<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<STYLE type=text/css> <!--@import url(scrollbar.css); --></STYLE>

<META content="text/html; charset=utf-8" http-equiv=Content-Type>
<STYLE>                        body{FONT-SIZE:12pt; FONT-FAMILY:宋体,serif;}                </STYLE>

<META name=GENERATOR content="MSHTML 10.00.9200.16686"><BASE target=_blank>
<STYLE type=text/css> <!--@import url(scrollbar.css); --></STYLE>

<STYLE>                        body{FONT-SIZE:12pt; FONT-FAMILY:宋体,serif;}                </STYLE>

<META name=GENERATOR content="MSHTML 10.00.9200.16686"><BASE 
target=_blank></HEAD>
<BODY 
style="BORDER-LEFT-WIDTH: 0px; BORDER-RIGHT-WIDTH: 0px; BORDER-BOTTOM-WIDTH: 0px; MARGIN: 12px; LINE-HEIGHT: 1.3; BORDER-TOP-WIDTH: 0px" 
marginheight="0" marginwidth="0">
<DIV><FONT size=2 face=Verdana></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Verdana>
<DIV><FONT color=#000000 size=3 face=宋体>Hi Dennis,</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3>&nbsp;&nbsp; I am still confused on your example and do not 
know how to caculate <A 
href="mailto:spec@coher_probability">spec@coher_probability</A>&nbsp;exactly. 
Can you tell me what is the coh, why you set it as 0.5 in your example?&nbsp; Is 
it the confidence level(0.9, 0.95, 0.99) or <A 
href="mailto:spec@coher">spec@coher</A>? What is the relationship between df and 
jave? Is df twice of jave? </FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3>&nbsp;&nbsp; Also, I found the formula </FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; B=1-p**(1/(df/2-1))&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
(1)</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3>from the reference,&nbsp;but your example is</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
&nbsp;p&nbsp;=&nbsp;1.-(1.-coh)**(df/2.-1.)&nbsp; (2)</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT size=3>&nbsp;why are they different? Is the p in (2) same as p or B 
in (1) ? Which one is the <A 
href="mailto:spec@coher_probability">spec@coher_probability</A>&nbsp;from the 
function </FONT><FONT size=2>specxy_anal<FONT size=3> in 
NCL?</FONT></FONT></DIV>
<DIV><FONT size=3></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT size=3>&nbsp;&nbsp; Thanks.</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV align=left><FONT color=#c0c0c0 size=2 face=Verdana>2013-09-19</FONT></DIV>
<DIV align=left><FONT size=2 face=Verdana>
<HR id=SignNameHR style="HEIGHT: 2px; WIDTH: 122px" align=left SIZE=2>
</FONT></DIV>
<DIV align=left><FONT color=#c0c0c0 size=2 face=Verdana><SPAN id=_FlashSignName>
<STYLE type=text/css>
body {
        font-size:12.1pt; font-family:simsun,serif;
}
</STYLE>
<!-- flashmail style begin -->
<STYLE type=text/css> <!--@import url(D:\Mail\网易\\data\scrollbar.css); -->
blockquote {
        margin-top:0; margin-bottom:0; margin-left:2em;
}
body {
        padding:0; margin:0;
}
</STYLE>
<BASE target=_blank><!-- flashmail style end -->
<META name=GENERATOR content="MSHTML 10.00.9200.16686"><STATIONERY>
<DIV>
<STYLE type=text/css>
body {
        font-size:12.1pt; font-family:simsun,serif;
}
</STYLE>
<!-- flashmail style begin -->
<STYLE type=text/css> <!--@import url(D:\Mail\网易\\data\scrollbar.css); -->
blockquote {
        margin-top:0; margin-bottom:0; margin-left:2em;
}
body {
        padding:0; margin:0;
}
</STYLE>
<BASE target=_blank><!-- flashmail style end -->
<META name=GENERATOR content="MSHTML 10.00.9200.16686"><STATIONERY>
<DIV>
<DIV>
<DIV><FONT face="Times New Roman">Xueming Zhu 朱学明<BR>Key Laboratory of Research 
on Marine Hazards Forecasting (LoMF), SOA<BR>National Marine Environmental 
Forecasting Center (NMEFC)<BR>No.8, Dahuisi Road, Haidian District, Beijing, 
100081<BR>People's Republic of 
China<BR>Tel:+86-10-82481923</FONT></DIV></DIV></DIV></STATIONERY></DIV></STATIONERY></SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Verdana>
<HR>
</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Verdana><STRONG>发件人:</STRONG>Dennis Shea 
&lt;shea@ucar.edu&gt;</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 
face=Verdana><STRONG>发送时间:</STRONG>2013-09-19&nbsp;01:13</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Verdana><STRONG>主题:</STRONG>Re: [ncl-talk] confidence 
interval/level</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 
face=Verdana><STRONG>收件人:</STRONG>"朱学明"&lt;557xiaozhu@163.com&gt;</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Verdana><STRONG>抄送:</STRONG>"ncl-talk@ucar.edu 
USERS"&lt;ncl-talk@ucar.edu&gt;</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Verdana></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Verdana>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Comments&nbsp;on&nbsp;the&nbsp;Determination&nbsp;of&nbsp;Significance&nbsp;Levels&nbsp;</DIV>
<DIV>of&nbsp;the&nbsp;Coherence&nbsp;Statistic&nbsp;</DIV>
<DIV>Paul&nbsp;Julian&nbsp;</DIV>
<DIV>Journal&nbsp;of&nbsp;the&nbsp;Atmospheric&nbsp;Sciences,&nbsp;1975&nbsp;</DIV>
