<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META content="text/html; charset=gb2312" http-equiv=Content-Type>
<META name=GENERATOR content="MSHTML 8.00.6001.19154"></HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff text=#000000>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012>Hello,</SPAN></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012>I'm not sure how to say this: but I'm not sure its just 
down to DOI's to determine&nbsp;whether a data set should always be 
visible.&nbsp; I think data needs to be visible where its sufficiently important 
that a user might want to download it.&nbsp; e.g they want to check or 
extend&nbsp;someone elses study (and I think there are other reasons).&nbsp; Its 
not clear to me that all data of this kind will have a DOI - for instance how 
many of the datasets referenced in papers being written now for the summer 
deadline of AR5 have (or will have in time)&nbsp;DOIs?</SPAN></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012>I know its tempting to say - any dataset referenced in 
a paper should have a DOI.&nbsp; But I</SPAN></FONT><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial><SPAN class=078303811-10012012>&nbsp;think you need to be realistic 
about the prospects of this happening on the right 
timescales.</SPAN></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012>If the DOI is used as the determinent&nbsp;of whether 
data is always visible then should users be made aware of the risk they are 
carrying now? For instance,&nbsp;so they know to have local backups of data that 
is really important to them.&nbsp; (With the possible implication too that they 
may need to be prepared to 'reshare' this data with others.)</SPAN></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012>For what its worth my personal preference is with the 
BADC/DKRZ (and I'm sure others) philosophy of keeping all versions - though I 
realise there are costs in doing this, like getting DRSlib sufficiently bug free 
and getting it to work in all the contexts it needs to (hard links/soft links), 
getting it deployed, getting the update mechanism in place for&nbsp;when new 
bugs are found&nbsp;etc.&nbsp;&nbsp;If you used DRSlib doesn't Estanis use case 
that caused user grief become easier too - the wget scripts do not need 
regenerating, you should instead be able to replace the version strings in the 
url (though I may be assuming things about load balancing etc in saying 
this).</SPAN></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial><SPAN 
class=078303811-10012012>Jamie</SPAN></FONT></DIV><BR>
<BLOCKQUOTE 
style="BORDER-LEFT: #0000ff 2px solid; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; MARGIN-RIGHT: 0px" 
dir=ltr>
  <DIV dir=ltr lang=en-us class=OutlookMessageHeader align=left>
  <HR tabIndex=-1>
  <FONT size=2 face=Tahoma><B>From:</B> go-essp-tech-bounces@ucar.edu 
  [mailto:go-essp-tech-bounces@ucar.edu] <B>On Behalf Of </B>Estanislao 
  Gonzalez<BR><B>Sent:</B> 10 January 2012 10:21<BR><B>To:</B> Karl 
  Taylor<BR><B>Cc:</B> Drach, Bob; go-essp-tech@ucar.edu; 
  serguei.nikonov@noaa.gov<BR><B>Subject:</B> Re: [Go-essp-tech] Fwd: Re: 
  Publishing dataset with option --update<BR></FONT><BR></DIV>
  <DIV></DIV>Well to be honest I do agree this is a decision each institution 
  has to make, but for us I'd prefer offering everything we have and let the 
  systems decide what to do with this information. I.e. I've used it to generate 
  some comments (I might have already show you this), just go here: <A 
  class=moz-txt-link-freetext 
  href="http://ipcc-ar5.dkrz.de/dataset/cmip5.output1.NCC.NorESM1-M.sstClim.mon.land.Lmon.r1i1p1.html">http://ipcc-ar5.dkrz.de/dataset/cmip5.output1.NCC.NorESM1-M.sstClim.mon.land.Lmon.r1i1p1.html</A> 
  and click on history. <BR>That information could be generated only because we 
  store the metadata to the previous version. <BR><BR>By the way, The only way 
  of inhibiting the user from getting an older version, if that's what it's 
  wanted, is by either removing the files from the TDS served directory, or 
  changing the access restriction at the Gateway. Because of a well-known TDS 
  bug (or feature) files present at that directory and not found in any catalog 
  are served without any restriction (AFAIK no certificate is required for 
  this). So, normally the wget script would work even if the files where 
  unpublished.<BR><BR>It really depends on the use-case... but e.g. I had to 
  explain all this to a couple of people in the help-desk since the wget script 
  they've downloaded wasn't working anymore (files were removed). They weren't 
