<div dir="ltr">Hi Mary,<div><br></div><div>Sure, I put the data in your ftp, in incoming, it is a file with the name <b><a href="http://mda8.surfO3.EU.2000.2009.settabs_JJA.nc">mda8.surfO3.EU.2000.2009.settabs_JJA.nc</a></b></div><div><br></div><div>I am using the 6.2.0 ncl version and Debian 3.2.60-1+deb7u1 x86_64 GNU/Linux for the system.</div><div><br></div><div>Again, thanks a lot for the help.</div><div><br></div><div>Noelia</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2014-09-19 16:04 GMT+02:00 Mary Haley <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:haley@ucar.edu" target="_blank">haley@ucar.edu</a>&gt;</span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-size:small">You&#39;re right about lonFlip, sorry about that.</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Can you provide your data on our ftp so I can take a look? You can give me the information offline if you don&#39;t want to share it on ncl-talk:</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default"><a href="http://www.ncl.ucar.edu/report_bug.shtml#HowToFTP" target="_blank">http://www.ncl.ucar.edu/report_bug.shtml#HowToFTP</a><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br></font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">--Mary</div><div class="gmail_default"><br></div></font></span></div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Sep 19, 2014 at 7:59 AM, Noelia otero <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:noeli1680@gmail.com" target="_blank">noeli1680@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Mary,<div><br></div><div><div>Thanks for the suggestion  (I had the idea that lonFlip only works for global longitudes). </div><div>Unfortunately, when I try to use lonFlip, the ncl process stops and I receive the message:</div><div><br></div><div><i>(0) lonflip: longitude dimension size must be even: mlon=39</i></div><div><br></div><div>I don&#39;t understand much the message.</div><div><br></div><div>Many thanks again,</div></div><div><br></div><div>Noelia.</div></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2014-09-19 15:02 GMT+02:00 Mary Haley <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:haley@ucar.edu" target="_blank">haley@ucar.edu</a>&gt;</span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-size:small">Hi Noelia,</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Thanks for the additional information. I admit I&#39;m stumped, because it looks like you are doing everything right.</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">However, there&#39;s an easier way to fix the longitudes, using the &quot;lonFlip&quot; function. Try this code instead:</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default"><span><div class="gmail_default">;***********************************************************************</div><div class="gmail_default">load &quot;$NCARG_ROOT/lib/ncarg/nclscripts/csm/gsn_code.ncl&quot;</div><div class="gmail_default">load &quot;$NCARG_ROOT/lib/ncarg/nclscripts/csm/gsn_csm.ncl&quot;</div><div class="gmail_default">load &quot;$NCARG_ROOT/lib/ncarg/nclscripts/csm/contributed.ncl&quot;</div><div class="gmail_default">load &quot;$NCARG_ROOT/lib/ncarg/nclscripts/csm/shea_util.ncl&quot;</div><div class="gmail_default">;************************************************************************</div><div class="gmail_default">begin</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">    ozfil = addfile(&quot;/work/users/nof/data/data_new/Ozone/grid1/seasons/Europe/<a href="http://mda8.surfO3.EU.2000.2009.settabs_JJA.nc" target="_blank">mda8.surfO3.EU.2000.2009.settabs_JJA.nc</a>&quot;,&quot;r&quot;)</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">    wks = gsn_open_wks(&quot;X11&quot;,&quot;test&quot;)</div><div class="gmail_default">    ;gsn_define_colormap(wks,&quot;BlueDarkRed18&quot;)</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">    ;ozone</div><div class="gmail_default">    oz = ozfil-&gt;MDA8_SurfO3</div></span><div class="gmail_default">    oz = lonFlip(oz)</div><span><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">    res = True</div><div class="gmail_default">    res@gsnAddCyclic = False</div></span><div class="gmail_default">    res@mpMinLonF = min(oz&amp;lon)</div><div class="gmail_default">    res@mpMinLatF = min(oz&amp;lat)</div><div class="gmail_default">    res@mpMaxLonF = max(oz&amp;lon)</div><div class="gmail_default">    res@mpMaxLatF = max(oz&amp;lat)</div><span><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">    