<div dir="ltr"><div>netCDF Operators<br></div><div><br></div><div>%> <b>ncrcat</b> *nc4 FOO.nc4</div><div><br></div><div>or</div><div><br></div><div>%> <b>ncrcat</b> -v date,xco2,xco2_quality_flag  *nc4  FOO.nc4</div><div><br></div><div> NCL</div><div><br></div><div><pre>files= <b>systemfunc</b>("ls *.nc4")<br>f = <b>addfile<span style="color:rgb(0,0,255)">s</span></b>(files, "r")<br><b>print</b>(f)<br><br><br></pre></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, Mar 29, 2019 at 9:53 AM xiaoming Hu <<a href="mailto:yuanfangcan@hotmail.com">yuanfangcan@hotmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<span style="color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt">I wrote a simple script (attached below) to concatenate among different files.  </span><br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<pre>But I got error message in a simple line: <pre style="background-color:rgb(255,255,255)">fout->latitude=  latitude_pre   </pre><pre style="background-color:rgb(255,255,255)">see my screen output:</pre><pre style="background-color:rgb(255,255,255)">"</pre><pre style="background-color:rgb(255,255,255)"><span>Variable: latitude_pre<br></span><div>Type: float<br></div><div>Total Size: 2415220 bytes<br></div><div>            603805 values<br></div><div>Number of Dimensions: 1<br></div><div>Dimensions and sizes:     [sounding_id | 603805]<br></div><div>Coordinates: <br></div><div>            sounding_id: [2014091900023702..2014092123542735]<br></div><div>Number Of Attributes: 5<br></div><div>  comment :   center latitude of the measurement<br></div><div>  long_name :       latitude<br></div><div>  units :     degrees_north<br></div><div>  missing_value :        -999999<br></div><div>  _FillValue : -999999<br></div><div>fatal:["NclFile.c":432]:FileAddVar: an error occurred while adding a variable to a file, check to make sure data type is supported by the output format<br></div><div>fatal:["Execute.c":8578]:Execute: Error occurred at or near line 65 in file extract_overChina.ncl<br></div><div><br></div><div>(0)      finish outputing the 1st var<br></div><div>fatal:["NclFile.c":432]:FileAddVar: an error occurred while adding a variable to a file, check to make sure data type is supported by the output format<br></div><div>fatal:["Execute.c":8578]:Execute: Error occurred at or near line 67 in file extract_overChina.ncl<br></div><div><br></div><div>fatal:["NclFile.c":432]:FileAddVar: an error occurred while adding a variable to a file, check to make sure data type is supported by the output format<br></div><div>fatal:["Execute.c":8578]:Execute: Error occurred at or near line 68 in file extract_overChina.ncl<br></div><div><br></div><div>fatal:["NclFile.c":432]:FileAddVar: an error occurred while adding a variable to a file, check to make sure data type is supported by the output format<br></div><div>fatal:["Execute.c":8578]:Execute: Error occurred at or near line 69 in file extract_overChina.ncl<br></div><div><br></div><div>fatal:["NclFile.c":432]:FileAddVar: an error occurred while adding a variable to a file, check to make sure data type is supported by the output format<br></div><div>fatal:["Execute.c":8578]:Execute: Error occurred at or near line 70 in file extract_overChina.ncl<br></div><div><br></div><div>fatal:["NclFile.c":432]:FileAddVar: an error occurred while adding a variable to a file, check to make sure data type is supported by the output format<br></div><div>fatal:["Execute.c":8578]:Execute: Error occurred at or near line 71 in file extract_overChina.ncl</div></pre><pre style="background-color:rgb(255,255,255)">"</pre></pre>
<pre>Any idea what is happening? </pre>
<pre>Thanks a lot</pre>
<pre>Xiaoming </pre>
<pre>My NCl script: </pre>
<pre>files= systemfunc("ls *.nc4")

do ifile = 0 , dimsizes(files)-1
    f= addfile(files(ifile),"r") 
     print("start working on "+files(ifile))
        latitude=f->latitude
        xco2=f->xco2
        date=f->date
        longitude=f->longitude
        time=f->time
        xco2_quality_flag=f->xco2_quality_flag
     print("having record "+dimsizes(xco2))
   if (ifile.eq.0)
        latitude_total         =latitude
        xco2_total             =xco2
        date_total             =date
        longitude_total        =longitude
        time_total             =time
        xco2_quality_flag_total=xco2_quality_flag
   else
        latitude_total          =array_append_record (latitude_pre, latitude, 0 )
        xco2_total              =array_append_record (xco2_pre, xco2, 0 )
        date_total              =array_append_record (date_pre, date, 0 )
        longitude_total         =array_append_record (longitude_pre, longitude, 0 )
        time_total              =array_append_record (time_pre, time, 0 )
        xco2_quality_flag_total =array_append_record (xco2_quality_flag_pre, xco2_quality_flag, 0 )
   end if 
    if (ifile.gt.0) then 
        delete(latitude_pre);          =array_append_record (latitude_pre, latitude, 0 )
        delete(xco2_pre    );          =array_append_record (xco2_pre, xco2, 0 )
        delete(date_pre    );          =array_append_record (date_pre, date, 0 )
        delete(longitude_pre);         =array_append_record (longitude_pre, longitude, 0 )
        delete(time_pre     );         =array_append_record (time_pre, time, 0 )
        delete(xco2_quality_flag_pre); =array_append_record (xco2_quality_flag_pre, xco2_quality_flag, 0 )
    end if 

        latitude_pre=   latitude_total          
        xco2_pre=       xco2_total              
        date_pre=       date_total              
        longitude_pre=  longitude_total         
        time_pre=       time_total              
        xco2_quality_flag_pre=  xco2_quality_flag_total 

        delete(latitude_total);          =array_append_record (latitude_pre, latitude, 0 )
        delete(xco2_total    );          =array_append_record (xco2_pre, xco2, 0 )
        delete(date_total    );          =array_append_record (date_pre, date, 0 )
        delete(longitude_total);         =array_append_record (longitude_pre, longitude, 0 )
        delete(time_total     );         =array_append_record (time_pre, time, 0 )
        delete(xco2_quality_flag_total); =array_append_record (xco2_quality_flag_pre, xco2_quality_flag, 0 )

        delete(latitude);          =array_append_record (latitude_pre, latitude, 0 )
        delete(xco2    );          =array_append_record (xco2_pre, xco2, 0 )
        delete(date    );          =array_append_record (date_pre, date, 0 )
        delete(longitude);         =array_append_record (longitude_pre, longitude, 0 )
        delete(time     );         =array_append_record (time_pre, time, 0 )
        delete(xco2_quality_flag); =array_append_record (xco2_quality_flag_pre, xco2_quality_flag, 0 )
     print("finish working on "+files(ifile))
         
end do 
    system("rm OCO-2_9_LITE_LEVEL2_all.nc")
    fout=addfile("OCO-2_9_LITE_LEVEL2_all.nc","c")
     printVarSummary(latitude_pre)
        fout->latitude=      latitude_pre          
     print("finish outputing the 1st var")
        fout->xco2=  xco2_pre              
        fout->date=  date_pre              
        fout->longitude=     longitude_pre         
        fout->time=  time_pre              
        fout->xco2_quality_flag=     xco2_quality_flag_pre 
</pre>
<br>
<br>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>
ncl-talk mailing list<br>
<a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br>
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
<a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a><br>
</blockquote></div>