<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>There is an AMSR example: <b><br></b></div><div><b><a href="http://www.ncl.ucar.edu/Applications/HDF.shtml">http://www.ncl.ucar.edu/Applications/HDF.shtml</a><br></b></div><div><b>Dee: amsr_1.ncl</b></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Fri, Sep 14, 2018 at 10:28 PM Ehsan Taghizadeh <<a href="mailto:ehsantaghizadeh@yahoo.com">ehsantaghizadeh@yahoo.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="font-family:bookman old style,new york,times,serif;font-size:16px"><div><div id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532"><div><div><div><div id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462"><div><div><div><div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"></div>
        <div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px">Dear Dennis</div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px">Thank you so much for your helpful replies.<br></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px">Pardon me if I ask some questions with my responsibility to solve them. However sometimes some problems take much time and finally I couldn't find any solution for them. I'll be thankful if I could have ncl-talk help to overcome them. Beside that, solving some problems need more experiences, which I still don't have enough experience with ncl and also some data format. I always query my data with "panoply" or "ncl_filedump" or "ncdump -h", but the problem is that I don't know what should I do. It is obvious helping in these problems are priceless and until now I've got many helps from ncl-talk which kicking <span><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:"old times",serif;font-size:16px">me </span></span>forward much at doing my thesis. I just could appreciate for these helps.</div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"><br></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px">However, it could be disturbing (!), but I encountered same problem with another data set, AMSR2.<br></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px">First I want to know whether is there any ncl script for AMSR2. I couldn't find anything in (<a href="https://www.ncl.ucar.edu/Applications/" rel="nofollow" target="_blank">https://www.ncl.ucar.edu/Applications/</a>). If not, may I ask some help for AMSR2 data? I've attached three samples data of AMSR2. These data set don't have _FillValue, although it includes "-32767" (default _FillValue of short type) and "-32768" (default missing Value).</div><div style="font-family:"bookman old style","new york",times,serif;font-size:16px">So I've tried<br><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">sm@_FillValue<span style="white-space:pre-wrap">            </span>:= getVarFillValue(sm)</font><br></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px">But what should I do about "-32768" values (missing_value)?</div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px">Also, since that ( <span>Geophysical_Data</span>) in AMSR2 is 3 dimensional I've changed some lines as below:</div><div><div><font size="2" face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif">     sm_new  = where(lsm.eq.0 , sm_new@_FillValue , sm_new(:,:<font color="#cb008e">,0</font>))</font></div><div><font size="2" face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif">     sm_new  = sm_new(::-1,:<font color="#cb008e">,:</font>)<br></font></div><div><span><font size="2" face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif">     sm_region := sm_new({latS:latN},{lonL:lonR}<font color="#cb008e">,:</font>)<br></font></span></div><div><font size="2" face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif">     AMSR2_fo = linint2_points(sm_region&longitude, sm_region&latitude, sm_region<font color="#cb008e">(time | :, latitude | :, longitude | :)</font>, True , stlon, stlat, 0)</font><br></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"><br></div><font face="old times, serif">Are they true?</font></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"><br></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"><span>Another problem that is related to handle many h5 data, which resulted to following error:</span></div><div style="font-family:"bookman old style","new york",times,serif;font-size:16px"><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.10.1) thread 0:</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">  #000: H5F.c line 408 in H5Fis_hdf5(): unable open file</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">    major: File accessibilty</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">    minor: Not an HDF5 file</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">  #001: H5Fint.c line 532 in H5F__is_hdf5(): unable to open file</font></div><div><font face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif" size="2">...</font></div><br></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"><span><br></span></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"><span>Could I have any reference page in ncl website</span> or any suggestion to overcome these problems.</div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"><span><br></span></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"><span>Sincerely</span></div><div style="font-family:"old times",serif;font-size:16px"><span>Ehsan</span></div>
        
