<div dir="ltr">Hi Adriana,<div>This is really strange. Try the following:</div><div>1) At the command line, enter this:</div><div>ng4ex gsun01n<br></div><div><br></div><div>This will open up an x-window and draw 4 similar plots. You can see all four by clicking on the x-window. In the 3rd/4th plots, do you see some color?</div><div><br></div><div>2) Please try switching your output format to something other than png, say a .ps file or to a x11 window. Do you still have no color?</div><div>Adam</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Thu, Aug 23, 2018 at 7:32 AM <<a href="mailto:adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr">adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Dennis<br>
<br>
Yes I tryed your code with my file, but I  still have the same "no <br>
color" graphic, I will attached again the png<br>
<br>
Also I executed the command in the linux command line (I copy again what <br>
I get):<br>
<br>
abossola@olivia:~$ ncl -V<br>
6.4.0<br>
abossola@olivia:~$ gcc --version<br>
  gcc (Ubuntu 7.3.0-16ubuntu3) 7.3.0<br>
  Copyright (C) 2017 Free Software Foundation, Inc.<br>
This is free software; see the source for copying conditions.  There<br>
is NO<br>
  warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR<br>
  PURPOSE.<br>
<br>
  abossola@olivia:~$ uname -a<br>
  Linux olivia 4.15.0-32-generic #35-Ubuntu SMP Fri Aug 10 17:58:07<br>
  UTC 2018 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux<br>
<br>
Le 23/08/2018 15:21, Dennis Shea a écrit :<br>
> [1] Run the code I sent you. Use your file.<br>
> <br>
> [2] As noted by Guido, the commands are to be issued from the<br>
> unix/linux command line. NOT FROM WITHIN NCL.<br>
> <br>
> %> ncl -V<br>
> %> uname -a<br>
> %> gcc --version<br>
> <br>
> On Thu, Aug 23, 2018 at 4:39 AM, <<a href="mailto:adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr" target="_blank">adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr</a>><br>
> wrote:<br>
> <br>
>> Thanks for the correction<br>
>> <br>
>> Now I get<br>
>> <br>
>> abossola@olivia:~$ gcc --version<br>
>> gcc (Ubuntu 7.3.0-16ubuntu3) 7.3.0<br>
>> Copyright (C) 2017 Free Software Foundation, Inc.<br>
>> This is free software; see the source for copying conditions.  There<br>
>> is NO<br>
>> warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR<br>
>> PURPOSE.<br>
>> <br>
>> abossola@olivia:~$ uname -a<br>
>> Linux olivia 4.15.0-32-generic #35-Ubuntu SMP Fri Aug 10 17:58:07<br>
>> UTC 2018 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux<br>
>> <br>
>> I tryed the script that Denis send me and is the same I have the<br>
>> contour lines but not the color (see the attached graphic)<br>
>> <br>
>> Le 23/08/2018 12:09, Guido Cioni a écrit :<br>
>> <br>
>> Be careful!<br>
>> <br>
>> abossola@olivia:~/Adriana/CESM/MAM7/MAM7_tes4$  gcc--version<br>
>> gcc--version: command not found<br>
>> <br>
>> It should be gcc --version (NOTE THE SPACE!!) and not gcc--version<br>
>> <br>
>> You do the same error afterwards<br>
>> <br>
>> ncl 1> ncl-V<br>
>> <br>
>> instead than ncl -V, although also this command should be executed<br>
>> oustide of NCL (only in the bash). The commands uname -a and gcc<br>
>> --version as well need to be executed outside of NCL.<br>
>> <br>
>> I'd suggest you to have a general introduction on Linux and NCL<br>
>> before<br>
>> attempting to fix your plot.<br>
>> <br>
>> However, did you try the script that Dennis sent?<br>
>> <br>
>> On 23. Aug 2018, at 11:12, <a href="mailto:adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr" target="_blank">adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr</a><br>
>> wrote:<br>
>> <br>
>> Hi<br>
>> <br>
>> I try the commands and this is what I obtain:<br>
>> <br>
>> abossola@olivia:~/Adriana/CESM/MAM7/MAM7_tes4$  ncl -V<br>
>> 6.4.0<br>
>> abossola@olivia:~/Adriana/CESM/MAM7/MAM7_tes4$ uname -a<br>
>> Linux olivia 4.15.0-32-generic #35-Ubuntu SMP Fri Aug 10 17:58:07<br>
>> UTC 2018 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux<br>
>> abossola@olivia:~/Adriana/CESM/MAM7/MAM7_tes4$  gcc--version<br>
>> gcc--version: command not found<br>
>> <br>
>> Other wise if I type this command in the ncl shell, then says:<br>
