<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Glenn,<div><br></div><div>Are you actually able to run csh? &nbsp;What happens if you type "csh" on the UNIX command line?</div><div><br></div><div>Did you make any other changes to ncl_convert2nc to get it to work?</div><div><br></div><div>As a test, go back to the original "ncl_convert2nc" before you made any changes, and execute it with:</div><div><br></div><div><div>ncl_convert2nc $NCARG_ROOT/lib/ncarg/data/grb/ced1.lf00.t00z.eta.grb</div></div><div><br></div><div>Let us know what happens.</div><div><br></div><div>--Mary</div><div><br></div><div><div><div>On Jun 23, 2011, at 4:54 AM, Comiskey, Glenn wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">
<div style="WORD-WRAP: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space">
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">Thanks for the feedback, Dave &amp; 
Mary.</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011"></span></font>&nbsp;</div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">My Cygwin/X setup reports "/bin/csh -&gt; tcsh" which 
is what is used by ncl_convert2nc, i.e. #! /bin/csh -f</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">Similarly: /usr/bin/csh -&gt; tcsh</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011"></span></font>&nbsp;</div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">Having added -v -x to the hash-bang command in 
ncl_convert2nc it&nbsp;reports:</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">echo "Processing file: $ifiles_r[$n]..." if ( $?vars ) 
then</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">Badly placed ()'s</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011"></span></font>&nbsp;</div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">A grep&nbsp;of ncl_convert2nc and subsequent testing 
reveals this to be line 1573 of the 
script.</span></font></div></span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011"></span></font>&nbsp;</div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">Get the same result if call using "csh 
$NCARG_ROOT/bin/ncl_convert2nc &lt;data file&gt;" or set current shell to csh 
(default is bash).</span></font></div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011"></span></font>&nbsp;</div>
<div dir="ltr" align="left"><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"><span class="869431110-23062011">Haven't solved the problem, but currently nolonger have 
a need to convert files so will forgo any further 
investigation.</span></font></div><br>
<div dir="ltr" lang="en-us" class="OutlookMessageHeader" align="left">
<hr tabindex="-1">
<font size="2" face="Tahoma"><b>From:</b> Mary Haley [mailto:haley@ucar.edu] 
<br><b>Sent:</b> 23 June 2011 06:22<br><b>To:</b> Comiskey, Glenn<br><b>Cc:</b> 
ncl-install<br><b>Subject:</b> Re: [ncl-install] ncl_convert2nc reports 'Badly 
placed ()'s'<br></font><br></div>
<div></div>Hi Glenn, 
<div><br></div>
<div>Dave's right about this likely being a missing csh issue.</div>
<div>Please see these cygwin notes about csh:</div>
<div><a href="http://www.ncl.ucar.edu/Download/cygwin.shtml#SetUpCShell">http://www.ncl.ucar.edu/Download/cygwin.shtml#SetUpCShell</a><br></div>
<div>If you have "tcsh", then you may be able to create a soft-link as described 
in the above URL.</div>
<div>--Mary</div>
<div><br>
<div>
<div>On Jun 22, 2011, at 12:29 PM, David Brown wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline">
<blockquote type="cite">
  <div style="WORD-WRAP: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space">Hi 
  Glenn,<br>
  <div>Just as a bit of background: ncl_convert2nc is a csh (C-shell) script 
  that creates a temporary NCL script and then executes it with parameters 
  derived from the command line. &nbsp;I am not sure exactly what is wrong but I 
  suspect it is something to do the shell. &nbsp;The script is looking for 
  /bin/csh. If you execute 'which csh', does it find /bin/csh?</div>
  <div>If I explicitly use another shell to execute the script (on my mac - I 
  don't have access to a Cygwin system at the moment), e.g.:</div>
  <div>bash $NCARG_ROOT/bin/ncl_convert2nc &lt;some data file&gt;</div>
  <div>I get an error that seems related to what you are seeing:</div>
  <div>
  <div>ncl_convert2nc: line 63: onintr: command not found</div>
  <div>ncl_convert2nc: line 75: syntax error near unexpected token `('</div>
  <div>ncl_convert2nc: line 75: `set idirs = ()'</div></div>
  <div>If I instead run it using csh:</div>
  <div>csh&nbsp;&nbsp;$NCARG_ROOT/bin/ncl_convert2nc &lt;some data 
file&gt;</div>
  <div>I get no error. Maybe that will shed some light on your problem.</div>
  <div>&nbsp;-dave</div>
  <div><font color="#0000ff" size="2" face="Arial"></font><br></div>
  <div><br>
  <div>
  <div>On Jun 22, 2011, at 9:33 AM, Comiskey, Glenn wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline">
  <blockquote type="cite">
    <div>
    <div dir="ltr" align="left"><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial">Hi,</font></span></div>
    <div><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial"></font></span>&nbsp;</div>
    <div><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial">Have just 
    installed Cygwin/X and NCL Version 6.0.0 (CYGWIN), and setup the environment 
    as per the instructions for installing and running NCL under Cygwin/X 
    (Windows) (<a href="http://www.ncl.ucar.edu/Download/cygwin.shtml">http://www.ncl.ucar.edu/Download/cygwin.shtml</a>), 
    but when running ncl_convert2nc it reports 'Badly placed 
    ()'s':</font></span></div>
    <div><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial"></font></span>&nbsp;</div>
    <div><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial">$ ncl 
