<div dir="ltr">Hi BA,<div>If I understand what you are doing, you are first averaging over the time, then you are averaging across all levels. But, you are running into memory issues when you try to read all timesteps and levels in at once. Memory limitations like this are a normal programming issue that many of us face, and the only way around it is to either run on a machine with more memory, or to rewrite your script to use less memory at a time. One idea would be to read in one level at a time like this:</div><div><br></div><div>; The below is unchecked!</div><div><br></div><div>do gg = 0,28    ; 29 levels</div><div>    if (gg.eq.0) then</div><div>       tc_avg_by_lev = a[0]->tc(0,:,:,:)</div><div>       tc_avg_by_lev = tc_avg_by_lev@_FillValue</div><div>       <div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial">       tc1_avg_by_lev = a1[0]->tc(0,:,:,:)</div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial">       tc1_avg_by_lev = tc1_avg_by_lev@_FillValue</div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial">   end if</div></div><div><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline">   <span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline">tc_avg_by_lev(gg,:,:)</span> = (/ dim_avg_n(a[:]->tc(65:,gg,:,:),0) /)</span></div><div><span style="text-align:start;text-indent:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline"><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;text-align:start;text-indent:0px;text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline">   <span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline">tc1_avg_by_lev(gg,:,:)</span><span> </span>= (/ dim_avg_n(a1[:]->tc(65:,gg,:,:),0) /)</span><br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;text-align:start;text-indent:0px;text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline">   print("Done with level "+gg)</span></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;text-align:start;text-indent:0px;text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline">end do</span></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;text-align:start;text-indent:0px;text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline"><br></span></div><div>  tc_avg = dim_avg_n_Wrap(<span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline">tc_avg_by_lev</span>,0)</div><div>  tc1_avg = dim_avg_n_Wrap(<span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline">tc1_avg_by_lev</span>,0)</div><div>  </div><div>   diff = tc_avg - tc1_avg</div><div>   diff_avg= dim_avg_n_Wrap(diff,0)</div><div>   diff_avg@description = "Temperature Difference (C)" </div><div><br></div><div>I would suggest you double check what I wrote above, and make sure you understand what the code is doing. The above might need to be altered slightly to fit your situation, but that is up to you to do.</div><div><br></div><div>If you have any further questions please respond to the ncl-talk email list.</div><div>Adam</div></span></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, May 24, 2018 at 2:34 AM, Berny Chaimite <span dir="ltr"><<a href="mailto:bchaimite@gmail.com" target="_blank">bchaimite@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><br clear="all"><div><div dir="ltr" class="m_5663919078497382641gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><b style="color:rgb(204,204,204)"> </b><b><font color="#999999" size="2" face="monospace, monospace"><span style="color:rgb(255,255,255)">-----</span></font></b></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span></span><span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span></span></span><br><div style="margin-left:80px"><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Berny A. Chaimite</font></span></span></span><br></div><span><span style="color:rgb(153,153,153)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><br><span></span></blockquote></div><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Atmospheric and Climate Sciences Student</font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Department of Physics </font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Eduardo Mondlane University</font></span></span><br></blockquote></div><div><div dir="ltr"><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><u><br>P. Contact</u>:  </font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></div></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Cell: +258 828 957 675<font size="1">(Whatsapp)</font>/846041931/<wbr>870434233 <br>Tell: +258 2145 6389<br>Institutional: </font><i><font size="2" face="monospace, monospace"><a href="mailto:berny.chaimite@uem.ac.mz" target="_blank">berny.chaimite@uem.ac.mz</a></font></i><i><font size="2" face="monospace, monospace"> </font></i></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><br>Maputo, Mozambique </font><b><font size="2" face="monospace, monospace"><br></font></b></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><blockquote></blockquote></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"></blockquote></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">---------- Forwarded message ---------<br>From: Berny Chaimite <<a href="mailto:bchaimite@gmail.com" target="_blank">bchaimite@gmail.com</a>><br>Date: segunda, 14/05/2018 à(s) 07:05<br>Subject: Re: [ncl-talk] Error: wrf_tk Unable to allocate memory<br>To:  <<a href="mailto:hallock@ucar.edu" target="_blank">hallock@ucar.edu</a>><br></div><br><br><div dir="ltr"><div><div><div><span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-" lang="en"><span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-">Good Morning!</span><br><span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-">Sorry for the delay on reply this mail. I was see if there would be any other way out of problem.</span><br><br><span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-">1) Files are not the same size.</span> <span>the files are like this (see attached).</span><br><br><span>2) For a smaller domain (d02) it showed the graph successfully (using this script wrf_tc_d02.ncl</span></span><span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-" lang="en"><span></span></span><span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-" lang="en"><span>, see attached).</span> <span>So my goal is to try to do the same for d01.</span> <span>The idea is to read and graph all of these output files.</span> <span>Reading the data in steps will not be useful to discuss my results.</span> <span>I do not know if I'm clear?</span><br><span>If you need more clarification and details you can ask me please.<br><br></span></span></div><span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-" lang="en"><span>Help me,<br><br><br><br></span></span></div><span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-" lang="en"><span>Best regards,<br></span></span></div><span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail-" lang="en"><span>BA Chaimite<br clear="all"></span></span><div><div><div><div><div dir="ltr" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><b style="color:rgb(204,204,204)"> </b><b><font color="#999999" size="2" face="monospace, monospace"><span style="color:rgb(255,255,255)">-----</span></font></b></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span></span><span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span></span></span><br><div style="margin-left:80px"><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Berny A. Chaimite</font></span></span></span><br></div><span><span style="color:rgb(153,153,153)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><br><span></span></blockquote></div><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Atmospheric and Climate Sciences Student</font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Department of Physics </font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Eduardo Mondlane University</font></span></span><br></blockquote></div><div><div dir="ltr"><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><u><br>P. Contact</u>:  </font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></div></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Cell: +258 828 957 675<font size="1">(Whatsapp)</font>/846041931/<wbr>870434233 <br>Tell: +258 2145 6389<br>Institutional: </font><i><font size="2" face="monospace, monospace"><a href="mailto:berny.chaimite@uem.ac.mz" target="_blank">berny.chaimite@uem.ac.mz</a></font></i><i><font size="2" face="monospace, monospace"> </font></i></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><br>Maputo, Mozambique </font><b><font size="2" face="monospace, monospace"><br></font></b></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><blockquote></blockquote></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Kevin Hallock <<a href="mailto:hallock@ucar.edu" target="_blank">hallock@ucar.edu</a>> escreveu no dia sexta, 11/05/2018 à(s) 01:49:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">Hi BA,<div><br></div><div>Thanks for the screenshot.<div><br></div><div>Based on that information, it does seem like you might be running out of memory on your system. In particular, the output below shows 308304800 bytes (29 * 137 * 194 * 100 time steps * 4 byte float ≈ 300 MB), but that should actually be multiplied by the number of files (308304800 * 53 = 16,340,154,400 ≈ 16 GB), assuming they’re all the same size. To add to the issue, that’s just the raw amount of memory needed to store the output array — unfortunately, in order to calculate “tc” from WRF data, NCL has to extract several other variables from your files (I believe 3 other variables are needed), with each variable consuming an additional ~16GB of memory. (Read this <a href="http://wrf-python.readthedocs.io/en/latest/basic_usage.html#memory-issues-with-wrf-all-times" target="_blank">article from our wrf-python documentation</a> for more background information on this issue.)