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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Try to reduce the time step (say, to 100s), and see what happen.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> wrf-users-bounces@ucar.edu [mailto:wrf-users-bounces@ucar.edu]
<b>On Behalf Of </b>Jagabandhu Panda<br>
<b>Sent:</b> Saturday, September 14, 2013 7:46 AM<br>
<b>To:</b> wrfhelp; wrf-users@ucar.edu<br>
<b>Subject:</b> [Wrf-users] model stops running after few minutes<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Hello<o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> I am trying to run the model for a nested configuration. However, my model stops running after few minutes!!! I found this to be present in all the three versions i. e. v3.3.1, v3.4.1 and v3.5. I think, I am doing something wrong.
Please suggest something to overcome the issue. My namelist options are as follows:<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">---------------------------------------------------------------------------------------------------------<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &time_control<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> run_days = 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> run_hours = 84,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> run_minutes = 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> run_seconds = 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> start_year = 2013, 2013, 2013, 2013,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> start_month = 06, 06, 06, 06,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> start_day = 14, 14, 14, 14,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> start_hour = 12, 12, 12, 12,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> start_minute = 00, 00, 00, 00,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> start_second = 00, 00, 00, 00,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> end_year = 2013, 2013, 2013, 2013,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> end_month = 06, 06, 06, 06,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> end_day = 18, 18, 18, 18,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> end_hour = 00, 00, 00, 00,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> end_minute = 00, 00, 00, 00,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> end_second = 00, 00, 00, 00,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> interval_seconds = 21600<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> input_from_file = .true.,.true.,.true.,.true.,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> history_interval = 180, 180, 60, 60,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> frames_per_outfile = 1000, 1000, 1000, 1000,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> restart = .false.,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> restart_interval = 5000,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> io_form_history = 2,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> io_form_restart = 2,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> io_form_input = 2,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> io_form_boundary = 2,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> debug_level = 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> /<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &domains<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> time_step = 120,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> time_step_fract_num = 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> time_step_fract_den = 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> max_dom = 4,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> e_we = 131, 271, 472, 322,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> e_sn = 131, 262, 421, 313,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> e_vert = 38, 38, 38, 38,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> p_top_requested = 5000,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> num_metgrid_levels = 27,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> num_metgrid_soil_levels = 4,<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> dx = 27000, 9000, 3000, 1000,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> dy = 27000, 9000, 3000, 1000,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> grid_id = 1, 2, 3, 4,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> parent_id = 0, 1, 2, 3,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> i_parent_start = 1, 25, 51, 171,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> j_parent_start = 1, 25, 41, 185,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> parent_grid_ratio = 1, 3, 3, 3,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> parent_time_step_ratio = 1, 3, 4, 5,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> feedback = 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> smooth_option = 0<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> smooth_cg_topo = .true.,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> eta_levels = 1.000, 0.9940, 0.9920, 0.9900, 0.9875, 0.985, 0.982, 0.978, 0.973, 0.967, 0.959, 0.951, 0.941, 0.927, 0.908, 0.886, 0.860, 0.830, 0.795, 0.755, 0.715, 0.675, 0.635, 0.595, 0.555, 0.515, 0.475, 0.435,
0.395, 0.355, 0.315, 0.275, 0.235, 0.195, 0.155, 0.110, 0.060, 0.000,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> /<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &physics<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> mp_physics = 1, 1, 1, 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> ra_lw_physics = 1, 1, 1, 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> ra_sw_physics = 1, 1, 1, 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> radt = 30, 30, 30, 30,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> sf_sfclay_physics = 1, 1, 1, 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> sf_surface_physics = 2, 2, 2, 2,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> bl_pbl_physics = 1, 1, 1, 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> bldt = 0, 0, 0, 0,<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> cu_physics = 1, 1, 0, 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> cudt = 5, 5, 5, 5,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> isfflx = 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> ifsnow = 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> icloud = 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> surface_input_source = 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> num_soil_layers = 4,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> sf_urban_physics = 0, 0, 0, 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> num_land_cat = 20,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> /<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &fdda<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> /<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &dynamics<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> w_damping = 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> rk_ord = 3,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> diff_opt = 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> km_opt = 4,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> diff_6th_opt = 0, 0, 0, 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> diff_6th_factor = 0.12, 0.12, 0.12, 0.12,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> base_temp = 290.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> damp_opt = 0,<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> zdamp = 5000., 5000., 5000., 5000.,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> dampcoef = 0.2, 0.2, 0.2 0.2,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> khdif = 0, 0, 0, 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> kvdif = 0, 0, 0, 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> non_hydrostatic = .true., .true., .true., .true.,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> moist_adv_opt = 1, 1, 1, 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> scalar_adv_opt = 1, 1, 1, 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> epssm = 0.5, 0.5, 0.5, 0.5,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> /<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &bdy_control<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> spec_bdy_width = 5,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> spec_zone = 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> relax_zone = 4,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> specified = .true., .false.,.false.,.false.,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> nested = .false., .true., .true., .true.,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> /<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &grib2<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> /<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &namelist_quilt<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> nio_tasks_per_group = 0,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> nio_groups = 1,<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> /<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">----------------------------------------------------------------------------------------------------------<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Please note that I am using PGI compiler with gcc for compiling the model using dm+sm in open mpi linux x86_64 environment. I am not able to understand the exact problem. It looks like a run time issue. I feel I am not taking some namelist
option in appropriate manner. However, I am not able to solve this. <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> Initially I tried with Milbrand MP but the model just stopped running after 1-2 mins. When I changed to Kesler MP, it ran for some time and then aborted. Again, after I changed the radt value from 20 to 30 mins it was running for some
time more but again stopped on the way!<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Please suggest something if possible.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Best regards<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">-- Jagabandhu<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">####################################################################<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Dr. Jagabandhu Panda, PhD<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Research Center for Environmental Changes, Academia Sinica<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Time New Roman","serif";color:black">No. 128, Sec. 2, Academia Rd., Nankang District, Taipei</span><o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Ph: +886-978655040 (M) / +886 - 2 - 26513171 (R)<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Email: <a href="mailto:jpanda@ntu.edu.sg" target="_blank">jpanda@ntu.edu.sg</a>,
<a href="mailto:jagabandhu@gate.sinica.edu.tw" target="_blank">jagabandhu@gate.sinica.edu.tw</a> <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Personal Web Page: <a href="http://jagabandhupanda.wordpress.com/" target="_blank">
http://jagabandhupanda.wordpress.com/</a><o:p></o:p></p>
</div>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">####################################################################<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>