        </div></div><div id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462yahoo_quoted_7923549978" class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462yahoo_quoted" style="font-family:"bookman old style","new york",times,serif;font-size:16px">
            <div style="font-family:'Helvetica Neue',Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:13px;color:#26282a">
                
                <div>
                    On Friday, September 14, 2018, 8:10:40 AM GMT+4:30, Dennis Shea <<a href="mailto:shea@ucar.edu" target="_blank">shea@ucar.edu</a>> wrote:
                </div>
                <div><br></div>
                <div><br></div>
                <div><div id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>SMOPS: soil Moisture Operational Products System <br clear="none"></div><div><a shape="rect" href="https://www.ospo.noaa.gov/Products/land/smops/" rel="nofollow" target="_blank"><b>https://www.ospo.noaa.gov/Products/land/smops/</b></a><br clear="none">Values over land only<br clear="none"></div><div><br clear="none"></div><div>[1] <b><span style="color:rgb(255,0,0)"><br clear="none"></span></b></div><div><span style="color:rgb(0,0,0)">The</span><b><span style="color:rgb(255,0,0)"> most important rule in data processing</span></b> is <span style="color:rgb(0,0,255)"><b>*Look at your data"</b></span>. <br clear="none"></div><div>Sometimes you have to look <b>carefully!</b></div><div><span style="color:rgb(255,0,0)"><b>This is a user responsibility.</b></span><br clear="none"></div><div><br clear="none"></div><div>netcdf NPR_SMOPS_CMAP_D20170410 {<br clear="none">dimensions:<br clear="none">        Longitude = 1440 ;<br clear="none">        Latitude = 720 ;<br clear="none">variables:<br clear="none">        <b>short</b> <b>Blended_SM(Latitude, Longitude) ;</b><br clear="none">                Blended_SM:long_name = "Blended Soil Moisture" ;<br clear="none">                Blended_SM:units = "m^3/m^3" ;<br clear="none">                <span style="color:rgb(0,0,255)"><b>Blended_SM:FillValue = -999s ;    <=======</b></span><br clear="none">                Blended_SM:valid_range = 0s, 10000s ;<br clear="none">                Blended_SM:scale_factor = 0.0001f ;<br clear="none">                Blended_SM:add_offset = 0.f ;</div><div>[SNIP]<br clear="none"></div><div><br clear="none"></div><div>The NPR_SMOPS_CMAP file <b>does not conform to any netCDF convention</b>. Likely an oversight. It uses <span style="color:rgb(0,0,255)"><b>FillValue</b> <span style="color:rgb(0,0,0)">rather than</span> _<span><b>FillValue.  </b><font color="#000000">The <b>_ </b>is important!!! NCL  recognizes only <b>_FillValue </b>(<span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">Climate and Forecast netCDF Convention) </font></span></span><b>.</b> Hence, NCL's <a shape="rect" href="http://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Contributed/short2flt.shtml" rel="nofollow" target="_blank"><b>short2flt </b></a>will not properly unpack the  "<b>short</b> <b>Blended_SM"</b> variable. Likely, this is the source of some of the interpolation issues.</font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000"><br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">How to fix this? <br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000"><br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">Replace:</font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000"><br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">           sm  = <a shape="rect" href="http://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Contributed/short2flt.shtml" rel="nofollow" target="_blank"><b>short2flt( </b></a>SMOPS_fi->Blended_SM )</font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000"><br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">with <br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000"><br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">           sm  = <span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">SMOPS_fi->Blended_SM</font></span></span>    ; Read variable of type 'short'<br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">           sm@<b>_FillValue </b>= sm@<b>FillValue  ; add correct attribute to original variable<br clear="none"></b></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">           printVarSummary(sm)                     ; Note <b>_FillValue</b> attribute<br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">           <span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">sm  <b>:=</b> <b>short2flt</b>( sm )</font></span></span>                    ; Use NCL's overwrite syntax  <b>:=</b><br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000"><br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">Add coordinates which are not on the file. Another, oversight by the file creator!