<p><b>mpetersen@lanl.gov</b> 2012-02-02 09:43:04 -0700 (Thu, 02 Feb 2012)</p><p>BRANCH COMMIT<br>
<br>
Removed flags <br>
&amp;split_explicit_ts<br>
   config_SSH_from =  'avg_flux'<br>
   config_new_btr_variables_from = 'btr_avg'<br>
<br>
that were no longer needed.<br>
<br>
Removed boundary update on tracers at end.  This is no longer needed<br>
because I update on the tracer tendancy instead.<br>
</p><hr noshade><pre><font color="gray">Modified: branches/ocean_projects/ale_split_exp/src/core_ocean/Registry
===================================================================
--- branches/ocean_projects/ale_split_exp/src/core_ocean/Registry        2012-02-02 15:52:46 UTC (rev 1450)
+++ branches/ocean_projects/ale_split_exp/src/core_ocean/Registry        2012-02-02 16:43:04 UTC (rev 1451)
@@ -30,8 +30,6 @@
 namelist logical   split_explicit_ts config_u_correction true
 namelist logical   split_explicit_ts config_filter_btr_mode false
 namelist integer   split_explicit_ts config_btr_subcycle_loop_factor  2
-namelist character split_explicit_ts config_SSH_from  avg_flux
-namelist character split_explicit_ts config_new_btr_variables_from  btr_avg
 namelist real      split_explicit_ts config_btr_gam1_uWt1    0.5
 namelist real      split_explicit_ts config_btr_gam2_SSHWt1  1.0
 namelist real      split_explicit_ts config_btr_gam3_uWt2    1.0

Modified: branches/ocean_projects/ale_split_exp/src/core_ocean/mpas_ocn_time_integration_split.F
===================================================================
--- branches/ocean_projects/ale_split_exp/src/core_ocean/mpas_ocn_time_integration_split.F        2012-02-02 15:52:46 UTC (rev 1450)
+++ branches/ocean_projects/ale_split_exp/src/core_ocean/mpas_ocn_time_integration_split.F        2012-02-02 16:43:04 UTC (rev 1451)
@@ -58,7 +58,7 @@
 !  ocn_time_integration_split
 !
 !&gt; \brief MPAS ocean split explicit time integration scheme
-!&gt; \author Doug Jacobsen
+!&gt; \author Mark Petersen
 !&gt; \date   26 September 2011
 !&gt; \version SVN:$Id:$
 !&gt; \details
@@ -302,9 +302,6 @@
             ! For Split_Explicit unsplit, simply set uBtrNew=0, uBtrSubcycle=0, and uNew=uBclNew
             block % state % time_levs(2) % state % uBtr % array(:) = 0.0
 
-! mrp 120131 remove h computed from SSH in current step              
-!            block % state % time_levs(newBtrSubcycleTime) % state % uBtrSubcycle % array(:) = 0.0
-
             block % state % time_levs(2) % state % u % array(:,:)  = block % state % time_levs(2) % state % uBcl % array(:,:) 
 
             block =&gt; block % next
@@ -636,30 +633,6 @@
 
             allocate(uTemp(block % mesh % nVertLevels))
 