</div><div><br></div><div>Are all of the “wrfout_oldfiles/wrfout_d01*” files the same size? You could try opening fewer files to see if that helps at all.</div><div>For example, instead of:</div><div><font face="Menlo">  f = systemfunc("ls -1 /home/bchaimite/lustre/<wbr>WRFChem/WRFV3/run/wrfout_<wbr>oldfiles/wrfout_d01*")  ; Open a file<br></font><br></div><div>try being more specific:</div><div><font face="Menlo">  f = systemfunc("ls -1 /home/bchaimite/lustre/<wbr>WRFChem/WRFV3/run/wrfout_<wbr>oldfiles/wrfout_d01_2018-05-<wbr>10*")  ; Only matches files from 2018-05-10</font></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>You may want to try iterating over each file in f and extract “tc” separately for each file. While the output array will still need to be ~16GB, the temporary arrays used for other variables should use significantly less space.</div><div><br></div><div>Something like this:</div><div><font face="Menlo">t_dims = dimsizes(a[0]->T)</font></div><div><font face="Menlo">time_steps = t_dims(0)               ; time steps per file</font></div><div><font face="Menlo">t_dims(0) = dimsizes(f) * time_steps ; multiply time steps per file by number of files</font></div><div><font face="Menlo"><br></font></div><div><font face="Menlo">t = new(t_dims, float)</font></div><div><font face="Menlo">do n=0,dimsizes(f) - 1 ; loop over each file in f</font></div><div><font face="Menlo">  ; 0:99 for first loop, 100:199 for second loop, etc</font></div><div><span style="font-family:Menlo">  t((time_steps * n):(time_steps * (n + 1) - 1),:,:,:) = wrf_user_getvar(a[n], "tc", -1)   ; could also loop over each time step, but this should be faster</span></div><div>end do</div><div><br></div><div><br></div><div>If this still causes the “fatal:wrf_tk: Unable to allocate memory for output array” error, then we might need to figure out a way of breaking the calculation into smaller steps.</div><div><br></div><div>I hope this helps,</div><div>Kevin</div><div><br></div><div><br><div><blockquote type="cite"><div>On May 9, 2018, at 7:24 PM, Berny Chaimite <<a href="mailto:bchaimite@gmail.com" target="_blank">bchaimite@gmail.com</a>> wrote:</div><br class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170Apple-interchange-newline"><div><div dir="ltr"><span style="color:rgb(153,153,153)">Variable: T (file variable)<br>Type: float<br>Total Size: 308304800 bytes<br>            77076200 values<br>Number of Dimensions: 4<br>Dimensions and sizes:   [Time | 100] x [bottom_top | 29] x [south_north | 137] x [west_east | 194]<br>Coordinates:<br>Number Of Attributes: 6<br>  FieldType :   104<br>  MemoryOrder : XYZ<br>  description : perturbation potential temperature (theta-t0)<br>  units :       K<br>  stagger :<br>  coordinates : XLONG XLAT XTIME<br><br>Variable: T (file variable)<br>Type: float<br>Total Size: 524118160 bytes<br>            131029540 values<br>Number of Dimensions: 4<br>Dimensions and sizes:   [Time | 170] x [bottom_top | 29] x [south_north | 137] x [west_east | 194]<br>Coordinates:<br>Number Of Attributes: 6<br>  FieldType :   104<br>  MemoryOrder : XYZ<br>  description : perturbation potential temperature (theta-t0)<br>  units :       K<br>  stagger :<br>  coordinates : XLONG XLAT XTIME<br>fatal:wrf_tk: Unable to allocate memory for output array<br>^Mfatal:["Execute.c":8575]:<wbr>Execute: Error occurred at or near line 1046 in file $NCARG_ROOT/lib/ncarg/<wbr>nclscripts/wrf/WRFUserARW.ncl<br><br>^Mfatal:["Execute.c":8575]:<wbr>Execute: Error occurred at or near line 48 in file plotd01_pvt.ncl</span><br><br><br clear="all"><div><div dir="ltr" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><b style="color:rgb(204,204,204)"> </b><b><font color="#999999" size="2" face="monospace, monospace"><span style="color:rgb(255,255,255)">-----</span></font></b></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span></span><span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span></span></span><br><div style="margin-left:80px"><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Berny A. Chaimite</font></span></span></span><br></div><span><span style="color:rgb(153,153,153)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><br><span></span></blockquote></div><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Atmospheric and Climate Sciences Student</font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Department of Physics </font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Eduardo Mondlane