printVarSummary(oz)</div><div class="gmail_default">    printVarSummary(oz&amp;lat)</div><div class="gmail_default">    printVarSummary(oz&amp;lon)</div><div class="gmail_default">    plot = gsn_csm_contour_map(wks,oz(0,:,:),res)</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">end</div><div style="font-size:small"><br></div></span><span><font color="#888888"><div style="font-size:small">--Mary</div><div style="font-size:small"><br></div></font></span></div></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Sep 19, 2014 at 3:09 AM, Noelia otero <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:noeli1680@gmail.com" target="_blank">noeli1680@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Mary,<div><br><div>Thanks for your answer. I know that this is a common mistake, but I checked the units and the coordinates array and they seem correct to me. I only changed the longitude values, because they span from 347 to 34, so I changed it to -13 34. This is why I was reattaching all of it, is it wrong?? Otherwise, I am having problems for trying to plot between 347 and 34 lon..<br></div><div><br></div><div>The error that I get :</div><div><br></div><div><div>(0)     check_for_y_lat_coord: Warning: Data either does not contain a valid latitude coordinate array or doesn&#39;t contain one at all.</div><div>(0)     A valid latitude coordinate array should have a &#39;units&#39; attribute equal to one of the following values:</div><div>(0)         &#39;degrees_north&#39; &#39;degrees-north&#39; &#39;degree_north&#39; &#39;degrees north&#39; &#39;degrees_N&#39; &#39;Degrees_north&#39; &#39;degree_N&#39; &#39;degreeN&#39; &#39;degreesN&#39; &#39;deg north&#39;</div><div>(0)     check_for_lon_coord: Warning: Data either does not contain a valid longitude coordinate array or doesn&#39;t contain one at all.</div><div>(0)     A valid longitude coordinate array should have a &#39;units&#39; attribute equal to one of the following values:</div><div>(0)         &#39;degrees_east&#39; &#39;degrees-east&#39; &#39;degree_east&#39; &#39;degrees east&#39; &#39;degrees_E&#39; &#39;Degrees_east&#39; &#39;degree_E&#39; &#39;degreeE&#39; &#39;degreesE&#39; &#39;deg east&#39;</div></div><div><br></div><div>The script is very simple, </div><div><br></div><div>;***********************************************************************</div><div><div>load &quot;$NCARG_ROOT/lib/ncarg/nclscripts/csm/gsn_code.ncl&quot;</div><div>load &quot;$NCARG_ROOT/lib/ncarg/nclscripts/csm/gsn_csm.ncl&quot;</div><div>load &quot;$NCARG_ROOT/lib/ncarg/nclscripts/csm/contributed.ncl&quot;</div><div>load &quot;$NCARG_ROOT/lib/ncarg/nclscripts/csm/shea_util.ncl&quot;</div><div>;************************************************************************</div><div>begin</div><div><br></div><div>    ozfil = addfile(&quot;/work/users/nof/data/data_new/Ozone/grid1/seasons/Europe/<a href="http://mda8.surfO3.EU.2000.2009.settabs_JJA.nc" target="_blank">mda8.surfO3.EU.2000.2009.settabs_JJA.nc</a>&quot;,&quot;r&quot;)</div><div><br></div><div>    wks = gsn_open_wks(&quot;X11&quot;,&quot;test&quot;)</div><div>    ;gsn_define_colormap(wks,&quot;BlueDarkRed18&quot;)</div><div><br></div><div><br></div><div>    ;ozone</div><div>    oz = ozfil-&gt;MDA8_SurfO3</div><div><br></div><div>    ;change lon values -180 180</div><span><div>    lon = ozfil -&gt;lon</div><div>    lon = where((lon.gt.180).and.(lon.lt.360),lon-360,lon)</div><div>    lat = ozfil -&gt;lat</div></span><div>    oz&amp;lon = lon</div><div>   ; oz&amp;lat = lat ; it might be unnecessary</div><div><br></div><div>    res = True</div><div>    res@gsnAddCyclic = False</div><div>    res@mpMinLonF = min(lon)</div><div>    res@mpMinLatF = min(lat)</div><div>    res@mpMaxLonF = max(lon)</div><div>    res@mpMaxLatF = max(lat)</div><div><br></div><div><br></div><div>    printVarSummary(oz)</div></div><div><div>    printVarSummary(oz&amp;lat)</div><div>    printVarSummary(oz&amp;lon)</div><span><div>    plot = gsn_csm_contour_map(wks,oz(0,:,:),res)</div><div><br></div></span><div>end</div></div><div>;******************************************</div><div><br></div><div>The summary of the variables:</div><div>printVarSummary(oz):</div><div><br></div><div><div><span><div>Variable: oz</div><div>Type: double</div><div>Total Size: 13777920 bytes</div><div>            1722240 values</div><div>Number of Dimensions: 3</div><div>Dimensions and sizes:   [time | 920] x [lon | 48] x [lat | 39]</div><div>Coordinates:</div><div>            time: [20000601..20090831]</div><div>            lon: [ -13..  