<br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000"><br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span><font color="#000000">          sm!0                          = "latitude"<br clear="none">          sm!1                          = "longitude"<br clear="none">          sm&latitude               = latitude<br clear="none">          sm&longitude            = longitude<br clear="none">          printVarSummary(sm)<br clear="none">          printMinMax(sm, 0)<br clear="none">          print("---")<br clear="none"><br clear="none"></font></span></span></div><div><span style="color:rgb(0,0,255)"><span></span></span>============</div><div>[2] Using '<b>poisson_grid_fill</b>' <br clear="none"></div><div><br clear="none"></div><div>   [a] will 'fill-in' gaps in the satellite mosaic swaths     :-)<br clear="none"></div><div>   [b] it will also put 'soil moisture' over the oceans and lakes.   :-(<br clear="none"></div><div>      <br clear="none"></div><div>You can use a<b>n</b> NCL function to mask out the oceans/lakes/ice/etc<b><br clear="none"></b></div><div>   <a shape="rect" href="http://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Shea_util/landsea_mask.shtml" rel="nofollow" target="_blank"><b>http://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Shea_util/landsea_mask.shtml</b></a><br clear="none"></div><div><br clear="none"></div><div>%> ncl 20_SMOPS.poisson_fill_mask.ncl</div><div><br clear="none"></div><div>creates: SMOPS_FILL_MASK.png<br clear="none"></div><div>============</div><div><br clear="none"></div><div>[3] The following uses linint2_points_Wrap to perform the station interpolations.</div><div><br clear="none"></div><div>%> 20_SMOPS.poisson_fill_mask_linint2.ncl<br clear="none"></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462gmail_extra"><br clear="none"><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462gmail_quote">On Wed, Sep 12, 2018 at 5:15 AM, Ehsan Taghizadeh <span dir="ltr"><<a shape="rect" href="mailto:ehsantaghizadeh@yahoo.com" rel="nofollow" target="_blank">ehsantaghizadeh@yahoo.com</a>></span> wrote:<br clear="none"><blockquote class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462yqt6301167649" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462yqt06208"><div><div style="font-family:bookman old style,new york,times,serif;font-size:16px"><div style="font-family:bookman old style,new york,times,serif;font-size:16px"><div></div>
        <div><span></span><div style="color:rgb(0,0,0)"><div><span style="color:rgb(38,40,42)">Hi,</span></div><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462"></span><div><span style="color:rgb(38,40,42)">Again Thank you so much for your helpful comments.</span><br clear="none"></div></div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282ydp68cf5210yahoo_quoted" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282ydp68cf5210yahoo_quoted_7529853277" style="color:rgb(0,0,0)"><div><div id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282ydp68cf5210yiv7470115850"><div><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462"></span><div>Unfortunately after a few days I still have problem with interpolating data on station points. In spite of using "poisson_grid_fill" and "linmsg" to avoid getting Fill_Value on unstructured points, these don't work; all values for all dates and all points are Fill_value (-0.099900) (attached file: 20_SMOPS_Interp.txt). Could I have any suggestion to get interpolated values other than "-0.099900". I've used this script for some data set and it helps me a lot. But for some data set, like SMOPS data, it gives me just Fill_Value.</div><div>I know using "knnsearch" in matlab gives values except "-0.099900", however I want to interpolate with ncl.</div><div>I've attached the script (20_SMOPS_Interp.ncl) and also station points (2_stations.dat) and output file (20_SMOPS_Interp.txt). I've also put zipped input data (SMOPS_Data.tgz) on ftp.</div><div><br clear="none"></div><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462"></span><div>I'll be thankful for any help.</div><div><br clear="none"></div><div>Sincerely</div><div>Ehsan</div></div></div></div></div><br clear="none"></div><div><br clear="none"></div>
        
        </div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yahoo_quoted" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yahoo_quoted_7180615196">
