<p><b>dwj07@fsu.edu</b> 2013-02-06 11:11:51 -0700 (Wed, 06 Feb 2013)</p><p><br>
        -- BRANCH COMMIT --<br>
<br>
        Updating document, and adding SVN_ADD_EXTERNAL_DIRECTORIES for use within the CESM.<br>
</p><hr noshade><pre><font color="gray">Added: branches/ocean_projects/generic_forcing/SVN_ADD_EXTERNAL_DIRECTORIES
===================================================================
--- branches/ocean_projects/generic_forcing/SVN_ADD_EXTERNAL_DIRECTORIES                                (rev 0)
+++ branches/ocean_projects/generic_forcing/SVN_ADD_EXTERNAL_DIRECTORIES        2013-02-06 18:11:51 UTC (rev 2446)
@@ -0,0 +1,2 @@
+models/ocn/mpas-o/src     https://svn-mpas-model.cgd.ucar.edu/branches/ocean_projects/generic_forcing/src
+models/ocn/mpas-o/bld     https://svn-mpas-model.cgd.ucar.edu/branches/ocean_projects/generic_forcing/src/ocean_cesm_driver/bld

Modified: branches/ocean_projects/generic_forcing/mpas_cesm_build_instructions.pdf
===================================================================
(Binary files differ)

Modified: branches/ocean_projects/generic_forcing/mpas_cesm_build_instructions.tex
===================================================================
--- branches/ocean_projects/generic_forcing/mpas_cesm_build_instructions.tex        2013-02-06 16:56:06 UTC (rev 2445)
+++ branches/ocean_projects/generic_forcing/mpas_cesm_build_instructions.tex        2013-02-06 18:11:51 UTC (rev 2446)
@@ -16,7 +16,10 @@
 
 \chapter{Instructions}
 
-MPAS-O currently has build options that support building within the CESM. Some minor modifications need to be made within CESM in order to support MPAS-O. This document {\bf does not} describe how to setup a run, or how to build mapping files.
+MPAS-O currently has build options that support building within the CESM. Some
+minor modifications need to be made within CESM in order to support MPAS-O.
+This document {\bf does not} describe how to setup a run, or how to build
+mapping files.
 
 To begin, the following files need to be modified within CESM
 \begin{lstlisting}
@@ -24,16 +27,41 @@
 ccsm_utils/Case.template/config_definition.xml
 \end{lstlisting}
 
-A compset needs to be defined which uses MPAS-O, and MPAS-O needs to be added to config\_definition.xml as an option for an ocn component.
+A compset needs to be defined which uses MPAS-O, and MPAS-O needs to be added
+to config\_definition.xml as an option for an ocn component.
 
-In order to checkout the source code, these lines need to be added to the SVN\_EXTERNAL\_DIRECTORIES file in the root of a CESM checkout.
+In order to have MPAS-O available within the CESM, begin by appending the
+included file SVN\_ADD\_EXTERNAL\_DIRECTORIES to the SVN\_EXTERNAL\_DIRECTORIES
+file in the root of a CESM checkout. Following this, set the svn:externals
+property to point to the newly defined file.
+
+Assuming the previously described steps are performed correctly, a case
+directory can be setup using the defined compset. After which CESM can be
+built/run as is typical.
+
+Currently, MPAS-O within the CESM assumes it's namelist file is named mpaso.in and
+resides in \$\{CASEROOT\}/run . This file defines the paths to the
+grid/output/partition files. This is provided as an input file, so after CESM
+is generating a MPAS-O namelist file it can also tell MPAS what the namelist
+file it should read is.
+
+\section{Yellowstone Files}
+All CESM specific files refer to the cesm1\_1\_1\_alpha01c tag.
+
+All required files for use on yellowstone can be seen in 
 \begin{lstlisting}
-models/ocn/mpas-o/src           https://svn-mpas-model.cgd.ucar.edu/branches/ocean_projects/generic_forcing/src
-models/ocn/mpas-o/bld           https://svn-mpas-model.cgd.ucar.edu/branches/ocean_projects/generic_forcing/src/ocean_cesm_driver/bld
+/glade/u/home/douglasj/mpas_cesm_files
 \end{lstlisting}
 
-Assuming the previously described steps are performed correctly, a case directory can be setup using the defined compset. After which CESM can be built/run as is typical.
+The mapping files are provided in 
+\begin{lstlisting}
+/glade/u/home/douglasj/T62_MAPPING
+\end{lstlisting}
 
-Currently, MPAS-O assumes all of it's namelist file is named mpaso.in and resides in \$\{CASEROOT\}/run . This file defines the paths to the grid/output/partition files.
+And the MPAS-O grid and partition files are provided in
+\begin{lstlisting}
+/glade/u/home/douglasj/mpas_files
+\end{lstlisting}
 
 \end{document}
+

</font>
</pre>