University</font></span></span><br></blockquote></div><div><div dir="ltr"><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><u><br>P. Contact</u>:  </font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></div></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Cell: +258 828 957 675<font size="1">(Whatsapp)</font>/846041931/<wbr>870434233 <br>Tell: +258 2145 6389<br>Institutional: </font><i><font size="2" face="monospace, monospace"><a href="mailto:berny.chaimite@uem.ac.mz" target="_blank">berny.chaimite@uem.ac.mz</a></font></i><i><font size="2" face="monospace, monospace"> </font></i></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><br>Maputo, Mozambique </font><b><font size="2" face="monospace, monospace"><br></font></b></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><blockquote></blockquote></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">---------- Forwarded message ---------<br>From: Berny Chaimite <<a href="mailto:bchaimite@gmail.com" target="_blank">bchaimite@gmail.com</a>><br>Date: quinta, 10/05/2018 à(s) 01:56<br>Subject: Re: [ncl-talk] Error: wrf_tk Unable to allocate memory<br>To:  <<a href="mailto:hallock@ucar.edu" target="_blank">hallock@ucar.edu</a>><br></div><br><br><div dir="ltr"><div><div>Hi,<br><span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577gmail-" lang="en"><span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577gmail-">ok I changed the line, and I send the result attached.</span></span><br><br><br><br></div>Regards,<br></div>BA Chaimite<br clear="all"><div><div><div><div><div dir="ltr" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><b style="color:rgb(204,204,204)"> </b><b><font color="#999999" size="2" face="monospace, monospace"><span style="color:rgb(255,255,255)">-----</span></font></b></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span></span><span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span></span></span><br><div style="margin-left:80px"><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Berny A. Chaimite</font></span></span></span><br></div><span><span style="color:rgb(153,153,153)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><br><span></span></blockquote></div><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Atmospheric and Climate Sciences Student</font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Department of Physics </font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Eduardo Mondlane University</font></span></span><br></blockquote></div><div><div dir="ltr"><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><u><br>P. Contact</u>:  </font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></div></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Cell: +258 828 957 675<font size="1">(Whatsapp)</font>/846041931/<wbr>870434233 <br>Tell: +258 2145 6389<br>Institutional: </font><i><font size="2" face="monospace, monospace"><a href="mailto:berny.chaimite@uem.ac.mz" target="_blank">berny.chaimite@uem.ac.mz</a></font></i><i><font size="2" face="monospace, monospace"> </font></i></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><br>Maputo, Mozambique </font><b><font size="2" face="monospace, monospace"><br></font></b></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><blockquote></blockquote></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Kevin Hallock <<a href="mailto:hallock@ucar.edu" target="_blank">hallock@ucar.edu</a>> escreveu no dia quinta, 10/05/2018 à(s) 01:24:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div>Hi BA,<div><br></div><div>Thanks for the information about the number of files.</div><div><br></div><div>Sorry, I gave you the wrong NCL commands to add… I forgot that you are using a list of files and not a single file. Could you please change those printVarSummary lines to this:</div><div><font face="Menlo">printVarSummary(a[0]->T)</font></div><div><font face="Menlo">printVarSummary(a1[0]->T)</font></div><div><br></div><div>Really, the information I’m looking for is something like this:</div><div><font face="Menlo">Variable: T (file variable)<br>Type: float<br>Total Size: 5194496 bytes<br>            1298624 values<br>Number of Dimensions: 4<br>Dimensions and sizes:<span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753Apple-tab-span" style="white-space:pre-wrap">       </span>[Time | 1] x [bottom_top | 32] x [south_north | 197] x [west_east | 206]<br></font><br></div><div>Depending on the number of files, number of time steps per file, and the sizes of bottom_top, south_north, and west_east, it’s possible that you’re running out of memory.