  thrilled to know they had to re issue the search again (there's no workaround 
  for this) and they wanted to know what was changed in the new version, and 
  there's where we can't help our users any more since we don't have that 
  information...<BR><BR>I don't know what our users prefer, but I think they 
  have more important problems to cope with at this time... if they could 
  reliably get one version they could start worrying about others. From my 
  perspective as a data manager, it's worth the tiny additional effort, if 
  there's any.<BR><BR>Cheers,<BR>Estani<BR><BR>Am 09.01.2012 20:05, schrieb Karl 
  Taylor: 
  <BLOCKQUOTE cite=mid:4F0B3A87.7080803@llnl.gov type="cite"><FONT 
    face="Times New Roman">&nbsp;Hi Estani,<BR><BR>I agree that a new version 
    number should (I'd say must) be assigned when any changes are made.&nbsp; 
    However, except for DOI datasets, most groups will not want older versions 
    to be visible or downloadable.<BR><BR>Do you 
    agree?<BR><BR>cheers,<BR>Karl<BR></FONT><BR>On 1/9/12 10:37 AM, Estanislao 
    Gonzalez wrote: 
    <BLOCKQUOTE cite=mid:4F0B3407.70009@dkrz.de type="cite">Hi Karl,<BR><BR>It 
      is indeed a good point, but I must add that we are not talking about 
      preserving a version (although we do it here at DKRZ) but of signaling 
      that a version has been changed. So the version is a key to find a 
      specific dataset which changes in time.<BR><BR>Even before a DOI 
      assignment I'd encourage all to create a new version every time the 
      dataset changes in any way. Institutions have the right to preserve 
      whatever version they want (they may even delete DOI-assigned versions, on 
      the other hand archives can't, that's why archives are for).<BR>But 
      altering the dataset preserving the version just bring chaos for the users 
      and for us at the help-desk as we have to explain why something has 
      changed (or rather answer that we don't know why...). It means that the 
      same key now points to a different dataset.<BR><BR>The only benefits I can 
      see for preserving the same version is that publishing using the same 
      version seems to be easier to some (for our workflow it's not, it's 
      exactly the same) and that if only new files are added this seems to work 
      fine for publication at both the data-node and the gateway as it's 
      properly supported.<BR>If anything else changes, this does not work as 
      expected (wrong checksums, ghost files at the gateway, etc). And changing 
      a version contents makes no sense to the user IMHO (e.g. it's as if you 
      might sometimes get more files from a tarred file... how often should you 
      extract it to be sure you got "all of them")<BR><BR>If old versions were 
      preserved (which take almost no resources if using hardlinks), a simple 
      comparison would tell that the only changes were the addition of some 
      specific files.<BR><BR>Basically, reusing the version ends in a 
      non-recoverable loss of information. That's why I discourage it.<BR><BR>My 
      2c,<BR>Estani<BR><BR>Am 09.01.2012 17:25, schrieb Karl Taylor: 
      <BLOCKQUOTE cite=mid:4F0B14EC.2020600@llnl.gov type="cite"><FONT 
        face="Times New Roman">Dear all,<BR><BR>I do not have time to read this 
        thoroughly, so perhaps what I'll mention here is irrelevant.&nbsp; There 
        may be some miscommunication about what is meant by "version".&nbsp; 
        There are two cases to consider:<BR><BR>1.&nbsp; Before a dataset has 
        become official (i.e., assigned a DOI), a group may choose to remove all 
        record of it from the database and publish a replacement 
        version.<BR><BR>2.&nbsp; Alternatively, if a group wants to preserve a 
        previous version (as&nbsp; is required after a DOI has been assigned), 
        then the new version will not "replace" the previous version, but simply 
        be added to the archive.<BR><BR>It is possible that different 
        publication procedures will apply in these different 
        cases.<BR><BR>best,<BR>Karl<BR></FONT><BR>On 1/9/12 4:26 AM, Estanislao 
        Gonzalez wrote: 
        <BLOCKQUOTE cite=mid:4F0ADCF0.1090602@dkrz.de type="cite"><PRE wrap="">Just to mentioned that we do the same thing. We use directly
--new-version and a map file containing all files for the new version,
but we do create hard-links to the files being reused, so they are
indeed all "new" as their paths always differ from those of previous
versions. (In any case for the publisher they are the same and thus
encode them with the nc_0 name if I recall correctly)