            <div style="font-family:'Helvetica Neue',Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:13px;color:#26282a"><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462">
                
                </span><div>
                    On Friday, September 7, 2018, 8:25:16 PM GMT+4:30, Dennis Shea <<a shape="rect" href="mailto:shea@ucar.edu" rel="nofollow" target="_blank">shea@ucar.edu</a>> wrote:
                </div>
                <div><br clear="none"></div>
                <div><br clear="none"></div>
                <div><div id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291"><div><div dir="ltr"><div>[1] No</div><div>[2] Yes<br clear="none"></div><div><br clear="none"></div><div><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462"></span><pre>      nlat = 720<br clear="none">      latitude = <b>fspan</b>(-49.875, 49.875, nlat)<br clear="none">      latitude@units = "<b>degrees_north</b>"<br clear="none">      latitude@long_name = "latitude"<br clear="none">      latitude!0        = "latitude"<br clear="none">      latitude&latitude =  latitude<br clear="none"></pre><pre>      printVarSummary(latitude)<br clear="none">      printMinMax(latitude,0)<br clear="none"><br clear="none"></pre><pre>      mlon = 1440
      longitude  = <a shape="rect" href="https://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Contributed/lonGlobeFo.shtml" rel="nofollow" target="_blank"><b>lonGlobeFo</b></a>(mlon, "longitude", "longitude", "degrees_east")  ; 0->360<br clear="none">      longitude  = (/ longitude - 180. /)  ; subtract 180 from all values 
      longitude&longitude = longitude            ; update coordinates       printVarSummary(lon)<br clear="none">   <br clear="none">      printVarSummary(longitude)<br clear="none">      printMinMax(longitude,0)<br clear="none"><br clear="none"></pre><pre>      f = <b>addfile</b>("NPR_SMOPS_CMAP_D20170<a shape="rect" href="http://410.nc" rel="nofollow" target="_blank"> 410.nc</a>","r")</pre><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5"><br clear="none">      x = <a shape="rect" href="https://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Contributed/short2flt.shtml" rel="nofollow" target="_blank"><b>short2flt</b></a>( f->Blended_SM )<br clear="none"></div></div><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5"><pre>      x&latitude = latitude<br clear="none">      x&longitude = longitude <br clear="none"></pre><pre>      printVarSummary(x)<br clear="none"><br clear="none">[3]/[4]<br clear="none"></pre><pre>      xo = .... longitudes of land points...<br clear="none"></pre><pre>      yo = ... latitudes ....<br clear="none"></pre><pre>      xpts = <strong>linint2_points</strong>(x&longitude,x& latitude,x, False, xo,yo, 0)<br clear="none"></pre><pre>      printVarSummary(xpts)<br clear="none"></pre><pre>      printMinMax(xpts,0)<br clear="none"></pre><br clear="none"></div></div></div></div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291gmail_extra"><br clear="none"><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291gmail_quote"><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5">On Tue, Sep 4, 2018 at 5:50 AM, Ehsan Taghizadeh <span dir="ltr"><<a shape="rect" href="mailto:ehsantaghizadeh@yahoo.com" rel="nofollow" target="_blank">ehsantaghizadeh@yahoo.com</a>></span> wrote:<br clear="none"></div></div><blockquote class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291yqt7914602477" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291yqt43162"><div><div style="font-family:bookman old style,new york,times,serif;font-size:16px"><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5"><div style="font-size:16px"><div style="font-size:16px"><div id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254ydp2d0caccyiv1638557123"><div style="font-size:16px"><div style="font-size:16px"><div id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254ydp2d0caccyiv1638557123ydp541e2203yiv1133628391"><div><div><span>Thank you so much for your nice reply, as always.</span><br clear="none"></div><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif">I did your comments, however I encountered some difficulties and I'll be thankful if I could have any help about them, too.</font></div><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif"><br clear="none"></font></div><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif">1. Should I change</font></div><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291"></span><div><font size="3" face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif"><span style="background-color:rgb(253,248,105)"></span></font><pre style="white-space:pre-wrap;color:rgb(0,0,0)"><font style="background-color:rgb(253,248,105)" size="3" face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif">latitude = <b>fspan</b>(-49.875, 49.875, nlat)</font></pre></div><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif">to</font></div><div><font size="2" face="times new roman, new