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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">In the build environment for PyNIO I am only using GRIB2 and NetCDF-4 but when loading the nio python module I get the following error.
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">>>> import nio<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Traceback (most recent call last):<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> File "<stdin>", line 1, in <module><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ImportError: /nas/sshaw/bmarks/NCAR-2015/pyResBench/PyNIO/lib64/python2.6/site-packages/PyNIO/nio.so: undefined symbol: HE5_GDdetach<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I believe this symbol is located in the HDF-EOS2 libs but I did not build this optional package. Prior to executing the “python setup.py build” for PyNIO I only requested Grib2 and Netcdf4 using the env settings detailed in the INSTALL
file as shown below. Any ideas how to get around this issue?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">PyNIO/PyNIO-1.3.0b1> env | grep HAS<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">HAS_GRIB2=1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">HAS_NETCDF4=1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I have the following packages installed using a common external-files directory for lib, include, bin, share and man directories.
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">g2clib-1.4.0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">hdf-4.2.10<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">jasper-1.900.1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">jpeg-6b<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">libpng-1.6.16<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">netcdf-4.3.1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">szip-2.1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">zlib-1.2.5<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">external-files> ls<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">bin examples include lib man ncl_ncarg share src<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">OS: SUSE Linux Enterprise Server 11 (x86_64) SP3<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Compiler: gcc version 4.3.4<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thanks,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Scott Shaw<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">SGI – Apps Engineer<o:p></o:p></p>
</div>
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