>> <br>
>> ncl 1> ncl-V<br>
>> fatal:syntax error: line 1 before or near -<br>
>> ncl-<br>
>> <br>
>> ncl 3> uname -a<br>
>> fatal:syntax error: line 3 before or near -<br>
>> uname -<br>
>> ------^<br>
>> <br>
>> fatal:error in statement<br>
>> ncl 4>  gcc--version<br>
>> fatal:syntax error: line 4 before or near -<br>
>> gcc-<br>
>> ----^<br>
>> <br>
>> fatal:error in statement<br>
>> <br>
>> I know that it is very strange because in my old computer everything<br>
>> working, it could be due to the version of Linux?<br>
>> <br>
>> This is my version now:<br>
>> NAME="Ubuntu"<br>
>> VERSION="18.04.1 LTS (Bionic Beaver)"<br>
>> ID=ubuntu<br>
>> ID_LIKE=debian<br>
>> PRETTY_NAME="Ubuntu 18.04.1 LTS"<br>
>> VERSION_ID="18.04"<br>
>> HOME_URL="<a href="https://www.ubuntu.com/" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.ubuntu.com/</a> [1]"<br>
>> SUPPORT_URL="<a href="https://help.ubuntu.com/" rel="noreferrer" target="_blank">https://help.ubuntu.com/</a> [2]"<br>
>> BUG_REPORT_URL="<a href="https://bugs.launchpad.net/ubuntu/" rel="noreferrer" target="_blank">https://bugs.launchpad.net/ubuntu/</a> [3]"<br>
>> <br>
>> <br>
> PRIVACY_POLICY_URL="<a href="https://www.ubuntu.com/legal/terms-and-policies/privacy-policy" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.ubuntu.com/legal/terms-and-policies/privacy-policy</a><br>
>> [4]"<br>
>> <br>
>> VERSION_CODENAME=bionic<br>
>> UBUNTU_CODENAME=bionic<br>
>> <br>
>> I really appreciate any help!<br>
>> <br>
>> Le 22/08/2018 17:58, Dennis Shea a écrit :<br>
>> Sorry. I accidentally hit "Send".<br>
>> Attached is the 2nd plot.<br>
>> On Wed, Aug 22, 2018 at 9:56 AM, Dennis Shea <<a href="mailto:shea@ucar.edu" target="_blank">shea@ucar.edu</a>> wrote:<br>
>> Not sure why you are not getting color.<br>
>> If the following does not create color then please send the output<br>
>> from<br>
>> %> ncl -V<br>
>> %> uname -a<br>
>> %> gcc--version<br>
>> =========<br>
>> ;---read in zonal winds<br>
>> ;a = addfile("<a href="http://MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc" rel="noreferrer" target="_blank">MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc</a> [5]<br>
>> [1]","r")<br>
>> ;u = a->U(0,35,:,:)<br>
>> a = addfile("<a href="http://uwnd.2008.nc" rel="noreferrer" target="_blank">uwnd.2008.nc</a> [6] [2]","r")<br>
>> u = a->uwnd(0,10,:,:)<br>
>> printVarSummary (u)<br>
>> ;print(u)<br>
>> wks  = gsn_open_wks("png","adriana")  ; send graphics to PNG file<br>
>> res                 = True<br>
>> res@gsnMaximize     = True       ; maximize in frame<br>
>> res@cnLinesOn       = True<br>
>> res@cnFillOn        = True<br>
>> res@cnFillPalette   = "BlueYellowRed"   ; change the color palette<br>
>> res@tiMainString    = "Default"<br>
>> plot = gsn_csm_contour_map(wks,u,res)<br>
>> res@mpFillDrawOrder = "PostDraw" ; Make sure land fill is drawn<br>
>> ; on top of filled contours<br>
>> res@tiMainString    = "add gray land fill after contouring"<br>
>> plot = gsn_csm_contour_map(wks,u,res)<br>
>> On Wed, Aug 22, 2018 at 2:22 AM,<br>
>> <<a href="mailto:adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr" target="_blank">adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr</a>> wrote:<br>
>> Hi thank you very much for the answer<br>
>> I corrected U and print the variable for see if this have values<br>
>> now is U(0,34,:,:)<br>
>> Variable: u<br>
>> Type: float<br>
>> Total Size: 55296 bytes<br>
>> 13824 values<br>
>> Number of Dimensions: 2<br>
>> Dimensions and sizes:    [lat | 96] x [lon | 144]<br>
>> Coordinates:<br>
>> lat: [ -90..  90]<br>
>> lon: [   0..357.5]<br>
>> Number Of Attributes: 6<br>
>> lev :    581.2501460313797<br>
>> time :     327<br>
>> mdims :    1<br>
>> units :    m/s<br>
>> long_name :    Zonal wind<br>
>> cell_methods :    time: mean<br>
>> And also have values, I checked it with print(u)<br>
>> But still the graphic is empty (white, no contour fill)<br>
>> On the other hand I can not access to <a href="http://ftp.cgd.ucar.edu" rel="noreferrer" target="_blank">ftp.cgd.ucar.edu</a> [7] [1] [3]<br>
>> for<br>
>> <br>
>> attach my file. Say:<br>
>> ERROR<br>
>> The requested URL could not be retrieved<br>
>> Any other idea how can I pass the file<br>
