<p><b>ringler@lanl.gov</b> 2013-03-07 14:43:23 -0700 (Thu, 07 Mar 2013)</p><p><br>
minor editing.<br>
</p><hr noshade><pre><font color="gray">Modified: trunk/documents/users_guide/ocn/test_cases/baroclinic_channel.tex
===================================================================
--- trunk/documents/users_guide/ocn/test_cases/baroclinic_channel.tex        2013-03-07 21:36:19 UTC (rev 2559)
+++ trunk/documents/users_guide/ocn/test_cases/baroclinic_channel.tex        2013-03-07 21:43:23 UTC (rev 2560)
@@ -1,25 +1,24 @@
 \section{Baroclinic Channel}
 \label{sec:baroclinic_channel_description}
 This section describes a periodic channel, that is driven by a baroclinic
-instability and a temperature gradient. This test case comes from
+instability generated via meridional temperature gradient. This test case comes from
 \cite{Ilicak_ea12om}. The domain is a planar channel that is periodic in the
-longitudinal direction. It's longitudinal extent is 160km, while it's
-latitudinal extent is 500km. The vertical depth of the domain is 1000m with a
-flat bottom. The channel is on an {\it f}-plane, with the Coriolis parameter $f
-= 1.2 \times 10^-4 s^-1$, with relates to roughly 55$^\circ$ latitude.
+longitudinal direction with no-slip boundary conditions along the north and
+south boundaries. The longitudinal extent is 160 km while the
+latitudinal extent is 500 km. The vertical depth of the domain is 1000 m with a
+flat bottom. The channel is on a {\it f}-plane, with the Coriolis parameter $f
+= 1.2 \times 10^{-4}$ $s^{-1}$.
 
-To begin, the temperature is decreasing in the vertical direction, with a
-temperature gradient in the latitudinal direction. A cosine shape with
-wavelength $x = 120km$ is used to determine the interface between north and
-south, where the gradient occurs. In addition, a baroclinic instability is
-added to the temperature gradient.
+Temperature decreases downward and in the meridional direction. A cosine shape temperature
+perturbation with a
+wavelength 120 km in the zonal direction is used to instigate the baroclinic instability. 
 
 \subsection{Provided Files}
 \label{subsec:baroclinic_channel_files}
 Three resolutions of the baroclinic channel are provided for exploration. First
-is a 10km horizontal resolution, second is a 4km horizontal resolution, and
-third is a 1km horizontal resolution. All three horizontal resolutions have 20
-vertical levels with a uniform distribution and a 50m vertical resolution.
+is a 10 km horizontal resolution, second is a 4 km horizontal resolution, and
+third is a 1 km horizontal resolution. All three horizontal resolutions have 20
+vertical levels with uniform vertical resolution of 50 m.
 
 Each resolution is provided in it's own tar file, which when extracted creates
 a &quot;run directory&quot; that is only missing the ocean\_model.exe executable.
@@ -48,10 +47,11 @@
 
 \subsection{Results}
 \label{subsecc:baroclinic_channel_results}
-Simulation results provided in this section relate only to the temperature
-field, and are created using the default namelists in each of the tar files.
+The surface temperature fields at day 10 from the 4 km and 1 km simulations are shown in Figure \ref{fig:baroclinicChannelTemperature}.
+This results should be reproduced using the default ``run\_directory'' for the 4 km and 1 km resolutions. Regarding the plotting of the results, please see Chapter \ref{chap:knownissues}.
 
 \begin{figure}[H!]
+        \label{fig:baroclinicChannelTemperature}
         \subfigure[10km horizontal resolution temperature field after 10 simulation days.]{\includegraphics[scale=0.3]{ocn/figures/baroclinic_channel_10000m_20levs_10days.pdf}}
         \subfigure[4km horizontal resolution temperature field after 10 simulation days.]{\includegraphics[scale=0.3]{ocn/figures/baroclinic_channel_4000m_20levs_10days.pdf}}
 \end{figure}

</font>
</pre>