Thanks,
Estani
Am 09.01.2012 12:15, schrieb <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:stephen.pascoe@stfc.ac.uk:" moz-do-not-send="true">stephen.pascoe@stfc.ac.uk:</A>
</PRE>
          <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Bob,

This "unpublish first" requirement is news to me.  We've been publishing new versions without doing this for some time.  Now, we have come across difficulties with a few datasets but it's generally worked.

We don't use the --update option though.  Each time we publish a new version we provide a mapfile of all files in the dataset(s).  I'd recommend Sergey try doing this before removing a previous version.

If you unpublish from the Gateway first you'll loose the information in the "History" tab.  For instance <A class=moz-txt-link-freetext href="http://cmip-gw.badc.rl.ac.uk/dataset/cmip5.output2.MOHC.HadGEM2-ES.rcp85.mon.aerosol.aero.r1i1p1.html" moz-do-not-send="true">http://cmip-gw.badc.rl.ac.uk/dataset/cmip5.output2.MOHC.HadGEM2-ES.rcp85.mon.aerosol.aero.r1i1p1.html</A> shows 2 versions.

Stephen.

---
Stephen Pascoe  +44 (0)1235 445980
Centre of Environmental Data Archival
STFC Rutherford Appleton Laboratory, Harwell Oxford, Didcot OX11 0QX, UK


-----Original Message-----
From: <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:go-essp-tech-bounces@ucar.edu" moz-do-not-send="true">go-essp-tech-bounces@ucar.edu</A> [<A class=moz-txt-link-freetext href="mailto:go-essp-tech-bounces@ucar.edu" moz-do-not-send="true">mailto:go-essp-tech-bounces@ucar.edu</A>] On Behalf Of Drach, Bob
Sent: 06 January 2012 20:53
To: Serguei Nikonov; Eric Nienhouse
Cc: <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:go-essp-tech@ucar.edu" moz-do-not-send="true">go-essp-tech@ucar.edu</A>
Subject: Re: [Go-essp-tech] Fwd: Re: Publishing dataset with option --update

Hi Sergey,

When updating a dataset, it's also important to unpublish it before publishing the new version. E.g, first run

esgunpublish&lt;dataset_id&gt;

The reason is that, when you publish to the gateway, the gateway software tries to *add* the new information to the existing dataset entry, rather that replace it.

--Bob
________________________________________
From: Serguei Nikonov [<A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:serguei.nikonov@noaa.gov" moz-do-not-send="true">serguei.nikonov@noaa.gov</A>]
Sent: Friday, January 06, 2012 10:45 AM
To: Eric Nienhouse
Cc: Bob Drach; <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:go-essp-tech@ucar.edu" moz-do-not-send="true">go-essp-tech@ucar.edu</A>
Subject: Re: [Go-essp-tech] Fwd: Re:  Publishing dataset with option --update

Hi Eric,

thanks for you help. I have no any objections about any adopted versioning
policy. What I need is to know how to apply it. The ways I used did not work for
me. Hopefully, the reasons is bad things in thredds and database you pointed
put. I am cleaning them right now, then will see...