>> <a href="http://MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc" rel="noreferrer" target="_blank">MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc</a> [5] [1]<br>
>> Thank you very much<br>
>> Le 21/08/2018 20:36, Dennis Shea a écrit :<br>
>> [0]<br>
>> If you are just learning NCL, I suggest you look at the USER MANUAL<br>
>> at:<br>
>> <a href="HTTP://WWW.NCL.UCAR.EDU/DOCUMENT/MANUALS/" rel="noreferrer" target="_blank">HTTP://WWW.NCL.UCAR.EDU/DOCUMENT/MANUALS/</a> [8] [4] [6]<br>
>> [1]<br>
>> As noted by Toni,<br>
>> u = U(0,,:,:)<br>
>> is not correct. In fact, it should have generated a FATAL subscript<br>
>> syntax error.<br>
>> Note: although "fatal", NCL will continue. In fact, it will still<br>
>> try<br>
>> to create the plot. Since it did not have valid data, NCL generated<br>
>> a<br>
>> background and a default color lable bar. That is what you attached.<br>
>> [2]<br>
>> Your following resource setting needs some clarification:<br>
>> res@tiMainString    = "NCL version 6.1.x will give you gray land"<br>
>> For historical reasons, NCL's default graphic mode is<br>
>> black-and-white<br>
>> (B/W). This is true of *all* NCL versions. Not just 6.1.x.<br>
>> When, 'gsn_csm_contour_map' is used, the default background is<br>
>> continental outlines with light gray used to fill land areas. See:<br>
>> <a href="HTTP://WWW.NCL.UCAR.EDU/APPLICATIONS/CYLINEQ.SHTML" rel="noreferrer" target="_blank">HTTP://WWW.NCL.UCAR.EDU/APPLICATIONS/CYLINEQ.SHTML</a> [9] [5] [7]<br>
>> Examples 1 and 2<br>
>> Color is turned on via:<br>
>> res@cnFillOn = True     ; make color graphic<br>
>> When color is activated, (a) the background map including the light<br>
>> gray land fil is generated; then, (b) the color contour are drawn<br>
>> over<br>
>> that background.  The light gray land fill is overwritten (no big<br>
>> deal). The following resource setting tells the<br>
>> 'gsn_csm_contour_map'<br>
>> do the colr contours and then force the gray land fill last. [There<br>
>> are some reasons for doing that.]<br>
>> res@mpFillDrawOrder = "PostDraw" ; Make sure land fill is drawn<br>
>> ; on top of filled contours<br>
>> [3]<br>
>> If you want you can ftp a sample file to:<br>
>> ftp <a href="http://ftp.cgd.ucar.edu" rel="noreferrer" target="_blank">ftp.cgd.ucar.edu</a> [7] [1] [3] [8]<br>
>> anonymous<br>
>> your_email<br>
>> cd incoming<br>
>> put <a href="http://MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc" rel="noreferrer" target="_blank">MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc</a> [5] [1] [9]<br>
>> quit<br>
>> On Tue, Aug 21, 2018 at 9:45 AM, Toni Klemm <<a href="mailto:toni-klemm@tamu.edu" target="_blank">toni-klemm@tamu.edu</a>><br>
>> wrote:<br>
>> Hi Adriana,<br>
>> I noticed there are two commas in the command to extract the sind<br>
>> vectors: u = a->U(0,,:,:)  Could that be the problem?<br>
>> Could you attach the netCDF file from the example that you’re<br>
>> using? (<a href="http://MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc" rel="noreferrer" target="_blank">MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc</a> [5] [1] [1])<br>
>> Toni<br>
>> Toni Klemm, Ph.D.<br>
>> Postdoctoral Research Associate<br>
>> Department of Ecosystem Science and Management<br>
>> College of Agriculture and Life Sciences<br>
>> Texas A&M University, College Station, TX<br>
>> Contributor to the Early Career Climate Forum [3]<br>
>> <a href="http://www.toni-klemm.de" rel="noreferrer" target="_blank">www.toni-klemm.de</a> [10] [2] [6] [4] | @toniklemm [5]<br>
>> <br>
>> On Aug 21, 2018, at 10:01 AM, <a href="mailto:adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr" target="_blank">adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr</a><br>
>> wrote:<br>
>> Hi all<br>
>> I have a problem with ncl when I try to plot a contour graphic. I<br>
>> thought it was a mistake I was making, but then when I try with a<br>
>> example very simple still appears blank. And ncl does not tell me<br>
>> any error.<br>
>> Here is the script (have my file but is exactly the same that<br>
>> newcolor_1.ncl)<br>
>> ;************************************************<br>
>> ; zonal_2.ncl<br>
