<p><b>mpetersen@lanl.gov</b> 2012-05-16 14:31:21 -0600 (Wed, 16 May 2012)</p><p>Cross-section visualization tool: Improve documentation at top of matlab functions.<br>
</p><hr noshade><pre><font color="gray">Modified: branches/tools/plot_mpas_cross_sections/find_cell_sections.m
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--- branches/tools/plot_mpas_cross_sections/find_cell_sections.m        2012-05-15 19:55:24 UTC (rev 1915)
+++ branches/tools/plot_mpas_cross_sections/find_cell_sections.m        2012-05-16 20:31:21 UTC (rev 1916)
@@ -7,16 +7,16 @@
 % specified in coord.  The path is forced to travel through cells
 % that are closest to the line connecting the beginning and end
 % cells. 
-
+%
 % Mark Petersen, MPAS-Ocean Team, LANL, May 2012
-
+%
 %%%%%%%%%% input arguments %%%%%%%%%
 % The text string [wd '/' dir '/' netcdf_file ] is the file path,
 % where wd is the working directory and dir is the run directory.
 % sectionText         a cell array with text describing each section
 % coord(nSections,4)  endpoints of sections, with one section per row as
 %                     [startlat startlon endlat endlon]
-
+%
 %%%%%%%%%% output arguments %%%%%%%%%
 % sectionCellIndex(maxCells,nSections)       cell index of each section
 % nCellsInSection(nSections)                 number of cells in each section

Modified: branches/tools/plot_mpas_cross_sections/load_large_variables.m
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--- branches/tools/plot_mpas_cross_sections/load_large_variables.m        2012-05-15 19:55:24 UTC (rev 1915)
+++ branches/tools/plot_mpas_cross_sections/load_large_variables.m        2012-05-16 20:31:21 UTC (rev 1916)
@@ -3,9 +3,9 @@
     sectionCellIndex, nCellsInSection)
 
 % Load large variables from netcdf file
-
+%
 % Mark Petersen, MPAS-Ocean Team, LANL, May 2012
-
+%
 %%%%%%%%%% input arguments %%%%%%%%%
 % The text string [wd '/' dir '/' netcdf_file ] is the file path,
 % where wd is the working directory and dir is the run directory.
@@ -14,7 +14,7 @@
 % var_conv_factor    multiply each variable by this unit conversion.
 % sectionCellIndex(maxCells,nSections)       cell index of each section
 % nCellsInSection(nSections)                 number of cells in each section
-
+%
 %%%%%%%%%% output arguments %%%%%%%%%
 % sectionData(nVertLevels,max(nCellsInSection),nSections,nVars)
 %   data in each cross-section for each variable

Modified: branches/tools/plot_mpas_cross_sections/plot_mpas_cross_sections.m
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--- branches/tools/plot_mpas_cross_sections/plot_mpas_cross_sections.m        2012-05-15 19:55:24 UTC (rev 1915)
+++ branches/tools/plot_mpas_cross_sections/plot_mpas_cross_sections.m        2012-05-16 20:31:21 UTC (rev 1916)
@@ -1,8 +1,14 @@
-% script plot_mpas_cross_sections
+function plot_mpas_cross_sections
 
-% Specify data files, coordinates and text, then call functions
-% to find sections, load data, and plot cross-sections.
-
+% Plot cross-sections of MPAS fields.
+% 
+% This is the main function, where the user can specify data files,
+% coordinates and text, then call functions to find sections, load
+% data, and plot cross-sections. 
+%
+% The final product is a set of plots as jpg files, a latex file,
+% and a compiled pdf file of the plots, if desired.
+%
 % Mark Petersen, MPAS-Ocean Team, LANL, May 2012
 
 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

Modified: branches/tools/plot_mpas_cross_sections/sub_plot_cross_sections.m
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--- branches/tools/plot_mpas_cross_sections/sub_plot_cross_sections.m        2012-05-15 19:55:24 UTC (rev 1915)
+++ branches/tools/plot_mpas_cross_sections/sub_plot_cross_sections.m        2012-05-16 20:31:21 UTC (rev 1916)
@@ -2,10 +2,10 @@
    sectionCellIndex, nCellsInSection, latSection,lonSection, coord, plotDepth,...
    var_name,var_lims,fid_latex)
 
-% Plot data on cross-sections
-
+% Plot cross-sections of MPAS fields.
+%
 % Mark Petersen, MPAS-Ocean Team, LANL, May 2012
-
+%
 %%%%%%%%%% input arguments %%%%%%%%%
 % dir                text string, name of simulation
 % sectionText        a cell array with text describing each section

</font>
</pre>