<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>Hi, </div><div>  Does PYNIO not support to read the HDF5 format ? you can see the errors below.</div><div><br></div><div><br></div><div>--------------</div><div><br></div><div>NC4_open: path </div><div>./<a href="http://precip.mon.total.v501.nc">precip.mon.total.v501.nc</a> mode 4096 params 0</div><div><span style="white-space:pre">      </span>HDF5 error messages turned on.</div><div>./<a href="http://precip.mon.total.v501.nc">precip.mon.total.v501.nc</a> mode 4096</div><div><span style="white-space:pre">                 </span>nc4_grp_list_add: name /</div><div>HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.10.4) thread 47273485308896:</div><div>  #000: H5F.c line 509 in H5Fopen(): unable to open file</div><div>    major: File accessibilty</div><div>    minor: Unable to open file</div><div>  #001: H5Fint.c line 1400 in H5F__open(): unable to open file</div><div>    major: File accessibilty</div><div>    minor: Unable to open file</div><div>  #002: H5Fint.c line 1615 in H5F_open(): unable to lock the file</div><div>    major: File accessibilty</div><div>    minor: Unable to open file</div><div>  #003: H5FD.c line 1640 in H5FD_lock(): driver lock request failed</div><div>    major: Virtual File Layer</div><div>    minor: Can't update object</div><div>  #004: H5FDsec2.c line 939 in H5FD_sec2_lock(): file locking disabled on this file system (use HDF5_USE_FILE_LOCKING environment variable to override), errno = 38, error message = 'Function not implemented'</div><div>    major: File accessibilty</div><div>    minor: Bad file ID accessed</div><div>ERROR: file /home/conda/feedstock_root/build_artifacts/libnetcdf_1545075232789/work/libhdf5/hdf5open.c, line 506.</div><div>NetCDF: HDF error</div><div>HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.10.4) thread 47273485308896:</div><div>  #000: H5F.c line 509 in H5Fopen(): unable to open file</div><div>    major: File accessibilty</div><div>    minor: Unable to open file</div><div>  #001: H5Fint.c line 1400 in H5F__open(): unable to open file</div><div>    major: File accessibilty</div><div>    minor: Unable to open file</div><div>  #002: H5Fint.c line 1615 in H5F_open(): unable to lock the file</div><div>    major: File accessibilty</div><div>    minor: Unable to open file</div><div>  #003: H5FD.c line 1640 in H5FD_lock(): driver lock request failed</div><div>    major: Virtual File Layer</div><div>    minor: Can't update object</div><div>  #004: H5FDsec2.c line 939 in H5FD_sec2_lock(): file locking disabled on this file system (use HDF5_USE_FILE_LOCKING environment variable to override), errno = 38, error message = 'Function not implemented'</div><div>    major: File accessibilty</div><div>    minor: Bad file ID accessed</div><div><span style="white-space:pre">                        </span>nc4_close_hdf5_file: h5->path </div><div>./<a href="http://precip.mon.total.v501.nc">precip.mon.total.v501.nc</a> abort 1</div><div><span style="white-space:pre">                       </span>nc4_rec_grp_HDF5_del: grp->name /</div><div><span style="white-space:pre">                  </span>nc4_close_netcdf4_file: h5->path ./udel.airtemp.precip/<a href="http://precip.mon.total.v501.nc">precip.mon.total.v501.nc</a> abort 1</div><div><span style="white-space:pre">                        </span>nc4_rec_grp_del: grp->name /</div><div>warning:_NclOpenFile: Can not open file <./<a href="http://precip.mon.total.v501.nc">precip.mon.total.v501.nc</a>>; file format not supported or file is corrupted</div><div>Traceback (most recent call last):</div><div>  File "<a href="http://test2.udel-prcp.py">test2.udel-prcp.py</a>", line 17, in <module></div><div>    f    = Nio.open_file(os.path.join(dirc,"<a href="http://precip.mon.total.v501.nc">precip.mon.total.v501.nc</a>"))</div><div>  File "/home/1833/anaconda3/envs/ncl_to_python/lib/python3.7/site-packages/PyNIO/Nio.py", line 751, in open_file</div><div>    file = _nio.open_file(filename,mode,options,history,format)</div><div>Nio.NIOError: Unable to open file</div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr"><font size="1" face="times new roman, serif"><i>Shanru TIAN </i></font></div><div dir="ltr"><div><font size="1" face="times new roman, serif"><i>PhD Student in Climatology </i></font></div><div><i style="font-family:"times new roman",serif;font-size:x-small">University of Delaware </i><br></div><div><font size="1" face="times new roman, serif"><i><span style="background-color:rgb(246,246,246);color:rgb(0,0,0)">TO BE MODEST, TO BE GREAT</span><font>    </font>           </i></font></div><div><i style="font-size:12.8px"><font face="times new roman, serif"><font size="2"><br></font></font></i></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>