>> ;<br>
>> ; Concepts illustrated:<br>
>> ;   - Drawing a zonal means plot<br>
>> ;   - Using dim_avg_Wrap to calculate a zonal average<br>
>> ;************************************************<br>
>> ;load "/usr/lib/ncarg/nclscripts/csm/gsn_code.ncl"<br>
>> ;load "/usr/lib/ncarg/nclscripts/csm/gsn_csm.ncl"<br>
>> ;load "/usr/lib/ncarg/nclscripts/csm/contributed.ncl"<br>
>> ;************************************************<br>
>> begin<br>
>> ;************************************************<br>
>> ; variable and file handling<br>
>> ;************************************************<br>
>> ;---read in zonal winds<br>
>> a = addfile("<a href="http://MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc" rel="noreferrer" target="_blank">MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc</a> [5] [1]<br>
>> [1]","r")<br>
>> u = a->U(0,,:,:)                                ; July zonal<br>
>> winds<br>
>> wks  = gsn_open_wks("png","newcolor")  ; send graphics to PNG<br>
>> file<br>
>> res                 = True<br>
>> res@gsnMaximize     = True       ; maximize in frame<br>
>> res@cnLinesOn       = False<br>
>> res@cnFillOn        = True<br>
>> res@cnFillPalette   = "BlueYellowRed"   ; change the color<br>
>> palette<br>
>> res@mpFillDrawOrder = "PostDraw" ; Make sure land fill is drawn<br>
>> ; on top of filled contours<br>
>> res@tiMainString    = "NCL version 6.1.x will give you gray land"<br>
>> plot = gsn_csm_contour_map(wks,u,res)<br>
>> end<br>
>> I obtained a map without color fill, I was looking in some<br>
>> previous talk but nothing works. Can Anyone help me on this?<br>
>> thanks<br>
>> I attached the maps<br>
>> Thank you<br>
>> --<br>
>> Adriana Bossolasco<br>
>> LPC2E UMR 7328 (CNRS, Université d'Orléans)<br>
>> 3A avenue de la Recherche Scientifique<br>
>> 45071 Orléans Cedex 2 - FRANCE<br>
>> Tel  +33 (0)2 38 25 52 85<br>
>> e-mail:<br>
>> <br>
>> <br>
> <a href="mailto:adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr" target="_blank">adriana.bossolasco@cnrs-orleans.fr</a><newcolor.png>_______________________________________________<br>
>> ncl-talk mailing list<br>
>> <a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br>
>> List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
>> <a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a> [11] [7] [2]<br>
>> _______________________________________________<br>
>> ncl-talk mailing list<br>
>> <a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br>
>> List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
>> <a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a> [11] [7] [2]<br>
>> Links:<br>
>> ------<br>
>> [1] <a href="http://MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc" rel="noreferrer" target="_blank">http://MAM_GEOS_1anee.cam.h0.2000-12-07-00000.nc</a> [5] [3] [1]<br>
>> <br>
>> [2] <a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a> [11] [7]<br>
>> [3] <a href="http://www.eccforum.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.eccforum.org</a><br>
>> [4] <a href="http://www.toni-klemm.de" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.toni-klemm.de</a><br>
>> [5] <a href="http://twitter.com/toniklemm" rel="noreferrer" target="_blank">http://twitter.com/toniklemm</a><br>
>> [6] <a href="http://www.ncl.ucar.edu/Document/Manuals/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ncl.ucar.edu/Document/Manuals/</a> [12] [8]<br>
>> [7] <a href="http://www.ncl.ucar.edu/Applications/cylineq.shtml" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ncl.ucar.edu/Applications/cylineq.shtml</a> [13] [9]<br>
>> [8] <a href="http://ftp.cgd.ucar.edu" rel="noreferrer" target="_blank">http://ftp.cgd.ucar.edu</a><br>
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>> [8] <a href="http://www.ncl.ucar.edu/Document/Manuals/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ncl.ucar.edu/Document/Manuals/</a> [12]<br>
>> [9] <a href="http://www.ncl.ucar.edu/Applications/cylineq.shtml" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ncl.ucar.edu/Applications/cylineq.shtml</a> [13]<br>
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Adriana Bossolasco<br>
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