Just for clarification, if I need to update dataset (with changing version) I
create map file containing full set of files (old and new ones) and then use
this map file in esgpublish script with option --update, is it correct? Will it
be enough for creating dataset of new version? BTW, there is nothing about
version for option 'update' in esgpublish help.

Thanks,
Sergey



On 01/04/2012 04:27 PM, Eric Nienhouse wrote:
</PRE>
            <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Serguei,

Following are a few more suggestions to diagnose this publishing issue. I agree
with others on this thread that adding new files (or changing existing ones)
should always trigger a new dataset version.

It does not appear you are receiving a final "SUCCESS" or failure message when
publishing to the Gateway (with esgpublish --publish). Please try increasing
your "polling" levels in your $ESGINI file. Eg:

hessian_service_polling_delay = 10
hessian_service_polling_iterations = 500

You should see a final "SUCCESS" or "ERROR" with Java trace output at the
termination of the command.

I've reviewed the Thredds catalog for the dataset you note below:


<A class=moz-txt-link-freetext href="http://esgdata.gfdl.noaa.gov/thredds/esgcet/1/cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r1i1p1.v2.xml" moz-do-not-send="true">http://esgdata.gfdl.noaa.gov/thredds/esgcet/1/cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r1i1p1.v2.xml</A>


There appear to be multiple instances of certain files within the catalog which
is a problem. The Gateway publish will fail if a particular file (URL) is
referenced multiple times with differing metadata. An example is:


*/gfdl_dataroot/NOAA-GFDL/GFDL-CM3/historical/mon/atmos/Amon/r1i1p1/v20110601/rtmt/rtmt_Amon_GFDL-CM3_historical_r1i1p1_186001-186412.nc


This file appears as two separate file versions in the Thredds catalog (one with
id ending in ".nc" and another with ".nc_0"). There should be only one reference
to this file URL in the catalog.

The previous version of the dataset in the publisher/node database may be
leading to this issue. You may need to add "--database-delete" to your
esgunpublish command to clean things up. Bob can advise on this. Note that the
original esgpublish command shown in this email thread included "--keep-version".

After publishing to the Gateway successfully, you can check the dataset details
by URL with the published dataset identifier. For example:


<A class=moz-txt-link-freetext href="http://pcmdi3.llnl.gov/esgcet/dataset/cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r1i1p1.html" moz-do-not-send="true">http://pcmdi3.llnl.gov/esgcet/dataset/cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r1i1p1.html</A>


I hope this helps.

Regards,

-Eric

Serguei Nikonov wrote:
</PRE>
              <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Bob,

I still can not do anything about updating datasets. The commands you
suggested executed successfully but datasets did not appear on gateway. I
tried it several times for different datasets but result is the same.

Do you have any idea what to undertake in such situation.

Here it is some details about what I tried.
I needed to add file to dataset
cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r1i1p1.
As you advised I unpublished it (esgunpublish
cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r1i1p1) and then
created full mapfile (with additional file) and then publised it:
esgpublish --read-files --map new_mapfile --project cmip5 --thredd --publish

As I told there were no any errors. Dataset is in database and in thredds but
not in gateway.

The second way I tried is using mapfile containing only files to update. I
needed to substitute several existing files in dataset for new ones. I created
mapfile with only files needed to substitute:
esgscan_directory --read-files --project cmip5 -o mapfile.txt
/data/CMIP5/output1/NOAA-GFDL/GFDL-ESM2M/historical/mon/ocean/Omon/r1i1p1/v20111206

and then published it with update option:
esgpublish --update --map mapfile.txt --project cmip5 --thredd --publish.

The result is the same as in a previous case - all things are fine locally but
nothing happened on gateway.