34]</div><div>            lat: [  34..  72]</div><div>Number Of Attributes: 2</div></span><div>  units :       parts per billion = nmol/mol</div><div>  description : Maximum daily 8-hr average (MDA8) of surface ozone (ppb) over Europe from 01/01/2000 - 12/31/2009</div><div><br></div></div></div><div>printVarSummary(lat)</div><div><div>Variable: lat (coordinate)</div><div>Type: double</div><div>Total Size: 312 bytes</div><div>            39 values</div><div>Number of Dimensions: 1</div><div>Dimensions and sizes:   [lat | 39]</div><div>Coordinates:</div><div>Number Of Attributes: 4</div><div>  axis :        Y</div><div>  units :       degrees_north</div><div>  long_name :   latitude</div><div>  standard_name :       latitude</div></div><div><br></div><div><br></div><div>printVarSummary(lon)</div><div><br></div><div><div>Variable: lon (coordinate)</div><div>Type: double</div><div>Total Size: 384 bytes</div><div>            48 values</div><div>Number of Dimensions: 1</div><div>Dimensions and sizes:   [lon | 48]</div><div>Coordinates:</div><div>Number Of Attributes: 4</div><div>  axis :        X</div><div>  units :       degrees_east</div><div>  long_name :   longitude</div><div>  standard_name :       longitude</div></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>Many thanks in advance for the support,</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div><br></div><div>Noelia.</div><div><br></div><div><br></div></div></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2014-09-19 1:07 GMT+02:00 Mary Haley <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:haley@ucar.edu" target="_blank">haley@ucar.edu</a>&gt;</span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-size:small">Noelia,</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><div class="gmail_default">When you continue to have problems with a script, it helps to include any new error messages you are getting.</div><div><br></div></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Also, your &quot;printVarSummary&quot; of &quot;oz&quot; seems to indicate that you have coordinate arrays and the appropriate metadata, so I&#39;m not sure why you are reattaching all of it.</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">Please look at your data right before you plot it, and not right before you start adding metadata to it. Also, look at your lat/lon arrays to make sure they look okay.</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">To look at your data more thoroughly, add these three lines right before you call gsn_csm_contour_plot:</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:small">printVarSummary(oz)</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><div class="gmail_default">printVarSummary(oz&amp;lat)</div><div><div class="gmail_default">printVarSummary(oz&amp;lon)</div></div><div><br></div><div>Make sure the &quot;units&quot; for the lat/lon arrays are correct, and that &quot;oz&quot; has all the correct coordinate information attached.</div><span><font color="#888888"><div><br></div></font></span></div><span><font color="#888888"><div class="gmail_default" style="font-size:small">--Mary</div><div class="gmail_default" style="font-size:small"><br></div></font></span></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Sep 18, 2014 at 12:43 PM, Noelia otero <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:noeli1680@gmail.com" target="_blank">noeli1680@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div><div>Thanks karin, but even with this setting I can&#39;t plot. I don&#39;t know if this problem might be due to the data..actually, I don&#39;t know why this warning..</div><div>Thanks again!</div></div><span><font color="#888888"><div><br></div><div>Noelia.</div></font></span></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2014-09-18 11:29 GMT+02:00 Karin Meier-Fleischer <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:meier-fleischer@dkrz.de" target="_blank">meier-fleischer@dkrz.de</a>&gt;</span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Noelia,<br>
    <br>
    maybe you have missed the setting<br>
    <br>
    <tt> oz&amp;lat = lat</tt><br>
    <br>
    Hope this helps,<br>
    Karin<br>
    <br>
    <div>Am 18.09.14 10:50, schrieb Noelia
      otero:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"><div><div>
      <div dir="ltr">Hi,
        <div><br>
        </div>
        <div>I have problems to plot one field, and although I have
