<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii"><meta name=Generator content="Microsoft Word 14 (filtered medium)"><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
p.MsoListParagraph, li.MsoListParagraph, div.MsoListParagraph
        {mso-style-priority:34;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:.5in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=EN-US link=blue vlink=purple><div class=WordSection1><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Sounds like you have 2 issues:<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>1. OBSGRID.EXE is not writing output at the times you want<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>2. WRF-Chem is bombing when nudging<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>I posted a bit on problem 1 &#8211; I was misinterpreting the DOCs (or the DOCs are misleading, depending on your viewpoint).&nbsp; See <a href="http://mailman.ucar.edu/pipermail/wrf-users/2011/002424.html">http://mailman.ucar.edu/pipermail/wrf-users/2011/002424.html</a>.&nbsp; <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Basically, set &amp;share::interval_seconds to match your &nbsp;input GRIB data interval (must match the interval you ran METGRID.EXE with).&nbsp; This is 21600 if your GRIB files come every 6 hours. <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>Then make sure your little_r format files contain data every &amp;record7::intf4d (from your email, it looks sorta like you want to nudge every 3 hours).&nbsp; The main point is that OBSGRID.EXE will look for a new file every intf4d seconds, and will not look in a file that&#8217;s already been opened (from a previous interval).<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>I&#8217;m nearly certain that you must combine both your surface and upper-air data into the same file, but that&#8217;s pretty easy &#8211; you can just &#8220;cat&#8221; them together.&nbsp; <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'>I suggest you fix problem 1 first, so you have non-empty OBS_DOMAIN1?? files for the in-between hours, before addressing the bombing of WRF.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=FR style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#003366'>Bart Brashers<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><div style='border:none;border-left:solid blue 1.5pt;padding:0in 0in 0in 4.0pt'><div><div style='border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in'><p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'> wrf-users-bounces@ucar.edu [mailto:wrf-users-bounces@ucar.edu] <b>On Behalf Of </b>Chris Klich<br><b>Sent:</b> Sunday, October 30, 2011 12:31 PM<br><b>To:</b> wrf-users@ucar.edu<br><b>Subject:</b> [Wrf-users] Help with Obs Nudging Crash<o:p></o:p></span></p></div></div><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'>Hi all, I have recently been trying to use obs-nudging with my WRF run.&nbsp; I am currently running WRF-Chem version 3.2.1 due to a long-term project and unable to upgrade to 3.3.<br><br>I currently have both upper air and surface data in little-r format (separate however).&nbsp; I convert these files into the proper naming format for OBSGRID, run obsgrid and move the files to the /run directory, concatenate all the OBS_DOMAIN files into OBS_DOMAIN101, and then run real.exe and wrf.exe.&nbsp; However, when OBSGRID runs, the output files are every 3 hours, while my met_em files and observation files are every 6.&nbsp; These 3 hour intermediate times (3, 9, 15, 21) are empty when the OBS_DOMAIN and plotobs and qc files are outputted, while the normal intervals of 0, 6, 12, 18 are several megabytes.&nbsp; Even in this case, I had tried concatenating all files to OBS_DOMAIN101 and running WRF.&nbsp; However, it seems the entire run finishes only when I use just upper air data specifically.&nbsp; When I run using just surface obs or concatenating surface to upper air, the run crashes, and it seems at a very random time.&nbsp; When using just surface it crashed after about 12:49 into the run, while running with the concatenated upper air/surface, it crashed after about 3 days, 12:49.&nbsp; I can't seem to figure out what is causing this.&nbsp; The end of my rsl.error.0000 file looks like:<br><br>Timing for main (dt=135.00): time 2008-05-20_12:45:13 on domain&nbsp;&nbsp; 1:&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.08750 elapsed seconds.<br>Timing for main (dt=135.00): time 2008-05-20_12:47:28 on domain&nbsp;&nbsp; 1:&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.05240 elapsed seconds.