<DIV>Volume&nbsp;12,&nbsp;pp836-837&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>http://journals.ametsoc.org/doi/pdf/10.1175/1520-0469%281975%29032%3C0836%3ACOTDOS%3E2.0.CO%3B2&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>eg:&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;coh&nbsp;=&nbsp;.5&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;df&nbsp;&nbsp;=&nbsp;&nbsp;6&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;p&nbsp;=&nbsp;1.-(1.-coh)**(df/2.-1.)&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;print("p="+p)&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>On&nbsp;9/18/13&nbsp;8:54&nbsp;AM,&nbsp;朱学明&nbsp;wrote:&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;Hi&nbsp;Dennis,&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;can&nbsp;you&nbsp;show&nbsp;me&nbsp;how&nbsp;does&nbsp;NCL&nbsp;caculate&nbsp;the&nbsp;spec@coher_probability?&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Thanks.&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;2013-09-18&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;朱学明&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;发件人:Dennis&nbsp;Shea&nbsp;&lt;shea@ucar.edu&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;发送时间:2013-09-18&nbsp;07:29&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;主题:Re:&nbsp;[ncl-talk]&nbsp;confidence&nbsp;interval/level&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;收件人:"朱学明"&lt;557xiaozhu@163.com&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;抄送:"ncl-talk@ucar.edu&nbsp;USERS"&lt;ncl-talk@ucar.edu&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;spec&nbsp;=&nbsp;specxy_anal(x,y,d,sm,pct)&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;PHASE&nbsp;=&nbsp;spec@phase&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;PHASE@_FillValue&nbsp;=&nbsp;1e20&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;PHASE&nbsp;=&nbsp;where(spec@coher_probability(1).le.0.95,PHASE@_FillValue,PHASE)&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;=========&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;See:&nbsp;&nbsp;http://www.ncl.ucar.edu/Applications/xy.shtml#ex25&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;The&nbsp;right&nbsp;(R)&nbsp;plot&nbsp;should&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;resR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;=&nbsp;True&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;;&nbsp;plot&nbsp;mods&nbsp;desired&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;resR@xyMarkLineModes&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;=&nbsp;"Markers"&nbsp;&nbsp;;&nbsp;choose&nbsp;which&nbsp;have&nbsp;markers&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;resR@xyMarkers&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;=&nbsp;16&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;;&nbsp;choose&nbsp;type&nbsp;of&nbsp;marker&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;resR@xyMarkerColor&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;=&nbsp;"red"&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;;&nbsp;Marker&nbsp;color&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;resR@xyMarkerSizeF&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;=&nbsp;0.005&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;;&nbsp;Marker&nbsp;size&nbsp;(default&nbsp;0.01)&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;plot&nbsp;=&nbsp;gsn_csm_xy2(wks,spec@frq,spec@coher,PHASE,resL,resR)&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&nbsp;On&nbsp;9/17/13&nbsp;4:04&nbsp;PM,&nbsp;朱学明&nbsp;wrote:&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;Hi&nbsp;all,&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;I&nbsp;have&nbsp;tried&nbsp;to&nbsp;use&nbsp;the&nbsp;function&nbsp;specxy_anal&nbsp;get&nbsp;the&nbsp;coherance&nbsp;and&nbsp;phase&nbsp;of&nbsp;two&nbsp;timeseries&nbsp;data&nbsp;based&nbsp;on&nbsp;the&nbsp;example&nbsp;script&nbsp;spec_2.ncl.&nbsp;But&nbsp;I&nbsp;just&nbsp;want&nbsp;to&nbsp;get&nbsp;the&nbsp;coherence&nbsp;and&nbsp;phase&nbsp;satisfy&nbsp;the&nbsp;0.95&nbsp;confidence&nbsp;level,&nbsp;the&nbsp;picture&nbsp;likes&nbsp;that&nbsp;in&nbsp;the&nbsp;attachment.&nbsp;How&nbsp;can&nbsp;I&nbsp;do&nbsp;that?&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;It&nbsp;looks&nbsp;like&nbsp;that&nbsp;the&nbsp;output&nbsp;of&nbsp;function&nbsp;specx_ci&nbsp;is&nbsp;not&nbsp;what&nbsp;I&nbsp;want.&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Any&nbsp;help&nbsp;would&nbsp;be&nbsp;appreciated.&nbsp;Thanks.&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;2013-09-18&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;朱学明&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;_______________________________________________&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;ncl-talk&nbsp;mailing&nbsp;list&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;List&nbsp;instructions,&nbsp;subscriber&nbsp;options,&nbsp;unsubscribe:&nbsp;</DIV>
<DIV>&gt;&gt;&nbsp;http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-talk&nbsp;</DIV></FONT></DIV></FONT></DIV></BODY></HTML>