<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Hi Phillip,<br>
    <br>
    As far as the filen name goes, the same could be said for all
    "fixed" field, they're likely to be the same across experiments
    (sftlf/orog/etc...). But we're "trying" to get as close as possible
    from the DRS....<br>
    <br>
    C.<br>
    <br>
    <br>
    On 10/22/10 7:31 AM, Bentley, Philip wrote:
    <blockquote
cite="mid:E51EDFEBF10BE44BB4BDAF5FC2F024B90363649D@EXXMAIL02.desktop.frd.metoffice.com"
      type="cite">
      <title></title>
      <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
        http-equiv="Content-Type">
      <meta name="GENERATOR" content="MSHTML 8.00.6001.18939">
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">Hi Karl,</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">A somewhat belated
            follow-up question in connection with this proposal (and
            with some slight overlap with Jamie's email which crossed on
            the ether)...</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">As things stand the
            files named in the 'associated_files' attribute appear thus
            (using our RCP 4.5 simulation as an example):</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">"... gridspecFile:
            gridspec_fx_HadGEM2-ES_rcp45_r0i0p0.nc areacella:
            areacella_fx_HadGEM2-ES_rcp45_r0i0p0.nc"</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">Are the
            &lt;expt_id&gt;_&lt;rip&gt; parts (i.e.&nbsp; 'rcp45_r0i0p0.nc' )
            actually required? AFAIK, our gridspec/cellarea files will
            not change from one simulation to the next using the same
            model (HadGEM2-ES in this case).</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">Since, like most
            centers,&nbsp;we will be running large numbers of simulations
            using the same model, it looks like we would need to create
            numerous duplicates of the gridspec/cellarea files - or lots
            of symlinks - in order to for these references to make
            sense. Unless you are planning to manage that on our behalf
            somehow...?</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">I think our 4
            gridspec files for the HadGEM2 atm grids are likely to be
            called something like...</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">gridspec_fx_HadGEM2-ES_atm_pgrid.nc&nbsp;
          </font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">gridspec_fx_HadGEM2-ES_atm_ugrid.nc
          </font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">gridspec_fx_HadGEM2-ES_atm_vgrid.nc
          </font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">gridspec_fx_HadGEM2-ES_atm_uvgrid.nc
          </font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">So&nbsp;without
            any&nbsp;simulation-specific info. (There would also be files for
            the ocean grids)</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">As it happens the
            gridspec files contain grid cell areas, so I'm now wondering
            if we'd even supply both?</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">I'd be interested to
            hear your thoughts on this. I may be mis-understanding
            something/everything :-)</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">Regards</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"><font
            color="#0000ff" face="Tahoma" size="2">Phil</font></span></div>
      <div dir="ltr" align="left"><span class="216420714-22102010"></span>&nbsp;</div>
      <br>
      <blockquote style="border-left: 2px solid rgb(0, 0, 255);
        padding-left: 5px; margin-left: 5px; margin-right: 0px;">
        <div dir="ltr" class="OutlookMessageHeader" align="left"
          lang="en-us">
          <hr tabindex="-1"> <font face="Tahoma" size="2"><b>From:</b>
            Karl Taylor [<a class="moz-txt-link-freetext" href="mailto:taylor13@llnl.gov">mailto:taylor13@llnl.gov</a>] <br>
            <b>Sent:</b> 19 October 2010 18:36<br>
            <b>To:</b> <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:martin.juckes@stfc.ac.uk">martin.juckes@stfc.ac.uk</a><br>
            <b>Cc:</b> Bentley, Philip; Doutriaux, Charles;
            Kettleborough, Jamie; Bryan Lawrence; <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:cmor@lists.llnl.gov">cmor@lists.llnl.gov</a>;
            <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:go-essp-tech@ucar.edu">go-essp-tech@ucar.edu</a>; <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Kyle.Olivo@noaa.gov">Kyle.Olivo@noaa.gov</a><br>
            <b>Subject:</b> CMOR and cell_measures issues<br>
          </font><br>
        </div>
        <font face="Times New Roman">Dear CMOR users,</font><br>
        <br>
        It has been brought to our attention that the CF checker (which
        is different from the CMOR checker) traps an error in
        CMOR-produced files indicating non-compliance with the CF
        conventions.&nbsp; The error is that the cell_measures attribute is
        defined, but the area and/or volume data is not contained in the
        file.&nbsp; [We have included a non-CF attribute called
        "associated_files" that points to the files containing
        area/volume.]&nbsp; Still, in order to not confuse CF-compliant
        software we plan to immediately release a new version of CMOR in
        which the "cell_measures" attribute is replaced by a non-CF
        attribute named "ext_cell_measures" (indicating that the
        area/volume data is externally available).<br>
        <br>
        Also, some groups have reported that not all their variables are
        carried on the same grid.&nbsp; (For example, sometimes the u and v
        fields are staggered relative to T.)&nbsp; In this case it would be
        necessary to have more than one set of areas associated with the
        model, and this is not currently possible since only areacella,
        areacello, and volcello are defined in the CMIP5 request for
        model output.&nbsp; We have therefore decided to include an option
        for CMOR users to suppress writing of the ext_cell_measures
        attribute when it would point to areacella or areacello
        incorrectly.&nbsp; The user would in effect be allowed one set of
        areas to be associated with the atmospheric model and one set of
        areas/volumes to be associated with the ocean models.&nbsp; The user
        would suppress the ext_cell_measures attribute (and areacella,
        areacello, volcello would not appear in the "associated_files"
        attribute) for any variables where these areas/volumes would be
        incorrect.<br>
        <br>
        We hope this is acceptable.<br>
        <br>
        Best regards,<br>
        Karl and Charles<br>
        <br>
        <br>
      </blockquote>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>