685" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4687" class="">(2) After a day, again&nbsp;I login into&nbsp;the HPC and I have used same command above. Now this time, it is showing the problem as follows:</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4689" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4691" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4693" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4695" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4697" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4699" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4701" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4703" class=""><font face="wf_segoe-ui_normal,Segoe UI,Segoe WP,Tahoma,Arial,sans-serif" size="1" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4705" class=""><span style="font-size: 13.29px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4707" class="">mpiexec_edward: cannot connect to local mpd (/tmp/mpd2.console_s4504842); possible causes:</span></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4709" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4711" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4713" class=""><font face="wf_segoe-ui_normal,Segoe UI,Segoe WP,Tahoma,Arial,sans-serif" size="1" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4715" class=""><span style="font-size: 13.29px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4717" class="">&nbsp; 1. no mpd is running on this host</span></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4719" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4721" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4723" class=""><font face="wf_segoe-ui_normal,Segoe UI,Segoe WP,Tahoma,Arial,sans-serif" size="1" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4725" class=""><span style="font-size: 13.29px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4727" class="">&nbsp; 2. an mpd is running but was started without a "console" (-n option)</span></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4729" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4731" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4733" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4735" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4737" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4739" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4741" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4743" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4745" class="">(3) Furthermore, I write a PBS script as follows and submit the job.</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4747" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4749" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4751" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4753" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4755" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4757" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4759" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4761" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4763" class="">#!/bin/bash</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4765" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4767" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4769" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4771" class="">#PBS -N wrf_real</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4773" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4775" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4777" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4779" class="">#PBS -q fast</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4781" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4783" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4785" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4787" class="">#PBS -l nodes=2:ppn=7</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4789" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4791" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4793" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4795" class="">#PBS -l pmem=2000mb</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4797" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4799" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4801" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4803" class="">#PBS -l walltime=00:30:00</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4805" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4807" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4809" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4811" class="">#PBS -j eo</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4813" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4815" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4817" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4819" class="">#PBS -M md.hosen@live.vu.edu.au</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4821" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4823" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4825" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4827" class="">#PBS -m abe</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4829" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4831" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4833" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4835" class="">cd $PBS_O_WORKDIR</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4837" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4839" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4841" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4843" class="">module load intel/2013.1</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4845" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4847" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4849" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4851" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4853" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4855" class="">module load openmpi-intel/1.5.5</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4857" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4859" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4861" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4863" class="">mpiexec -n 14 real.exe</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4865" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4867" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4869" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4871" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4873" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4875" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4877" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4879" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4881" class="">After submitting a&nbsp;job, again I got same error message:&nbsp;</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4883" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4885" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4887" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4889" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4891" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4893" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4895" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4897" class=""><font face="wf_segoe-ui_normal,Segoe UI,Segoe WP,Tahoma,Arial,sans-serif" size="1" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4899" class=""><span style="font-size: 13.29px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4901" class="">mpiexec_edward: cannot connect to local mpd (/tmp/mpd2.console_s4504842); possible causes:</span></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4903" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4905" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4907" class=""><font face="wf_segoe-ui_normal,Segoe UI,Segoe WP,Tahoma,Arial,sans-serif" size="1" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4909" class=""><span style="font-size: 13.29px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4911" class="">&nbsp; 1. no mpd is running on this host</span></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4913" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4915" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4917" class=""><font face="wf_segoe-ui_normal,Segoe UI,Segoe WP,Tahoma,Arial,sans-serif" size="1" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4919" class=""><span style="font-size: 13.29px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4921" class="">&nbsp; 2. an mpd is running but was started without a "console" (-n option)</span></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4923" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4925" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4927" class=""><font face="wf_segoe-ui_normal,Segoe UI,Segoe WP,Tahoma,Arial,sans-serif" size="1" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4929" class=""><span style="font-size: 13.29px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4931" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4933" class=""></span></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4935" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4937" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4939" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#212121" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4941" class="">(4) Finally, I have tried to re-compile</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="red" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4943" class="">&nbsp;latest</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#212121" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4945" class="">&nbsp;WRF (3.7)&nbsp; model using the same&nbsp;</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4947" class="">.bashrc</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#212121" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4949" class="">&nbsp;file which has&nbsp;used for compilation of previous version of WRF model. Now I am getting the&nbsp;following two types&nbsp;error message:</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4951" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4953" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4955" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4957" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4959" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4961" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4963" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4965" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4967" class="">(a)&nbsp;testing for MPI_Comm_f2c and MPI_Comm_c2f &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4969" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4971" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4973" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4975" class="">&nbsp; &nbsp; &nbsp;MPI_Comm_f2c and MPI_Comm_c2f are not supported &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4977" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4979" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4981" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4983" class="">&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;testing for MPI_Init_thread &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4985" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4987" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4989" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4991" class="">&nbsp; &nbsp;&nbsp;MPI_Init_thread is not supported &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4993" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4995" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4997" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4999" class="">&nbsp; &nbsp;&nbsp;testing for fseeko and fseeko64 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5001" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5003" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5005" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5007" class="">&nbsp; &nbsp;&nbsp;neither fseeko64 nor fseeko with 64 bit offsets works, landread will be compiled with fseek &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5009" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5011" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5013" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5015" class="">&nbsp; &nbsp;&nbsp;but may not work correctly for very high resolution terrain datasets&nbsp;</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5017" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5019" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5021" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5023" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5025" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5027" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5029" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5031" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5033" class="">(b)&nbsp;Testing for NetCDF, C and Fortran compiler</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5035" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5037" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5039" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5041" class="">&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;One of compilers testing failed!