<p><b>duda</b> 2012-10-26 18:03:55 -0600 (Fri, 26 Oct 2012)</p><p>MPAS-A documentation:<br>
<br>
 - Minor updates to namelists in chapter on running the model.<br>
<br>
<br>
M    documents/atm/mpas_users_guide.tex<br>
</p><hr noshade><pre><font color="gray">Modified: trunk/documents/atm/mpas_users_guide.tex
===================================================================
--- trunk/documents/atm/mpas_users_guide.tex        2012-10-26 23:25:02 UTC (rev 2279)
+++ trunk/documents/atm/mpas_users_guide.tex        2012-10-27 00:03:55 UTC (rev 2280)
@@ -407,8 +407,11 @@
 \&amp;io\\
    config\_input\_name         = 'grid.nc'           &amp; the name of the netCDF grid file from \S2 \\
    config\_output\_name        = 'init.nc'           &amp; the name of the IC file to be created \\
-   config\_decomp\_file\_prefix = 'graph.info.part.' &amp; if running in parallel, needs to match the grid decomposition file prefix \\
 /\\
+\\
+\&amp;decomposition\\
+   config\_block\_decomp\_file\_prefix = 'graph.info.part.' &amp; if running in parallel, needs to match the grid decomposition file prefix \\
+/\\
 
 \end{longtable}
 
@@ -507,8 +510,11 @@
 \&amp;io\\
    config\_input\_name          = 'static.nc'        &amp; name of the netCDF static data file \S 3.2.1 \\
    config\_sfc\_update\_name    = 'surface.nc'       &amp; surface-update file name \\
-   config\_decomp\_file\_prefix = 'graph.info.part.' &amp; if running in parallel, needs to match the grid decomposition file prefix \\
 /\\
+\\
+\&amp;decomposition\\
+   config\_block\_decomp\_file\_prefix = 'graph.info.part.' &amp; if running in parallel, needs to match the grid decomposition file prefix \\
+/\\
 
 \end{longtable}
 
@@ -552,7 +558,7 @@
 \&amp;vertical\_grid\\
    config\_ztop            = 30000.0                 &amp; model top height (m) \\
    config\_nsmterrain      = 2                       &amp; number of smoothing passes for terrain \\
-   config\_smooth\_surfaces = .true.                 &amp; whether to smooth zeta surfaces \\
+   config\_smooth\_surfaces = .false.                 &amp; whether to smooth zeta surfaces \\
 /\\
 \\
 \&amp;preproc\_stages                                    &amp; \\
@@ -565,8 +571,11 @@
 \&amp;io\\
    config\_input\_name         = 'static.nc'         &amp; the netCDF static file \S 3.2.1 \\
    config\_output\_name        = 'init.nc'           &amp; name of the IC file to be created \\
-   config\_decomp\_file\_prefix = 'graph.info.part.' &amp; if running in parallel, needs to match the grid decomposition file prefix \\
 /\\
+\\
+\&amp;decomposition\\
+   config\_block\_decomp\_file\_prefix = 'graph.info.part.' &amp; if running in parallel, needs to match the grid decomposition file prefix \\
+/\\
 \end{longtable}
 
 
@@ -604,8 +613,11 @@
    config\_restart\_name = 'restart.nc'              &amp; the name given to restart files will that will be created (date/time will be inserted automatically) \\
    config\_output\_interval = '1\_00:00:00'          &amp; the interval to write data to the output file\\
    config\_frames\_per\_outfile = 1                  &amp; a non-negative integer; 0 specifies a single output file \\
-   config\_decomp\_file\_prefix = 'graph.info.part.' &amp; if running in parallel, must match the prefix of the graph decomposition file \\
    config\_sfc\_update\_name = 'surface.nc'          &amp; only needed if using surface updates (file from \S 3.2.2) \\
+/ 
+\\
+\&amp;decomposition                                            &amp; \\
+   config\_block\_decomp\_file\_prefix = 'graph.info.part.' &amp; if running in parallel, must match the prefix of the graph decomposition file \\
 /                                                    &amp; \\
 \\
 \&amp;restart                                            &amp; \\
@@ -869,7 +881,7 @@
 {\small
 \begin{longtable}{|p{1.75in} |p{4.5in}|}
  \hline
-   config\_decomp\_file\_prefix &amp; Prefix for mesh decomposition file </font>
<font color="blue">ewline 
+   config\_block\_decomp\_file\_prefix &amp; Prefix for mesh decomposition file </font>
<font color="gray">ewline 
    {\em Default value: 'graph.info.part.'}  \\ \hline
 
 \end{longtable}
@@ -1034,7 +1046,7 @@
 \begin{longtable}{|p{2.0in} |p{4.25in}|}
  \hline
  
-   config\_decomp\_file\_prefix &amp; Prefix of graph decomposition file, to be suffixed with the MPI task count </font>
<font color="blue">ewline 
+   config\_block\_decomp\_file\_prefix &amp; Prefix of graph decomposition file, to be suffixed with the MPI task count </font>
<font color="black">ewline 
    {\em Default value: 'graph.info.part.'} \\ \hline
 
 \end{longtable}

</font>
</pre>