          already dealt with this error, I tried to fix it now in
          different ways..but I don&#39;t know what I am missing, and I have
          no idea what I am doing wrong. The error is always:</div>
        <div><br>
        </div>
        <div><i>&quot;check_for_y_lat_coord: Warning: Data either does not
            contain a valid latitude coordinate array or doesn&#39;t contain
            one at all......&quot;</i></div>
        <div><br>
        </div>
        <div>I would appreciate any suggestion:</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>
          <div> ;Variable</div>
          <div>   oz = ozfil-&gt;MDA8_SurfO3</div>
          <div>   printVarSummary(oz)</div>
          <div> ; Summary of variable: oz </div>
          <div>  ;***Type: double</div>
          <div>        Total Size: 13777920 bytes</div>
          <div>          1722240 values</div>
          <div>          Number of Dimensions: 3</div>
          <div>          Dimensions and sizes:<span style="white-space:pre-wrap"> </span>[time | 920] x [lon | 48]
            x [lat | 39]</div>
          <div>          Coordinates: </div>
          <div>           time: [20000601..20090831]</div>
          <div>           lon: [ 347..  34]</div>
          <div>           lat: [  34..  72]</div>
          <div><br>
          </div>
          <div>    ;change lon values into -180 180</div>
          <div>    lon = ozfil -&gt;lon</div>
          <div>    lon =
            where((lon.gt.180).and.(lon.lt.360),lon-360,lon)</div>
          <div>    lat = ozfil -&gt;lat</div>
          <div>    lon@long_name = &quot;longitude&quot;</div>
          <div>    lon@units = &quot;degrees_east&quot;</div>
          <div>    lat@long_name = &quot;latitude&quot;</div>
          <div>    lat@units = &quot;degrees_north&quot;</div>
          <div>    oz&amp;lon = lon</div>
          <div>    printVarSummary(oz)</div>
          <div>  </div>
          <div>Now the summary of oz is:</div>
          <div>
            <div>Variable: oz</div>
            <div>Type: double</div>
            <div>Total Size: 13777920 bytes</div>
            <div>            1722240 values</div>
            <div>Number of Dimensions: 3</div>
            <div>Dimensions and sizes:<span style="white-space:pre-wrap"> </span>[time | 920] x [lon |
              48] x [lat | 39]</div>
            <div>Coordinates: </div>
            <div>            time: [20000601..20090831]</div>
            <div>            lon: [ -13..  34]</div>
            <div>            lat: [  34..  72]</div>
            <div>Number Of Attributes: 2</div>
          </div>
          <div><br>
          </div>
          <div>ISo,  am trying to plot:</div>
          <div>plot = gsn_csm_contour_map(wks,oz(0,:,:),res)<br>
          </div>
          <div><br>
          </div>
          <div>Any idea about how can I solve this??? </div>
        </div>
        <div>Thank you in advance,</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Cheers,</div>
        <div><br>
        </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Noelia.</div>
      </div>
      <br>
      <fieldset></fieldset>
      <br>
      </div></div><pre>_______________________________________________
ncl-talk mailing list
List instructions, subscriber options, unsubscribe:
<a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
    <pre cols="72">-- 
Dipl. Geophys. Karin Meier-Fleischer
Visualization
Application Support

Deutsches Klimarechenzentrum GmbH (DKRZ)
Bundesstrasse 45a - D20146 Hamburg - Germany

Phone:    <a href="tel:%2B49%20%280%2940%20460094%20126" value="+4940460094126" target="_blank">+49 (0)40 460094 126</a>
Fax:      <a href="tel:%2B49%20%280%2940%20460094%20270" value="+4940460094270" target="_blank">+49 (0)40 460094 270</a>
E-Mail:   <a href="mailto:meier-fleischer@dkrz.de" target="_blank">meier-fleischer@dkrz.de</a>
URL:      <a href="http://www.dkrz.de" target="_blank">www.dkrz.de</a>

Geschäftsführer: Prof. Dr. Thomas Ludwig
Sitz der Gesellschaft: Hamburg
Amtsgericht Hamburg HRB 39784
</pre>
  </div>

<br>_______________________________________________<br>
ncl-talk mailing list<br>
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
<a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
ncl-talk mailing list<br>
List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br>
<a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk" target="_blank">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>