york, times, serif"><span></span></font><pre><font style="background-color:rgb(253,248,105)" size="3" face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif">latitude = <b>fspan</b>(-89.875, 89.875, nlat)</font></pre><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif">or like longitude, use</font></div><div><span></span><pre style="margin-top:0px;margin-bottom:0px;padding:0px;line-height:12pt;font-family:courier;border-style:solid;border-width:0px 0px 15px;border-color:transparent;color:rgb(0,0,0)"><span style="background-color:rgb(253,248,105)"><font size="3">lat  = <strong style="margin:0px;padding:0px">latGlobeFo</strong>(nlat, "lat", "latitude", "degrees_north")</font></span></pre><br clear="none"></div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif">2. Should I change</font></div><div style="font-size:16px"><font size="2" face="times new roman, new york, times, serif"><span style="background-color:rgb(253,248,105)"></span></font><pre><font style="background-color:rgb(253,248,105)" face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif">latitude@units = "degrees_east"</font></pre><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font face="times new roman, new york, times, serif">to</font></span></div><div><font size="2" face="times new roman, new york, times, serif"><span></span></font><pre style="white-space:pre-wrap"><font style="background-color:rgb(253,248,105)" face="courier new, courier, monaco, monospace, sans-serif">latitude@units = "degrees_north"</font></pre><br clear="none"></div><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif"><span></span></font><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif">3. How should I control FillValue (-999s), because after running ncl script, it writes -0.1 for Nan value of the data, both in grided and interpolated output files.</font></div><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif">4. However the most difficulty is the interpolating part, because all interpolated values for all station points got -0.1, means Nan. There is no value except -0.1 for any station points. Could anybody help me about this?</font></div><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif">I've attached the output of interpolated file. I'll be thankful for any help.</font></div><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif"><br clear="none"></font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Sincerely<br clear="none"></font></div></div><div><font size="3" face="times new roman, new york, times, serif">Ehsan</font></div><div><br clear="none"></div></div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254ydp2d0caccyiv1638557123ydp541e2203yiv1133628391yahoo_quoted" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254ydp2d0caccyiv1638557123ydp541e2203yiv1133628391yahoo_quoted_6583562785">
            <div style="font-family:'Helvetica Neue',Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:13px;color:#26282a">
                
                </div></div></div></div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254ydp2d0caccyiv1638557123yqt3572844941" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254ydp2d0caccyiv1638557123yqtfd53451"></div></div></div></div></div></div></div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123yqt8965435499" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123yqtfd57951"><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5"><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291h5"><div>
                    On Friday, August 31, 2018, 6:14:53 PM GMT+4:30, Dennis Shea <<a shape="rect" href="mailto:shea@ucar.edu" rel="nofollow" target="_blank">shea@ucar.edu</a>> wrote:
                </div>
                <div><br clear="none"></div>
                <div><br clear="none"></div>
                </div></div></div></div><div><div id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123"><div><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291h5"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5"><div dir="ltr">Sometimes, you have to read documentation associated with the file(s)<br clear="none"><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123gmail-st"><em>Soil Moisture</em> Operational Products System (<b><em>SMOPS</em></b>)</span><br clear="none"><br clear="none">The file has:<br clear="none"><br clear="none">netcdf NPR_SMOPS_CMAP_D20170410 {<br clear="none">dimensions:<br clear="none"><b>        Longitude = 1440 ;<br clear="none">        Latitude = 720 ;</b><br clear="none">variables:<br clear="none">        <b>short</b> Blended_SM(<b>Latitude, Longitude</b>) ;<br clear="none">                Blended_SM:long_name = "Blended Soil Moisture" ;<br clear="none">                Blended_SM:units = "m^3/m^3" ;<br clear="none">                Blended_SM:FillValue = -999s ;<br clear="none">                Blended_SM:valid_range = 0s, 10000s ;<br clear="none">                