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Kevin</div><div><br></div><div><br><div><blockquote type="cite"><div>On May 9, 2018, at 5:12 PM, Berny Chaimite <<a href="mailto:bchaimite@gmail.com" target="_blank">bchaimite@gmail.com</a>> wrote:</div><br class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753Apple-interchange-newline"><div><div dir="ltr"><div><div>Hi Kevin,<br><br></div>1) There are 53 files I try to open in <b>f</b> and <b>f1</b> are 3 files.<br><br>2) <span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753gmail-" lang="en"><span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753gmail-">I added the lines (exactly like this) that you recommended in the previous email.</span> <span>And it shows me the following:</span></span> <br><br><span style="background-color:rgb(153,153,153)"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)">fatal:(a) not reference to a valid file<br>^Mfatal:["Execute.c":8575]:<wbr>Execute: Error occurred at or near line 19 in file plotd01_pvt.ncl</span></span><br><br></span></div><span style="background-color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font>     <span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753gmail-" lang="en"><span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753gmail-">line 19 is where I added:</span></span> <span style="color:rgb(153,153,153)">printVarSummary(a->T)<br>                              <wbr>           printVarSummary(a1->T)</span></font></span><br></span><div><div><br><br></div><div><br>Regards,<br></div><div>BA Chaimite<br clear="all"></div><div><div><div><div><div dir="ltr" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><b style="color:rgb(204,204,204)"> </b><b><font color="#999999" size="2" face="monospace, monospace"><span style="color:rgb(255,255,255)">-----</span></font></b></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span></span><span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span></span></span><br><div style="margin-left:80px"><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Berny A. Chaimite</font></span></span></span><br></div><span><span style="color:rgb(153,153,153)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><br><span></span></blockquote></div><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Atmospheric and Climate Sciences Student</font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Department of Physics </font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Eduardo Mondlane University</font></span></span><br></blockquote></div><div><div dir="ltr"><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><u><br>P. Contact</u>:  </font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></div></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Cell: +258 828 957 675<font size="1">(Whatsapp)</font>/846041931/<wbr>870434233 <br>Tell: +258 2145 6389<br>Institutional: </font><i><font size="2" face="monospace, monospace"><a href="mailto:berny.chaimite@uem.ac.mz" target="_blank">berny.chaimite@uem.ac.mz</a></font></i><i><font size="2" face="monospace, monospace"> </font></i></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><br>Maputo, Mozambique </font><b><font size="2" face="monospace, monospace"><br></font></b></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><blockquote></blockquote></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Kevin Hallock <<a href="mailto:hallock@ucar.edu" target="_blank">hallock@ucar.edu</a>> escreveu no dia quarta, 9/05/2018 à(s) 18:15:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div>Hi BA,<div><br></div><div>How many files are you trying to open with this:</div><div><font face="Menlo">  f = systemfunc("ls -1 /home/bchaimite/lustre/<wbr>WRFChem/WRFV3/run/wrfout_<wbr>oldfiles/wrfout_d01*")  ; Open a file<br>  a = addfiles(f,"r")<br></font><br></div><div>Also, could you please add the following lines to your script after both instances of “addfiles” and reply with the output:</div><div><font face="Menlo">  printVarSummary(a->T)</font></div><div><div><font face="Menlo">  printVarSummary(a1->T)</font></div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Kevin</div><div><br></div><div><blockquote type="cite"><div>On May 9, 2018, at 3:10 AM, Berny Chaimite <<a href="mailto:bchaimite@gmail.com" target="_blank">bchaimite@gmail.com</a>> wrote:</div><br class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753m_7536859058215884128Apple-interchange-newline"><div><div dir="ltr"><div><div><span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753m_7536859058215884128gmail-result_box" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753m_7536859058215884128gmail-" lang="en"><span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753m_7536859058215884128gmail-">I used the attached script to generate temperature maps at different vertical levels.</span> <span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753m_7536859058215884128gmail-">They are data from simulations made with wrf.