</font><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5043" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5045" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5047" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5049" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5051" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5053" class="">&nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;Please check your compiler</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5055" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5057" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5059" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5061" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5063" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5065" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5067" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5069" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" color="#D05C12" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5071" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5073" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5075" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5077" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5079" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5081" class="">I have searched in online for the solution but still not getting any good solution.</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5083" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5085" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5087" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5089" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5091" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5093" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5095" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5097" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5099" class="">Please find below for .bashrc file for detail information.</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5101" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5103" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5105" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5107" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5109" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_4545" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5112" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5114" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5116" class=""># .bashrc</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5118" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5120" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5122" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5124" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5126" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5128" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5130" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5132" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5134" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5136" class=""># Source global definitions</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5138" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5140" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5142" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5144" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5146" class="">if [ -f /etc/bashrc ]; then</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5148" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5150" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5152" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5154" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5156" class="">. /etc/bashrc</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5158" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5160" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5162" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5164" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5166" class="">fi</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5168" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5170" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5172" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5174" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5176" class="">source /etc/profile.d/modules.sh</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5178" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5180" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5182" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5184" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5186" class="">module load intel/2013.1</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5188" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5190" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5192" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5194" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5196" class="">module load openmpi-intel/1.5.5</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5198" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5200" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5202" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5204" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5206" class="">module load netcdf/4.0.0-intel</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5208" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5210" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5212" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5214" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5216" class="">module load netcdf-fortran/4.2-intel</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5218" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5220" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5222" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5224" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5226" class="">export NETCDF=/usr/local/netcdf/4.0.0-intel</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5228" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5230" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5232" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5234" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5236" class="">export NETCDF_FORTRAN=/usr/local/netcdf-fortran/4.2-intel</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5238" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5240" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5242" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5244" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5246" class="">export DM_FC=mpiifort</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5248" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5250" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5252" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5254" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5256" class="">export DM_CC=mpiicc</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5258" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5260" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5262" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5264" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5266" class="">source /usr/local/intel/2013.1/bin/iccvars.sh intel64</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5268" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5270" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5272" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5274" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5276" class="">source /usr/local/intel/2013.1/bin/ifortvars.sh intel64</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5278" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5280" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5282" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5284" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5286" class="">export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5288" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5290" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5292" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5294" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5296" class="">export WRF_EM_CORE=1</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5298" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5300" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5302" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5304" class=""><i id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5306" class="">export NETCDF4=0</i></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5308" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5310" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5312" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5314" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5316" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5318" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5320" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5322" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5324" class="">Could you please give any suggestion&nbsp;to solve the problems.</font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5326" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5328" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5330" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5332" class=""><br id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5334" class=""></font></span></font></div><div style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5336" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="3" color="black" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5338" class=""><span style="font-size: 12pt;" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5340" class=""><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5342" class="">Kind regards,</font></span></font></div><div id="x_Signature" class=""><div style="margin: 0px;" dir="ltr" id="yui_3_16_0_1_1436238775654_5345" class=""><font color="#009900" face="arial black, sans-serif" size="2"><b>Ahmed</b></font></div></div></div></body></html>