    -V<br>6.0.0<br></font></span><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial">$ ncl xy04n.ncl</font></span></div>
    <div><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial">&nbsp;Copyright 
    (C) 1995-2011 - All Rights Reserved<br>&nbsp;University Corporation for 
    Atmospheric Research<br>&nbsp;NCAR Command Language Version 
    6.0.0<br>&nbsp;The use of this software is governed by a License 
    Agreement.<br>&nbsp;See </font><a href="http://www.ncl.ucar.edu/"><font size="2" face="Arial">http://www.ncl.ucar.edu/</font></a><font size="2" face="Arial"> for more details.<br></font></span><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial">$ ncl_convert2nc 
    nmww3.t00z.grb&nbsp;&nbsp;&nbsp; #Note: This is a GRIB v2 file.<br>Badly 
    placed ()'s.<br></font></span><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial">$ ncl_convert2nc CentralAtlantic.wind.grib&nbsp;&nbsp; #Note: 
    This is a GRIB v1 file.<br>Badly placed ()'s.<br></font></span><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial">$ ncl_convert2nc 
    akw.t12z.grib.grib2&nbsp;&nbsp;&nbsp; #Note: This is a GRIB v2 
    file.<br>Badly placed ()'s.<span class="664473215-22062011"><font color="#0000ff">&nbsp;</font></span></font></span></div>
    <div><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial"><font color="#0000ff"></font></font></span>&nbsp;</div><font size="2" face="Arial"></font>
    <div><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial">Haven't been 
    able to find anything in mail archives or on&nbsp;<span class="664473215-22062011"><font color="#0000ff">the&nbsp;</font></span>Internet 
    to explain what the fault is.</font></span></div>
    <div><span class="580095309-22062011"><font size="2" face="Arial"></font></span>&nbsp;</div><font size="2" face="Arial"></font>
    <div align="left"><span lang="en-gb"><font size="2" face="Arial">Kind 
    regards,</font></span></div>
    <div align="left"><font size="2" face="Arial"><span lang="en-gb"></span></font>&nbsp;</div>
    <div align="left"><font size="2" face="Arial"><span lang="en-gb">Glenn 
    Comiskey</span></font></div>
    <div align="left"><font size="2" face="Arial"><span lang="en-gb">Data System 
    Administrator</span></font></div>
    <div align="left"><font color="#808080" size="1" face="Arial"><span lang="en-gb"></span></font>&nbsp;</div>
    <div align="left"><font size="2" face="Arial"><span lang="en-gb"><font color="#808080" size="1" face="Arial">Fugro Global Environment &amp; Ocean 
    Sciences</font></span></font></div>
    <div align="left"><font size="2" face="Arial"><span lang="en-gb"><font color="#808080" size="1" face="Arial">Fugro House, Hithercroft Road</font></span></font></div>
    <div align="left"><font size="2" face="Arial"><span lang="en-gb"><font color="#808080" size="1" face="Arial">Wallingford, Oxfordshire OX10 9RB, UK<br>Registration No: 
    2985431 / VAT No: GB 655475606</font></span></font></div>
    <div align="left"><font color="#808080" size="1" face="Arial"><span lang="en-gb"></span></font>&nbsp;</div>
    <div align="left"><font size="2" face="Arial"><span lang="en-gb"><font color="#808080" size="1" face="Arial">Tel: +44 (0) 1491 
    820500&nbsp;(Switchboard)&nbsp;/&nbsp;Tel: +44 (0) 1491 820559 (Direct) / 
    Fax: +44 (0) 1491 820599<br>E-mail: </font></span><a title="mailto:m.silva@geos.com" href="mailto:g.comiskey@g.comiskey@geos.com"><span lang="en-gb" title="mailto:m.silva@geos.com"><u title="mailto:m.silva@geos.com"><font title="mailto:m.silva@geos.com" color="#0000ff" size="1" face="Arial">g.comiskey@geos.com</font></u></span></a><span lang="en-gb"><font color="#808080" size="1" face="Arial"> / Website: </font></span><a title="http://www.geos.comaddress/" href="http://www.geos.com/"><span lang="en-gb" title="http://www.geos.comaddress/"><u title="http://www.geos.comaddress/"><font title="http://www.geos.comaddress/" color="#0000ff" size="1" face="Arial">www.geos.com</font></u></span></a></font></div>
    <div><font size="2" face="Arial"><font color="#808080" size="1"></font></font>&nbsp;</div>
    <div><font color="#808080" size="1" face="Arial">Please note:</font></div>
    <ul>
      <li>
      <div align="left"><font color="#808080" size="1" face="Arial">The information 
      contained in this message is privileged and confidential and intended only 
      for the use of the addresses.&nbsp; If you are not the intended recipient 
      you should not read, copy, distribute or otherwise use the 
      information;</font></div>
      </li><li>
      <div align="left"><font color="#808080" size="1" face="Arial">Fugro Global 
      Environment &amp; Ocean Sciences accepts no responsibility for loss or 
      damage of any kind arising from the use of this message;</font></div>
      </li><li>
      <div align="left"><font size="2"><font color="#808080" size="1" face="Arial">If you 
      have received this message in error, please note the sender immediately 
      and delete the message.</font><span lang="en-gb"></span></font></div><font size="2"></font><font size="2"></font></li></ul><font size="2"><font face="Arial">
    <div align="left"><br></div></font></font>
    <div>&nbsp;</div></div>_______________________________________________<br>ncl-install 
    mailing list<br>List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br><a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-install">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-install</a><br></blockquote></div><br></div></div>_______________________________________________<br>ncl-install 
  mailing list<br>List instructions, subscriber options, unsubscribe:<br><a href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-install">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/ncl-install</a><br></blockquote></div><br></div></div>
</blockquote></div><br></div></body></html>