<br>&nbsp;OBS NUDGING: Reading new obs for time window TBACK =&nbsp;&nbsp; 12.125 TFORWD =&nbsp;&nbsp; 13.458<br>&nbsp; for grid =&nbsp; 1<br>&nbsp;OBS NUDGING:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1 previously read obs are now too old for the current window a<br>&nbsp;nd have been removed.<br>&nbsp;****** CALL IN4DOB AT KTAU =&nbsp;&nbsp; 326 AND XTIME =&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 767.48:&nbsp; NSTA =&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 43 ****<br>&nbsp;**<br>&nbsp;++++++CALL ERROB AT KTAU =&nbsp;&nbsp; 326 AND INEST =&nbsp; 1:&nbsp; NSTA =&nbsp;&nbsp;&nbsp; 43 ++++++<br>&nbsp; OBS NUDGING FOR IN,J,KTAU,XTIME,IVAR,IPL:&nbsp; 1 10&nbsp;&nbsp; 326&nbsp;&nbsp; 767.48&nbsp; 3&nbsp; 3 rindx= 5.<br>&nbsp;3<br>&nbsp; OBS NUDGING FOR IN,J,KTAU,XTIME,IVAR,IPL:&nbsp; 1 10&nbsp;&nbsp; 326&nbsp;&nbsp; 767.48&nbsp; 4&nbsp; 4 rindx= 5.<br>&nbsp;3<br>&nbsp; OBS NUDGING FOR IN,J,KTAU,XTIME,IVAR,IPL:&nbsp; 1 10&nbsp;&nbsp; 326&nbsp;&nbsp; 767.48&nbsp; 1&nbsp; 1 rindx= 5.<br>&nbsp;3<br>&nbsp; OBS NUDGING FOR IN,J,KTAU,XTIME,IVAR,IPL:&nbsp; 1 10&nbsp;&nbsp; 326&nbsp;&nbsp; 767.48&nbsp; 2&nbsp; 2 rindx= 5.<br>&nbsp;3<br>Timing for main (dt=135.00): time 2008-05-20_12:49:43 on domain&nbsp;&nbsp; 1:&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.07960 elapsed seconds.<br>forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)<br>Image&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; PC&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Routine&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Line&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Source&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>libc.so.6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00000033C34DD1E3&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>libopen-pal.so.0&nbsp;&nbsp; 00002B47160653DD&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>libopen-pal.so.0&nbsp;&nbsp; 00002B471606213D&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>libopen-pal.so.0&nbsp;&nbsp; 00002B471605555C&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>libmpi.so.0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00002B4715B43AA8&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>libmpi.so.0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00002B4715B721AC&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0000000001C64282&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0000000000F373F4&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00000000014F73B5&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0000000000E8EC4F&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0000000000D8DB6D&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 000000000052ECDF&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00000000004BC733&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00000000004BC6E7&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00000000004BC67C&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>libc.so.6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00000033C341EC9D&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br>wrf.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00000000004BC579&nbsp; Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Unknown&nbsp; Unknown<br><br><br><br>In addition, when I use upper air data, I get thousands and thousands of lines in my rsl.error.0000 file that read something like:<br><br>n=&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9061 unknown ob of type FM-88 SATOB<br><br>Is this normal or is there an option I am missing where it will read these correctly?<br><br>Any help for either of these problems would be greatly appreciated as I need to figure this out ASAP.<br><br>I've also attached both namelist.input and namelist.oa for any help that may provide.<br><br>Thank you.<br><br>-- <br>Christopher Klich<br>Graduate Student<br>Florida State University<br>(908) 208-9743<o:p></o:p></p></div></div>
<DIV><P><HR>
This message contains information that may be confidential, privileged or otherwise protected by law from disclosure. It is intended for the exclusive use of the Addressee(s). Unless you are the addressee or authorized agent of the addressee, you may not review, copy, distribute or disclose to anyone the message or any information contained within. If you have received this message in error, please contact the sender by electronic reply to email@environcorp.com and immediately delete all copies of the message.
</P></DIV>
</body></html>