Thanks,
Sergey

-------- Original Message --------
Subject: Re: [Go-essp-tech] Publishing dataset with option --update
Date: Thu, 29 Dec 2011 11:02:05 -0500
From: Serguei Nikonov<A class=moz-txt-link-rfc2396E href="mailto:Serguei.Nikonov@noaa.gov" moz-do-not-send="true">&lt;Serguei.Nikonov@noaa.gov&gt;</A>
Organization: GFDL
To: Drach, Bob<A class=moz-txt-link-rfc2396E href="mailto:drach1@llnl.gov" moz-do-not-send="true">&lt;drach1@llnl.gov&gt;</A>
CC: Nathan Wilhelmi<A class=moz-txt-link-rfc2396E href="mailto:wilhelmi@ucar.edu" moz-do-not-send="true">&lt;wilhelmi@ucar.edu&gt;</A>, "Ganzberger, Michael"
<A class=moz-txt-link-rfc2396E href="mailto:Ganzberger1@llnl.gov" moz-do-not-send="true">&lt;Ganzberger1@llnl.gov&gt;</A>, <A class=moz-txt-link-rfc2396E href="mailto:go-essp-tech@ucar.edu" moz-do-not-send="true">"go-essp-tech@ucar.edu"</A><A class=moz-txt-link-rfc2396E href="mailto:go-essp-tech@ucar.edu" moz-do-not-send="true">&lt;go-essp-tech@ucar.edu&gt;</A>

Hi Bob,

I tried the 1st way you suggested and it worked partially - the dataset was
created om datanode with version 2 but it was not popped up on gateway. To make
sure that it's not occasional result I repeated it with another datasets with
the same result.
Now I have 2 datasets on datanode (visible in thredds server) but they are
absent on gateway:
cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r1i1p1.v2
cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r2i1p1.v2.

Does it make sense to repeat esgpublish with 'publish' option?

Thanks and Happy New Year,
Sergey

On 12/21/2011 08:41 PM, Drach, Bob wrote:
</PRE>
                <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Sergey,

The way I would recommend adding new files to an existing dataset is as
follows:

- Unpublish the previous dataset from the gateway and thredds

% esgunpublish
cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r1i1p1

- Add the new files to the existing mapfile for the dataset they are being
added to.

- Republish with the expanded mapfile:

% esgpublish --read-files --map newmap.txt --project cmip5 --thredds
--publish

The publisher will:
- not rescan existing files, only the new files
- create a new version to reflect the additional files


Alternatively you can create a mapfile with *only* the new files (Using
esgscan_directory), then republish using the --update command.

--Bob


On 12/21/11 8:40 AM, "Serguei Nikonov"<A class=moz-txt-link-rfc2396E href="mailto:serguei.nikonov@noaa.gov" moz-do-not-send="true">&lt;serguei.nikonov@noaa.gov&gt;</A>  wrote:

</PRE>
                  <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Nate,

unfortunately this is not the only dataset I have a problem - there are at
least
5 more. Should I unpublish them locally (db, thredds) and than create new
version containing full set of files? What is the official way to update
dataset?

Thanks,
Sergey


On 12/20/2011 07:06 PM, Nathan Wilhelmi wrote:
</PRE>
                    <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Bob/Mike,

I believe the problem is that when files were added the timestamp on the
dataset
wasn't updated.

The triple store will only harvest datasets that have files and an updated
timestamp after the last harvest.

So what likely happened is the dataset was created without files, so it
wasn't
initially harvested. Files were subsequently added, but the timestamp wasn't
updated, so it was still not a candidate for harvesting.

Can you update the date_updated timestamp for the dataset in question and
then
trigger the RDF harvesting, I believe the dataset will show up then.

Thanks!
-Nate

On 12/20/2011 11:49 AM, Serguei Nikonov wrote:
</PRE>
                      <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Mike,

I am a member of data publishers group. I have been publishing considerable
amount of data without such kind of troubles but this one occurred only when
I
tried to add some files to existing dataset. Publishing from scratch works
fine
for me.