-!!!!!!!!!!!!!!!! do not delete this completely yet.
-!!!!!!!!! use this as a check to see if ssh from diag matches this from flux.  
-! would need to be put at the end of the loop, after the ocn diag call.
-!           if (config_SSH_from=='avg_flux') then
-!              ! Accumulate fluxes in the tend % ssh variable
-!              block % tend % ssh % array(:) = 0.0
-!              do iEdge=1,block % mesh % nEdges
-!                cell1 = block % mesh % cellsOnEdge % array(1,iEdge)
-!                cell2 = block % mesh % cellsOnEdge % array(2,iEdge)
-!                block % tend % ssh % array(cell1) = block % tend % ssh % array(cell1) &amp;
-!                    - block % state % time_levs(1) % state % FBtr % array(iEdge) &amp;
-!                    * block % mesh % dvEdge % array(iEdge)
-!                block % tend % ssh % array(cell2) = block % tend % ssh % array(cell2) &amp;
-!                    + block % state % time_levs(1) % state % FBtr % array(iEdge) &amp;
-!                    * block % mesh % dvEdge % array(iEdge)
-!              end do
-!              do iCell=1,block % mesh % nCells 
-!                ! SSHnew = SSHold + dt*(-div(Flux))
-!                block % state % time_levs(2) % state % ssh % array(iCell) = block % state % time_levs(1) % state % ssh % array(iCell) &amp; 
-!                    + dt * block % tend % ssh % array(iCell) / block % mesh % areaCell % array (iCell)
-!              end do
-!!!!!!!!!!!!!!!! END do not delete this completely yet.
-
-
             ! Correction velocity    uCorr = (Flux - Sum(h u*))/H
             ! or, for the full latex version:
             !{\bf u}^{corr} = \left( {\overline {\bf F}} 
@@ -782,28 +755,14 @@
               end do
             end do ! iCell
 
-
-! mrp 120131 remove h computed from SSH in current step              
-! this next section is probably not needed - just u^{tr} should be fine.
-            ! compute u*, the velocity for tendency terms.  Put in uNew.
-            ! uBclNew is at time n+1/2 here.
-            ! This overwrites u^{tr}, the tracer transport velocity, which was in uNew.
-            ! The following must occur after  call OcnTendScalar
-            do iEdge=1,block % mesh % nEdges
-                do k=1,block % mesh % maxLevelEdgeTop % array(iEdge)
-                       block % state % time_levs(2) % state % u % array(k,iEdge) &amp;
-                     = block % state % time_levs(2) % state % uBtr % array(iEdge) &amp;
-                     + block % state % time_levs(2) % state % uBcl % array(k,iEdge) 
-                end do
-                do k=block % mesh % maxLevelEdgeTop % array(iEdge)+1,block % mesh % nVertLevels
-                   block % state % time_levs(2) % state % u % array(k,iEdge) = 0.0
-                end do
-            end do ! iEdge
-
           ! uBclNew is u'_{n+1/2}
           ! uBtrNew is {\bar u}_{avg}
           ! uNew is u^{tr} 
 
+          ! mrp 110512  I really only need this to compute h_edge, density, pressure, and SSH
+          ! I can par this down later.
+          call ocn_diagnostic_solve(dt, block % state % time_levs(2) % state, block % mesh)
+
           !!!!!!!!!!!!!!! On last iteration: Compute all variables at time n+1
           elseif (split_explicit_step == config_n_ts_iter) then
 
@@ -850,35 +809,6 @@
           block =&gt; block % next
         end do
 
-! mrp 120131 note: need to remove halo update on tracers themselves below, but later.
-        ! Boundary update on tracers.  This is placed here, rather than 
-        ! on tend % tracers as in RK4, because I needed to update 
-        ! afterwards for the del4 diffusion operator.
-        call mpas_timer_start(&quot;se halo tracers&quot;, .false., timer_halo_tracers)
-        block =&gt; domain % blocklist
-        do while (associated(block))
-          call mpas_dmpar_exch_halo_field3d_real(domain % dminfo, block % state % time_levs(2) % state % tracers % array(:,:,:), &amp;
-              block % tend % num_tracers, block % mesh % nVertLevels, block % mesh % nCells, block % parinfo % cellsToSend, block % parinfo % cellsToRecv)
-
-
-
-          block =&gt; block % next
-        end do
-        call mpas_timer_stop(&quot;se halo tracers&quot;, timer_halo_tracers)
-
-
-        if (split_explicit_step &lt; config_n_ts_iter) then
-          ! mrp 110512  I really only need this to compute h_edge, density, pressure, and SSH
-          ! I can par this down later.
-          block =&gt; domain % blocklist
-          do while (associated(block))
-
-            call ocn_diagnostic_solve(dt, block % state % time_levs(2) % state, block % mesh)
-
-            block =&gt; block % next
-          end do
-        endif
-
       end do  ! split_explicit_step = 1, config_n_ts_iter
       !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
       ! END large iteration loop 

</font>
</pre>