Blended_SM:<b>scale_factor </b>= 0.0001f ;<br clear="none">                Blended_SM:<b>add_offset</b> = 0.f ;<br clear="none"><br clear="none"></div><div>[SNIP]<br clear="none">                :Product_Resolution = "0.25 degree" ;<br clear="none">                :Date_Start = "20170410" ;<br clear="none">                :Date_End = "20170410" ;<br clear="none"></div><div>[SNIP]<br clear="none"></div><div> ====<br clear="none"></div></div></div><div><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5">It does not have Latitude[*] and Longitude[*] coordinates. However, <b>*you*</b> can create them. Then, use ESMF or (say)<a shape="rect" href="https://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Contributed/linint2_Wrap.shtml" rel="nofollow" target="_blank"><b> linint2_Wrap </b></a>or <a shape="rect" href="https://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Contributed/linint2_points_Wrap.shtml" rel="nofollow" target="_blank"><b>linint2_points_Wrap</b></a> to perform the interpolation.<br clear="none"><br clear="none">====<br clear="none"><pre>      nlat = 720<br clear="none">      latitude = <b>fspan</b>(-49.875, 49.875, nlat)<br clear="none">      latitude@units = "degrees_east"<br clear="none">      latitude@long_name = "latitude"<br clear="none">      latitude!0        = "latitude"<br clear="none">      latitude&latitude =  latitude<br clear="none"></pre><pre>      printVarSummary(latitude)<br clear="none">      printMinMax(latitude,0)<br clear="none"><br clear="none"></pre><pre>      mlon = 1440
      longitude  = <a shape="rect" href="https://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Contributed/lonGlobeFo.shtml" rel="nofollow" target="_blank"><b>lonGlobeFo</b></a>(mlon, "longitude", "longitude", "degrees_east")  ; 0->360<br clear="none">      longitude  = (/ longitude - 180. /)  ; subtract 180 from all values 
      longitude&longitude = longitude            ; update coordinates       printVarSummary(lon)<br clear="none">   <br clear="none">      printVarSummary(longitude)<br clear="none">      printMinMax(longitude,0)<br clear="none"><br clear="none"></pre></div></div><pre>      f = <b>addfile</b>("NPR_SMOPS_CMAP_D20170<a shape="rect" href="http://410.nc" rel="nofollow" target="_blank"> 410.nc</a>","r")</pre><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5"><br clear="none">      x = <a shape="rect" href="https://www.ncl.ucar.edu/Document/Functions/Contributed/short2flt.shtml" rel="nofollow" target="_blank"><b>short2flt</b></a>( f->Blended_SM )<br clear="none"></div></div><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5"><pre>      x&latitude = latitude<br clear="none">      x&longitude = longitude <br clear="none"></pre><pre>      printVarSummary(x)<br clear="none"></pre><pre>    <br clear="none"></pre></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5"><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123gmail_extra"><br clear="none"><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123gmail_quote"><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291h5">On Fri, Aug 31, 2018 at 5:45 AM, Ehsan Taghizadeh <span dir="ltr"><<a shape="rect" href="mailto:ehsantaghizadeh@yahoo.com" rel="nofollow" target="_blank">ehsantaghizadeh@yahoo.com</a>></span> wrote:<br clear="none"></div></div><blockquote class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123yqt7432983737" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123yqt23358"><div><div style="font-family:bookman old style,new york,times,serif;font-size:16px"><div>Hi,</div><div>Until now I've asked some questions related to interpolating some dataset on some unstructured points (synoptic stations). Now I have a new data set which I'm not sure about appropriate method to interpolating. I put one of my data (<span>NPR_SMOPS_CMAP_D20170410.nc</span>) in <span style="font-family:courier;font-size:13.3333px;white-space:pre-wrap"><a shape="rect" href="http://ftp.cgd.ucar.edu" rel="nofollow" target="_blank">ftp.cgd.ucar.edu</a>. <span><span style="color:rgb(0,0,0)">I'll be thankful if some one could refer me to correct script, like on (</span></span></span><a shape="rect" href="https://www.ncl.ucar.edu/Applications/ESMF.shtml" rel="nofollow" target="_blank">https://www.ncl.ucar.edu/ Applications/ESMF.shtml</a><span style="font-family:courier;font-size:13.3333px;white-space:pre-wrap"><span><span style="color:rgb(0,0,0)">) or (</span></span></span><a shape="rect" href="https://www.ncl.ucar.edu/Applications/regrid.shtml" rel="nofollow" target="_blank">https://www.ncl.ucar.edu/ Applications/regrid.shtml</a><span style="font-family:courier;font-size:13.3333px;white-space:pre-wrap"><span><span style="color:rgb(0,0,0)">), which interpolates my data on some special unstructured points.