<div dir="ltr"><div><b>perl</b>/<b>CDO</b>/<b>python</b> : <span style="color:rgb(0,0,255)"><b>No NCL</b></span>. Why is the question posted to <b>ncl-talk</b>?</div><div>--------------------------------------------------------------------------------------------<br></div><div>[1] re: "running icclim (a <b>python library for index calculation</b> from CNRM-CERFACS-France) fails, giving a message killed"   <br></div><div><br></div><div><div>Rick's answer is correct.</div></div><div><br></div><div>Maybe posting a python based question to ?stackexchange? or CERFACS would be best?</div><div><br></div><div>[2] Certainly, ncl-talk people are not readily familiar  with "several RCMs". What RCM's?<br></div><div><br></div><div>When this type of question is posted to any group, you should include [attach] the output from (say) 'ncdump -h' both  a sample source and the '"merged" (concatenated) file. Otherwise, people are just guessing. <br></div><div><br></div><div>merging the files with nco "ncrcat  <a href="http://file1.nc" target="_blank">file1.nc</a> ... <a href="http://file6.nc" target="_blank">file6.nc</a> <a href="http://output.nc" target="_blank">output.nc</a>" is worse.</div><div><br></div><div>Maybe try the NCO 'ncrcat' operator. This requires that 'time' be "UNLIMITED"<br></div><div><br></div><div>%> <b>ncrcat </b>-O file[1-6].nc  <a href="http://output_ncrcat.nc" target="_blank">output_ncrcat.nc</a></div><div><br></div><div>Good Luck<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, Aug 22, 2019 at 9:01 AM Rick Brownrigg via ncl-talk <<a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Hi Zilore,</div><div><br></div><div>I don't know the answer to your specific science question(s), but if icclim is terminating with a message that simply says "killed", then that's a Linux system's very unhelpful way of saying it ran out of memory entirely.  Are you indeed running under Linux and are the data you are processing rather large?</div><div><br></div><div>Rick</div><div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, Aug 22, 2019 at 7:42 AM Zilore Mumba via ncl-talk <<a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">I have five yearly data from several RCMs, i.e 19510101 to 19551231, ... 20050101 to 20101231. These are tasmax, tasmin and precip. I want to work on climate indices on these files, but only interested in the period 19710101 to 20001231. I have written a perl script which combines six files with the command "cdo <a href="http://file1.nc" target="_blank">file1.nc</a> <a href="http://file2.nc" target="_blank">file2.nc</a> ... <a href="http://file6.nc" target="_blank">file6.nc</a> <a href="http://outputfile.nc" target="_blank">outputfile.nc</a>".<br>The perl scrip seems to work fine.<br>However:<br>1. ncdump -h combined file gives the right number of times in the file, 10958 365x30+8 leap years)<br>2. display in ncl displays the map ok<br>3. A check on values at specific times shows they are the same as in the original file<br>But:<br>running icclim (a python library for index calculation from CNRM-CERFACS-France) fails, giving a message killed<br>running icclim with an original file calculates the index ok.<br><br>My request for assistance is whether anybody has experienced such a problem and how it can be resolved.<br>merging the files with nco "ncrcat  <a href="http://file1.nc" target="_blank">file1.nc</a> ... <a href="http://file6.nc" target="_blank">file6.nc</a> <a href="http://output.nc" target="_blank">output.nc</a>" is worse. Plotting in ncl gives "unknown format<br>Assistance will be appreciated.<br></div>
_______________________________________________<br>
ncl-talk mailing list<br>
<a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br>
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
<a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a></blockquote></div>
_______________________________________________<br>
ncl-talk mailing list<br>
<a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br>
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
<a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a></blockquote></div>