<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-size:small">Hi Lei,</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Thanks for providing the files.  I couldn&#39;t tell what the problem was, but I suggest using the fairly nwe shapefile_mask_data function instead. It makes your code simpler. This code is provided on the shapefiles examples page, but I&#39;ll attach it here, along with a modified version of your script.</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">--Mary</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Oct 27, 2014 at 11:39 AM, Lei Meng <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:dream916@gmail.com" target="_blank">dream916@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    I attached my shapefile and netcdf data file as well as the original
    ncl script. Thanks for your time on this.<br>
    <br>
    Lei<div><div class="h5"><br>
    <div>On 10/27/14, 1:17 PM, Mary Haley wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite">
      <div dir="ltr">
        <div class="gmail_default" style="font-size:small">Lei,</div>
        <div class="gmail_default" style="font-size:small"><br>
        </div>
        <div class="gmail_default" style="font-size:small">Without
          knowing anything about your data, or how the China shapefile
          is structured, I don&#39;t know why you have missing values inside
          the outline. Are you getting any errors from running this
          script?  Is the shapefile a &quot;polygon&quot; shapefile or a
          &quot;polyline&quot; shapefile? If it is a &quot;polyline&quot; shapefile, then
          you may have some areas that aren&#39;t fully enclosed, and hence
          &quot;gc_inout&quot; won&#39;t work properly.</div>
        <div class="gmail_default" style="font-size:small"><br>
        </div>
        <div class="gmail_default" style="font-size:small">It would help
          if you could also provide the &quot;total_china.shp&quot; and &quot;<a href="http://simple.nc" target="_blank">simple.nc</a>&quot;
          data files.</div>
        <div class="gmail_default" style="font-size:small"><br>
        </div>
        <div class="gmail_default" style="font-size:small">Thanks,</div>
        <div class="gmail_default" style="font-size:small"><br>
        </div>
        <div class="gmail_default" style="font-size:small">--Mary</div>
        <div class="gmail_default" style="font-size:small"><br>
        </div>
      </div>
      <div class="gmail_extra"><br>
        <div class="gmail_quote">On Fri, Oct 24, 2014 at 3:33 PM,
          dream916 <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:dream916@gmail.com" target="_blank">dream916@gmail.com</a>&gt;</span>
          wrote:<br>
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
            <div dir="ltr">Dear All,
              <div><br>
              </div>
              <div>I tried to use a China shapefile to mask out values
                outside of China for a crop dataset. I found that some
                values inside were also masked out. I attached the
                screenshot of the shapefile, a pdf file showing the
                output (top) and the original data (bottom), and my ncl
                code.  After masking, some pixels inside China were
                assigned missing value. Any suggestions? Thank you,</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>Lei</div>
            </div>
            <br>
            _______________________________________________<br>
            ncl-talk mailing list<br>
            List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
            <a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a><br>
            <br>
          </blockquote>
        </div>
        <br>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
  </div></div></div>

</blockquote></div><br></div>