</span></span></span></div><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291"></span><div><span style="font-family:courier;font-size:13.3333px;white-space:pre-wrap"><span><span style="color:rgb(0,0,0)">However the printVarSummary(<span>Blended_SM</span>) result is as below:</span></span></span></div><div><span style="font-family:courier;font-size:13.3333px;white-space:pre-wrap"><span><span style="color:rgb(0,0,0)"><br clear="none"></span></span></span></div><div><span style="font-size:13.3333px;white-space:pre-wrap"><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:16px"></span></span><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Variable: <span style="color:rgb(0,0,0);font-size:16px;white-space:pre-wrap">Blended_SM</span></font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Type: float</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Total Size: 4147200 bytes</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">            1036800 values</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Number of Dimensions: 2</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Dimensions and sizes:   [Latitude | 720] x [Longitude | 1440]</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Coordinates:</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Number Of Attributes: 5</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">  _FillValue :  1e+20</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">  long_name :   Blended Soil Moisture</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">  units :       m^3/m^3</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">  FillValue :   -999</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">  valid_range : (  0,  1 )</font></div><div><br clear="none"></div><br clear="none"></div><div><span style="white-space:pre-wrap">Sincerely</span><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123HOEnZb"><font color="#888888"><br clear="none"></font></span></div><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123HOEnZb"><font color="#888888"></font></span><div><span style="font-family:courier;font-size:13.3333px;white-space:pre-wrap"><span><span style="color:rgb(0,0,0)">Ehsan</span></span></span></div></div></div></div><span class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291"><br clear="none">______________________________ _________________<br clear="none">
ncl-talk mailing list<br clear="none">
<a shape="rect" href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" rel="nofollow" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br clear="none">
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br clear="none">
<a shape="rect" href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="nofollow" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/ mailman/listinfo/ncl-talk</a><br clear="none">
<br clear="none"></span></blockquote></div><br clear="none"></div></div></div></div></div></div>
            </div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123yqt8965435499" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123yqtfd12555"><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123yqt3572844941" id="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462m_-7232316620658698282yiv2670303291m_-7665546919046516254yiv1638557123yqtfd22236">
        </div></div></div></div></div><div><div class="m_-8666645524250268535ydp5285499dyiv3067938532ydp5b04a0c5yiv3413453462h5"><br clear="none">______________________________ _________________<br clear="none">
ncl-talk mailing list<br clear="none">
<a shape="rect" href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" rel="nofollow" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br clear="none">
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br clear="none">
<a shape="rect" href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="nofollow" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/ mailman/listinfo/ncl-talk</a><br clear="none">
<br clear="none"></div></div></blockquote></div><br clear="none"></div></div></div></div>
            </div>
        </div></div></div></div><br clear="none">______________________________ _________________<br clear="none">
ncl-talk mailing list<br clear="none">
<a shape="rect" href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" rel="nofollow" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br clear="none">
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br clear="none">
<a shape="rect" href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="nofollow" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/ mailman/listinfo/ncl-talk</a><br clear="none">
<br clear="none"></blockquote></div><br clear="none"></div></div></div></div>
            </div>
        </div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>_______________________________________________<br>
ncl-talk mailing list<br>
<a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br>
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
<a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a><br>
</blockquote></div>