<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">It is unclear when you are setting the environment variables.  I think you need to set them at the start of each terminal session and each batch job.  If you did this only once when you installed the binary, then they would be forgotten.  Try setting all three at the start of your batch job, before your NCL command(s).</div><div dir="ltr"><br>export NCARG_ROOT=...(My NCL path)<br>export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH</div><div dir="ltr">export LD_LIBRARY_PATH=/opt/gcc-4.6.1/lib:${LD_LIBRARY_PATH}<br><br>Watch out for quoting errors, and the third command may fail in some shells if LD_LIBRARY_PATH is previously not defined.  If needed, use "env" to check your settings.</div><div dir="ltr"><br></div><div>I am really not sure what is going on.  If you are using module commands on the supercomputer, they may interfere with these settings.  There is a copacetic way to do this, and I do not have the local insight to offer better advice.  You may also get better results if you use the most recent NCL binary versions.  This version is several years old.</div><div><br></div><div>I strongly recommend that you show this problem to your local supercomputer help desk, and ask for advice.  They are in charge of installing system libraries, and they may easily be able to advise or fix this problem.<br><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, May 14, 2020 at 5:13 AM Wen Yang via ncl-install <<a href="mailto:ncl-install@ucar.edu">ncl-install@ucar.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Thanks for your reply.</div><div>I installed the NCL manually on the supercomputer.</div><div>Here is my install procedure:</div><div>I downloaded the "ncl_ncarg-6.4.0-RHEL6.4_64bit_gnu447.tar.gz" from the NCL website. </div><div>Then extract it using the command "tar -xvf ..." and set the environment.  </div><div>"export NCARG_ROOT=...(My NCL path)<br>export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH"<br></div><div>Besides, when I use the command "which ncl_filedump", it shows the path where I installed NCL.</div><div>I tried to run NCL again on my computer. I found that when I use the management nodes, I can run NCL without error.</div><div>But if I submit the NCL by the compute nodes. It shows the error I just showed before.</div><div><br></div><div>Thanks for your help.</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, May 13, 2020 at 3:25 PM Wen Yang <<a href="mailto:wyang123@umd.edu" target="_blank">wyang123@umd.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi,<div>I was trying to run NCL by compute nodes. My system is gcc (GCC) 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-3).</div><div>But when I submit the job, it shows "<u>ncl: error while loading shared libraries: libgomp.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory</u>".</div><div>Then I use the command "<u>locate 

libgomp.so.1</u>

", there is libgomp.so.1 in my linux system.</div><div>"<u>/opt/gcc-4.6.1/lib/libgomp.so.1</u></div><u>/opt/gcc-4.6.1/lib/libgomp.so.1.0.0<br>/opt/gcc-4.6.1/lib64/libgomp.so.1<br>/opt/gcc-4.6.1/lib64/libgomp.so.1.0.0<br>/usr/lib64/libgomp.so.1<br></u><div><u>/usr/lib64/libgomp.so.1.0.0"</u></div><div>I add the path to the <span style="color:rgb(51,51,51);font-size:13.3333px"><font face="arial, sans-serif"><u>LD_LIBRARY_PATH environment.</u></font></span></div><div>"<u>export LD_LIBRARY_PATH=/opt/gcc-4.6.1/lib:${LD_LIBRARY_PATH}"</u><span style="color:rgb(51,51,51);font-size:13.3333px"><font face="arial, sans-serif"><br></font></span></div><div><span style="color:rgb(51,51,51);font-size:13.3333px"><font face="arial, sans-serif"> But it doesn't work.</font></span></div><div><span style="color:rgb(51,51,51);font-size:13.3333px"><font face="arial, sans-serif">I am using the </font></span>supercomputer, so I can't use th<font face="arial, sans-serif">e<u> </u><span style="color:rgb(51,51,51);font-size:13.3333px"><u>sudo apt-get install</u> command.</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);font-size:13.3333px">Could anyone help me with this?</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);font-size:13.3333px">Thanks,</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);font-size:13.3333px">Best,</span></font></div><div><font face="arial, sans-serif"><span style="color:rgb(51,51,51);font-size:13.3333px">Yang</span></font></div></div></blockquote></div></blockquote></div></div></div></div>