Thanks,
Sergey

On 12/20/2011 01:29 PM, Ganzberger, Michael wrote:
</PRE>
                        <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Serguei,

That task is on a scheduler and will re-run every 10 minutes. If your data
does not appear after that time then perhaps there is another issue. One
issue could be that publishing to the gateway requires that you have the
role
of "Data Publisher";

"check that the account is member of the proper group and has the special
role of Data Publisher"

<A class=moz-txt-link-freetext href="http://esgf.org/wiki/ESGFNode/FAQ" moz-do-not-send="true">http://esgf.org/wiki/ESGFNode/FAQ</A>

Mike


-----Original Message-----
From: Serguei Nikonov [<A class=moz-txt-link-freetext href="mailto:serguei.nikonov@noaa.gov" moz-do-not-send="true">mailto:serguei.nikonov@noaa.gov</A>]
Sent: Tuesday, December 20, 2011 10:12 AM
To: Ganzberger, Michael
Cc: St§ªphane Senesi; Drach, Bob; <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:go-essp-tech@ucar.edu" moz-do-not-send="true">go-essp-tech@ucar.edu</A>
Subject: Re: [Go-essp-tech] Publishing dataset with option --update

Hi Mike,

thansk for suggestion but I don't have any privileges to do anything on
gateway.
I am just publishing data on GFDL data node.

Regards,
Sergey

On 12/20/2011 01:05 PM, Ganzberger, Michael wrote:
</PRE>
                          <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Serguei,

I'd like to suggest this that may help you from
<A class=moz-txt-link-freetext href="http://esgf.org/wiki/Cmip5Gateway/FAQ" moz-do-not-send="true">http://esgf.org/wiki/Cmip5Gateway/FAQ</A>



"The search does not reflect the latest DB changes I've made

You have to manually trigger the 3store harvesting. Logging as root and go
to Admin-&gt;"Gateway Scheduled Tasks"-&gt;"Run tasks" and restart the job named
RDFSynchronizationJobDetail"

Mike Ganzberger





-----Original Message-----
From: <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:go-essp-tech-bounces@ucar.edu" moz-do-not-send="true">go-essp-tech-bounces@ucar.edu</A> [<A class=moz-txt-link-freetext href="mailto:go-essp-tech-bounces@ucar.edu" moz-do-not-send="true">mailto:go-essp-tech-bounces@ucar.edu</A>]
On Behalf Of St§ªphane Senesi
Sent: Tuesday, December 20, 2011 9:42 AM
To: Serguei Nikonov
Cc: Drach, Bob; <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:go-essp-tech@ucar.edu" moz-do-not-send="true">go-essp-tech@ucar.edu</A>
Subject: Re: [Go-essp-tech] Publishing dataset with option --update

Serguei

We have for some time now experienced similar problems when publishing
to the PCMDI gateway, i.e. not getting a "SUCCESS" message when
publishing . Sometimes, files are actually published (or at least
accessible through the gateway, their status being actually
"START_PUBLISHING", after esg_list_datasets report) , sometimes not. An
hypothesis is that the PCMDI Gateway load do generate the problem. We
havn't yet got a confirmation by Bob.

In contrast to your case, this happens when publishing a dataset from
scratch (I mean, not an update)

Best regards (do not expect any feeback from me since early january, yet)

S


Serguei Nikonov wrote, On 20/12/2011 18:11:
</PRE>
                            <BLOCKQUOTE type="cite"><PRE wrap="">Hi Bob,

I needed to add some missed variables to existing dataset and I found in
esgpublish command an option --update. When I tried it I've got normal
message like
INFO 2011-12-20 11:21:00,893 Publishing:
cmip5.output1.NOAA-GFDL.GFDL-CM3.historical.mon.atmos.Amon.r1i1p1, parent
=
pcmdi.GFDL
INFO 2011-12-20 11:21:07,564 Result: PROCESSING
INFO 2011-12-20 11:21:11,209 Result: PROCESSING
....

but nothing happened on gateway - new variables are not there. The files
corresponding to these variables are in database and in THREDDS catalog
but
apparently were not published on gateway.