</span> <span class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753m_7536859058215884128gmail-">I used the same script to plot a smaller domain (d02) and did not give any error, now to plot d01 data shows me:</span></span><br><br>fatal:wrf_tk: Unable to allocate memory for output array<br>^Mfatal:["Execute.c":8575]:<wbr>Execute: Error occurred at or near line 1046 in file $NCARG_ROOT/lib/ncarg/<wbr>nclscripts/wrf/WRFUserARW.ncl<br><br>^Mfatal:["Execute.c":8575]:<wbr>Execute: Error occurred at or near line 46 in file plotd01_pvt.ncl<br><br><br><br><br></div>Regards,<br></div>BA Chaimite<br clear="all"><div><div><div><div dir="ltr" class="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753m_7536859058215884128gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><b style="color:rgb(204,204,204)"> </b><b><font color="#999999" size="2" face="monospace, monospace"><span style="color:rgb(255,255,255)">-----</span></font></b></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span></span><span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span></span><span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span></span></span><br><div style="margin-left:80px"><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Berny A. Chaimite</font></span></span></span><br></div><span><span style="color:rgb(153,153,153)"></span></span><span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">------------------------------<wbr>----------</font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></span><br><span></span></blockquote></div><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Atmospheric and Climate Sciences Student</font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Department of Physics </font></span></span><br><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Eduardo Mondlane University</font></span></span><br></blockquote></div><div><div dir="ltr"><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><u><br>P. Contact</u>:  </font></span></span><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"></span></span></div></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace">Cell: +258 828 957 675<font size="1">(Whatsapp)</font>/846041931/<wbr>870434233 <br>Tell: +258 2145 6389<br>Institutional: </font><i><font size="2" face="monospace, monospace"><a href="mailto:berny.chaimite@uem.ac.mz" target="_blank">berny.chaimite@uem.ac.mz</a></font></i><i><font size="2" face="monospace, monospace"> </font></i></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(153,153,153)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2" face="monospace, monospace"><br>Maputo, Mozambique </font><b><font size="2" face="monospace, monospace"><br></font></b></span></span></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><blockquote></blockquote></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:medium none;padding:0px"></blockquote></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170gmail-m_1440944037566973577m_2682272926331243753m_7536859058215884128cid:f_jgyvutyc0"><plotd01_pvt.ncl></span>_____________<wbr>______________________________<wbr>____<br>ncl-talk mailing list<br><a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu" target="_blank">ncl-talk@ucar.edu</a><br>List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br><a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/<wbr>mailman/listinfo/ncl-talk</a><br></div></blockquote></div><br></div></div></blockquote></div>
</div></blockquote></div><br></div></div></blockquote></div></div></div>
<span id="m_5663919078497382641m_-4119150253390691652m_-109772654984259170cid:f_jgzrio1e0"><Screenshot from 2018-05-10 01:52:19.png></span></div></blockquote></div><br></div></div></div></blockquote></div></div></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
ncl-talk mailing list<br>
<a href="mailto:ncl-talk@ucar.edu">ncl-talk@ucar.edu</a><br>
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
<a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/<wbr>mailman/listinfo/ncl-talk</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div><div><span><font color="#888888">Adam Phillips <br></font></span></div><span><font color="#888888">Associate Scientist,  </font></span><span><font color="#888888">Climate and Global Dynamics Laboratory, NCAR<br></font></span></div></div><div><span><font color="#888888"><a href="http://www.cgd.ucar.edu/staff/asphilli/" target="_blank">www.cgd.ucar.edu/staff/asphilli/</a>   </font></span><span><font color="#888888">303-497-1726 </font></span></div><span><font color="#888888"></font></span><div><div><span><font color="#888888"><br></font></span><div><span><font color="#888888"><a href="http://www.cgd.ucar.edu/staff/asphilli" target="_blank"></a></font></span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>