I used command line
esgpublish --update --keep-version --map&lt;map_file&gt;  --project cmip5
--noscan
--publish.

Should map file be of some specific format to make it works in mode I
need?

Thanks,
Sergey Nikonov
GFDL


_______________________________________________
GO-ESSP-TECH mailing list
<A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:GO-ESSP-TECH@ucar.edu" moz-do-not-send="true">GO-ESSP-TECH@ucar.edu</A>
<A class=moz-txt-link-freetext href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech" moz-do-not-send="true">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech</A>


</PRE></BLOCKQUOTE></BLOCKQUOTE></BLOCKQUOTE><PRE wrap="">_______________________________________________
GO-ESSP-TECH mailing list
<A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:GO-ESSP-TECH@ucar.edu" moz-do-not-send="true">GO-ESSP-TECH@ucar.edu</A>
<A class=moz-txt-link-freetext href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech" moz-do-not-send="true">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech</A>
</PRE></BLOCKQUOTE></BLOCKQUOTE></BLOCKQUOTE></BLOCKQUOTE><PRE wrap="">_______________________________________________
GO-ESSP-TECH mailing list
<A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:GO-ESSP-TECH@ucar.edu" moz-do-not-send="true">GO-ESSP-TECH@ucar.edu</A>
<A class=moz-txt-link-freetext href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech" moz-do-not-send="true">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech</A>
</PRE></BLOCKQUOTE></BLOCKQUOTE><PRE wrap="">_______________________________________________
GO-ESSP-TECH mailing list
<A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:GO-ESSP-TECH@ucar.edu" moz-do-not-send="true">GO-ESSP-TECH@ucar.edu</A>
<A class=moz-txt-link-freetext href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech" moz-do-not-send="true">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech</A>
</PRE></BLOCKQUOTE><PRE wrap="">--
Estanislao Gonzalez

Max-Planck-Institut f¨¹r Meteorologie (MPI-M)
Deutsches Klimarechenzentrum (DKRZ) - German Climate Computing Centre
Room 108 - Bundesstrasse 45a, D-20146 Hamburg, Germany

Phone:   +49 (40) 46 00 94-126
E-Mail:  <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:gonzalez@dkrz.de" moz-do-not-send="true">gonzalez@dkrz.de</A>

_______________________________________________
GO-ESSP-TECH mailing list
<A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:GO-ESSP-TECH@ucar.edu" moz-do-not-send="true">GO-ESSP-TECH@ucar.edu</A>
<A class=moz-txt-link-freetext href="http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech" moz-do-not-send="true">http://mailman.ucar.edu/mailman/listinfo/go-essp-tech</A>
</PRE></BLOCKQUOTE></BLOCKQUOTE><BR><BR><PRE class=moz-signature cols="72">-- 
Estanislao Gonzalez

Max-Planck-Institut f¨¹r Meteorologie (MPI-M)
Deutsches Klimarechenzentrum (DKRZ) - German Climate Computing Centre
Room 108 - Bundesstrasse 45a, D-20146 Hamburg, Germany

Phone:   +49 (40) 46 00 94-126
E-Mail:  <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:gonzalez@dkrz.de" moz-do-not-send="true">gonzalez@dkrz.de</A> </PRE></BLOCKQUOTE></BLOCKQUOTE><BR><BR><PRE class=moz-signature cols="72">-- 
Estanislao Gonzalez

Max-Planck-Institut f¨¹r Meteorologie (MPI-M)
Deutsches Klimarechenzentrum (DKRZ) - German Climate Computing Centre
Room 108 - Bundesstrasse 45a, D-20146 Hamburg, Germany

Phone:   +49 (40) 46 00 94-126
E-Mail:  <A class=moz-txt-link-abbreviated href="mailto:gonzalez@dkrz.de">gonzalez@dkrz.de</A> </PRE></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>